灌流色譜(perfusion chromatography)所采用的固定相中存在兩種孔結構:一種是孔徑在600~800mm范圍內的特大孔,稱為通孔或穿透孔( through pore);另一種是孔徑在50~150m范圍內連接特大孔的較小的孔,稱為擴散孔( diffusive pore)。貫通的大孔可以允許流動相直接進入固定相顆粒的內部并貫穿而過。
灌流色譜柱可以同時具有高流速、高效率、高樣品負載量和低操作壓力的特點。基于灌流色譜固定相的分離模式在生物大分子分離上表現出獨特的優勢。