絲氨酸蛋白酶(或絲氨酸內肽酶)是酶的是切割肽鍵在蛋白質,其中絲氨酸作為親核氨基酸在(酶的)活性位點。
它們普遍存在于真核生物和原核生物中。絲氨酸蛋白酶根據其結構分為兩大類:胰凝乳蛋白酶樣(胰蛋白酶樣)或枯草桿菌蛋白酶樣。