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  • 發布時間:2022-05-16 15:01 原文鏈接: PTMab直播預告|組蛋白新型酰化修飾ChIP介紹

    基因組信息以染色質的形式存儲在細胞核中,147bp DNA 纏繞組蛋白八聚體形成染色質最小單元核小體。核心組蛋白的柔性 N 末端以及球狀核心結構域存在大量共價修飾,如乙酰化、甲基化和磷酸化等。組蛋白賴氨酸乙酰化中和了賴氨酸的正電荷,削弱了組蛋白和DNA的相互作用,從而形成更開放的染色質狀態,更高的DNA可及性促進轉錄因子結合,增強轉錄活性。轉錄起始位點(Transcription start site,TSS)的組蛋白乙酰化信號與基因表達呈正相關。異常乙酰化與癌癥發展、神經系統疾病以及代謝疾病有關。

    質譜技術的發展使得組蛋白賴氨酸上的新型酰化修飾類型和位點不斷被發現。這些修飾包括 2-羥基異丁酰化 (Khib)、β-羥基丁酰化(Kbhb)、苯甲酰化 (Kbz)、丁酰化(Kbu)、巴豆酰化 (Kcr)、 戊二酰化 (Kglu)、 乳酰化 (Kla)、丙二酰化 (Kma)、丙酰化(Kpr) 和琥珀酰化 (Ksucc) 等等。由于這些修飾所需的酰基輔酶A來源于不同的代謝途徑,特定的組蛋白酰化修飾可以作為細胞代謝狀態的傳感器,并根據細胞需要微調染色質結構,從而調控基因表達。

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    新型酰化修飾ChIP的應用場景介紹

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