凡小兒長期腹瀉、腹痛、一般治療難于根治者，應考慮本病，做下列檢查以協診斷。
糞便檢查
在于糞便中找到滋養體和包囊可確診，光鏡下新鮮稀薄便中可找到滋養體。在成形便中須用碘液染色才能找到包囊。由于包囊的形成具有間歇性，應隔日檢查糞便，連續3次以上。
十二指腸引流液檢查
如多次檢查糞便均為陰性，臨床上又不能排除本病者，可作十二指腸引流，在引流液中尋找滋養體。
酶聯免疫吸附試驗
用于檢查血清中賈弟蟲抗體，特異性及敏感性均較高，快速方便，陽性率＞92％。
