1、支氣管肺癌 肺癌患者以老年人多見，多有長期吸煙的歷史。肺癌淋巴結轉移時可出現壓迫癥狀，如上腔靜脈壓迫綜合癥，大氣管壓迫的吸氣性呼吸困難或喘鳴，胸痛明顯。而原發型肺結核多為中青年人，有結核病的中毒癥狀，常侵及支氣管，形成支氣管結核，甚至穿孔形成淋巴結支氣管瘺，可通過病理檢查獲得診斷結果。
2、何杰金氏淋巴瘤 是淋巴系統惡性腫瘤，常有淋巴結腫大，若首先表現為縱隔和肺門者，常需與支氣管淋巴結結核鑒別，淋巴結結核常位于肺門，少數在氣管前和右側氣管旁。淋巴瘤生長較快，多有壓迫癥狀，壓迫氣管常有氣短癥狀，壓迫上腔靜脈常有頭面部、胸部及上肢水腫、頸靜脈怒張，而淋巴結結核相對少見。纖維支氣管鏡檢查對兩者也有鑒別價值，淋巴結結核常可見支氣管內膜結核或支氣管穿孔，而淋巴瘤支氣管內病變極為罕見。淋巴瘤多伴有脾大、貧血，發熱為波浪熱，而結核多為低熱，伴脾結核者少見。
3、結節病 臨床常與結核相混淆，結節病以40歲以上女性多見， X線表現多為雙側肺門淋巴結腫大或縱隔伴雙肺門淋巴結腫大，單純縱隔淋巴結腫大者較少，多需病理證實。病理表現為無干酪性壞死上皮樣細胞及肉芽組織。
4、硅沉著病 硅沉著病又稱為矽肺，常引起雙側肺門對稱性增大，以支氣管淋巴結腫大為明顯，偶爾可在其周圍發生鈣化如“蛋殼樣鈣化”的淋巴結，對診斷有幫助，但此病明顯改變為可見多發的矽肺結節病灶。密切的矽塵接觸史為重要的診斷依據。