MMF與azathioprine和cyclosporin相比，最大的優點是無明顯的肝腎毒性。常見不良反應有胃腸道反應，表現為惡心、嘔吐、腹瀉、腹痛等，通過調整劑量即可減輕；貧血和白細胞減少，多為輕度，通常發生在30～120d，大部分病例在停藥一周后可得到緩解；機會感染輕度增加；可能誘發腫瘤。動物試驗證明MMF有致畸作用，而且MMF可分泌到乳汁中，因而育齡婦女應用時要注意避孕。
