來自紀念斯隆-凱特琳癌癥中心的研究人員,與德國的合作者們一起,開發出了一種在多細胞環境中鑒別胞內蛋白及分泌蛋白來源細胞的新方法。該研究在線發布在6月30日的《自然方法》(Nature Methods)雜志上。
多細胞環境的形成及維持有賴于廣泛的細胞間相互通訊。細胞相互作用調控失常在包括癌癥在內的許多疾病中起重要作用。盡管抗體分析被廣泛應用于細胞內信號轉導研究中,但這種方法相對低通量,特異性差異大,且需要預先選擇蛋白質讀數。盡管以定量質譜為基礎的蛋白質組學克服了其中的一些限制,由于無法區分多細胞培養物中來自不同細胞類型的蛋白質,用質譜法進行細胞通訊研究受到阻礙。
研究人員開發了一種稱作為CTAP的細胞選擇性蛋白質組學新技術,是基于脊椎細胞無法合成生長及維持穩態通常所需的一些“必需”氨基酸這一事實。這些氨基酸可由某些植物、細菌和低等真核生物生成,被添加到培養脊椎動物細胞培養基中,動物需通過飲食來獲取它們。
Gauthier、Miller和合作者們操控細胞表達一些氨基酸生物合成酶,這使得細胞能夠利用添加的氨基酸前體來生成必需氨基酸,滿足自身生長需要。
研究小組證實,通過添加重穩定同位素標記的氨基酸前體,可導致重同位素標記氨基酸摻入到酶表達細胞生成的蛋白質中。利用定量質譜搜索包含這些穩定同位素標記的蛋白質,研究人員能夠確定多細胞培養物中胞內蛋白質和分泌蛋白質的來源細胞。
這一技術突破為研究人員提供了一個綜合繪制細胞通訊圖譜的新工具,細胞之間相互通訊對于癌癥形成、維持及治療反應各個方面均至關重要。例如,利用這一方法研究人員可以研究正常細胞和惡性細胞之間的細胞信號傳導事件,從而更好地了解周圍正常細胞改變腫瘤生長以及治療反應的分子機制。
由于能將蛋白質與特殊細胞類型直接關聯起來,研究人員認為這一方法將能夠適用于研究細胞間的通訊及發現生物標記物。
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