2013年12月8日,由首都醫科大學附屬北京朝陽醫院、AB
SCIEX公司主辦的第四十期質譜沙龍活動在北京朝陽醫院順利舉辦,來自北京師范大學、北京朝陽醫院、中科院微生物所、空軍總醫院的百余名專家學者齊聚一堂共同參加了此次沙龍活動,分析測試百科網作為支持媒體對質譜沙龍活動進行長期報道。
沙龍期間,來自北京師范大學何大澄教授為我們帶來了題為《從蛋白質組學到細胞生物學及其研究策略》的報告。何教授首先指出蛋白質組學已經成為細胞生物學的基礎,同時蛋白質組學具有明顯的技術性和資料積累性;在談到蛋白質研究策略中何大澄教授指出,不同策略導致同樣技術達成不同的結論和價值,同時海量數據并不能自然轉化為知識或智慧。蛋白質組是基因組的邏輯延伸,但研究策略是不同的,報告中何大澄教授介紹了四點關于蛋白質組學的研究策略:
1、以理解細胞內生命活動為出發點和目標的研究策略;
2、探尋蛋白質相互作用和調控的網絡關系的研究策略;
3、高度重視動態研究及其策略。蛋白質組學已經成為細胞生物學的基礎,動態和體內是蛋白質組學的目前趨勢;
4、蛋白質組學的干預與篩選交替進行的扇形拓展策略。
隨后何大澄教授詳細介紹了蛋白質組學的干預與篩選交替進行的扇形拓展策略:干預目標蛋白表達,用組學技術篩選該干預導致的新差異蛋白,交替多輪進行,此研究策略達到的效果:1、有可能找到更多新的包括更好的標志蛋白;2、有可能逐步拼出調控網絡中的相關部分(一定意義上類似于測序的拼接)。
報告最后,何大澄教授針對近期蛋白組動態分析技術在用于miRNA研究中的優點進行了詳細的說明:
1、由于僅顯示15分鐘內所合成的蛋白,可排除先已存在的蛋白質的干擾,大大提高動態分析時間分辨率和差異蛋白篩選的敏感性。
2、由于同位素曝光的高靈敏度,可獲得更多蛋白點。
3、首次獲得合成速度/時間曲線,直接指正細胞活動拐點。
4、具有高通量能力,可同時檢測大量差異表達蛋白。
5、由于是β-衰變,不影響對蛋白質的質譜鑒定。
6、可用于體內研究
7、采用追蹤等技巧,可以獲得蛋白質修飾及降解等擴展信息。
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