2013年12月8日，第四十期質譜沙龍活動在北京朝陽醫院順利舉辦，來自北京師范大學、北京朝陽醫院、中科院微生物所、空軍總醫院的百余名專家學者齊聚一堂共同參加了此次沙龍活動。
作為質譜沙龍主辦方來自AB SCIEX 公司市場部李春波博士做了題為《差異蛋白質組織學研究的利器-iTRAQ技術與TripleTOF?4600系統》的報告。
李春波博士首先介紹了蛋白質組學的主要應用領域，包括：蛋白質鑒定，生物標志物發現，生物標志物的確認，蛋白翻譯后修飾鑒定，肽段/蛋白質的精確定量，信號通路中的翻譯后修飾定量分析。即鑒定→表征→確證→確認。
就如何發現生物標志物，李春波博士提出了BDS生物標志物發現系統。維基百科給出的生物標志物定義是指位于生物體中，被認為有意義的生化分子。通常是特殊的蛋白質或特征化合物。不同種類的細胞具有特定的生化分子，可以借由病理或是免疫染色的方式展現出來。因而可以辨識出是哪一種細胞或是組織等，與癌細胞有相關性的生物標記則可用來檢測癌細胞的產生。
李春波博士介紹了對正常人和腫瘤患者進行的腫瘤疾病課題的研究，通過這些研究發現，神經顆粒素蛋白在腫瘤患者體內表達下調；在進一步比較敏感患者與不敏感患者中發現，膜聯蛋白A1在對治療藥物不敏感患者身上高表達；鳥苷酸結合蛋白1在藥物治療敏感患者身上高表達。李博士說，這項研究的意義在于1.幫助疾病診斷；2.幫助疾病治療，優化治療方案；3.評價治療方案。
李春波博士說，用戶對Biomarker研究的需求是方法開發簡單，快速；選擇性和特異性-前處理方法簡單；靈敏度-確保發現低豐度蛋白；準確性和重現性；高通量；成本低。針對用戶的這些要求，AB SCIEX 公司開發了TripleTOF?4600系統。李博士介紹了TripleTOF?4600系統的特點：高分辨率，高靈敏度，高采集速度和高定量線性動態范圍，在MS和MS/MS，在定性和定量，同時達到。
李春波博士還介紹了iTRAQ技術，即相對和絕對定量的同位素標記法。李博士說，在BDS工作流程中，只需要在常規實驗中增加一個步驟，就是選擇不同的iTRAQ試劑標記對照組與實驗組，然后混合。
BDS系統在不同質譜平臺之間方法轉移也很方便。
iTRAQ?技術是蛋白質差異表達定量分析的極佳輔助工具，作為差異蛋白質組學研究的利器，BDS系統在國際頂尖科學雜志（CNS）中刊登了相關工作，得到了多家實驗室的認可，Nature Protocol上也發表了iTRAQ@的標準實驗流程。截止2013年9月30日為止，世界共發表了1029篇相關的文章，發表在數量逐年遞增；而中國科學家也發表了142篇iTRAQ@相關的文章，發表數量逐年翻倍遞增。
李春波博士介紹說，基于TripleTOF?4600系統的iTRAQ?數據，高質量二級圖譜可以同時提供定性及定量信息，即便是在低分子量區，MSMS圖譜分辨率高達20k，充分保證了iTRAQ?定量結果的可靠性。
iTRAQ標記效率，肽段的標記效率是iTRAQ相對定量實驗成敗的關鍵之一，李春波博士說，通過對多肽游離氨基進行實驗數據分析，結果表明：在試驗中側鏈K的標記效率接近100%，而N端標記效率為95.8%，原因是樣本中肽段存在一些修飾，阻止了反應集團與N端的反應。總體來說，標記是成功的，效率是高的。
報告最后，李春波博士總結到：BDS系統（TripleTOF 4600+iTRAQ?試劑+ProteinPilot軟件）差異蛋白質組學分析，生物標志物研究方面具有強大的性能；iTRAQ?標記后使4/8次實驗變成一次實驗，提高了通量；BDS系統能夠有效的鑒定差異大蛋白，定量準確；有非常強大的ProteinPilot軟件支持，定量結果清晰且可信。
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