或許有一天基于一個血液樣本,人們就能診斷許多類型的實體瘤或是監測患者體內的癌癥數量以及對治療的反應。以往這種方法是依賴于監測血液中循環腫瘤DNA的水平,這要求根據每位患者的情況來制定繁瑣及耗時的監測步驟,且不夠敏感。
現在,來自斯坦福大學醫學院的研究人員發明了一種方法可快速將這一技術帶至臨床。他們的方法高度敏感且特異,應該可以廣泛適用于許多癌癥類型。利用這一技術,研究人員精確地鑒別出了研究中50%的1期肺癌患者以及所有較晚期癌癥患者。
論文的資深作者之一、放射腫瘤學助理教授Maximilian Diehn博士說:“我們的目標是開發出一種能夠克服循環腫瘤DNA領域兩大主要障礙的方法。首先,這一技術要求非常敏感,能夠檢測出血液中極少量的腫瘤 DNA。第二,它必須能成為一種對大多數癌癥患者起作用的現成檢測方法,適于臨床應用。
“液體腫瘤”
論文的資深作者之一、醫學助理教授Ash Alizadeh說:“我們試圖開發出一種能夠檢測和測量疾病負擔的通用方法。由于獲取血液頗為方便,白血病一類的血癌比實體瘤更易于監測。通過開發出一種通用方法來監測循環腫瘤DNA,我們正在試圖將實體瘤轉變為更易于檢測和追蹤的液體腫瘤。”
即便是在沒有接受治療的情況下,癌細胞也在不斷地分裂和死亡。當它們死去之時,會將DNA釋放到血液中,就如同將微小遺傳信息放置在漂流瓶里。學會讀取這些信息,臨床醫生可以快速、非侵襲性地監測腫瘤的體積,患者對于治療的反應,以及面對治療或其他選擇壓力時腫瘤突變隨時間推移發生的演化。
主要作者Scott Bratman說:“即便是在晚期癌癥患者體內,絕大多數的循環DNA都來自于正常的、非癌性細胞。我們需要采用一種綜合性的策略從血液中分離出循環DNA,檢測出少見的、癌癥相關突變。為了提高這一技術的敏感性,我們在提取、處理和分析DNA方面進行了優化。”
研究人員將他們這種通過深度測序來進行癌癥個體化分析的技術命名為CAPP-Seq。 CAPP-Seq非常的敏感,可從血液10,000個健康DNA分子海洋中檢測出一個腫瘤DNA分子。該研究小組采用了一種生物信息學方法,收集了來自 407名非小細胞肺癌患者的圖譜信息,搜查了富含癌癥相關突變的基因組區域。
Alizadeh說:“我們尋找了最常發生改變的基因,利用一些計算方法鑒別出了癌癥的遺傳結構。這使得我們能夠鑒別出了能夠最好地識別和追蹤該疾病的基因組區域。”
盡管研究人員將焦點放在了罹患非小細胞肺癌的患者身上(包括大多數的肺癌,如肺腺癌、肺鱗狀細胞癌和大細胞癌),這種方法應該可以廣泛適用于全身大量不同的實體瘤。或許有一天它不僅可以用于追蹤以往確診患者的疾病進展,還能夠篩查健康或高危人群。
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