《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成

最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論文發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上。
 
在英國每年有接近1000例的Steno敗血病病例，死亡率大約30%。這種細菌在許多患有囊性纖維化病的成年人肺部也有發現，可以引起呼吸機相關性肺炎，在年長的重病護理患者中尤其顯著。
 
布里斯托爾大學的Matthew Avison教授表示，“Steno是一類最新發現的名單不斷增加的醫院超級細菌，它們顯示出的抗藥性程度令人擔憂。新出現的菌株可以抵抗所有的抗生素，而當前尚沒有開發出真對抗這種全耐菌株的新藥。”
 
全耐Steno感染的治療難度不亞于已知的MRSA和C.diff，但這種傳染更加罕見，只在醫院環境中獲得。MRSA是一種金黃色葡萄球菌，它對甲氧苯青霉素和其它抗生素有抗藥性。C. diff通常情況下存在于大腸中，被認為是對健康人體有益的細菌。抗生素的使用會使得C. diff成倍滋生，產生大量的毒素而導致感染。
 
Steno通常在潮濕的環境下繁殖，可以粘附在導管表面形成生物薄層，通過長期使用的導尿管或導氣管可以進入人體。這些導管常用于重癥患者或者化療中的病人。如果病人的免疫系統較為脆弱，那么Steno就可以大量在體內繁殖從而引起敗血病。這些病人會被用抗生素來治療，而這些抗生素恰巧是Steno所抵抗的，這一情況已經在新的研究中得到了重視。
 
科學家需要解決的關鍵性問題包括：Steno是如何粘附在導尿管和導氣管表面的？如何形成生物薄層并無法被清洗干凈？為什么它可以抵抗抗生素？桑格研究所的第一作者Lisa Crossman博士解釋了她們的研究可以解決上述問題：“基因組序列可以幫助我們對抗Steno的這些特性。比如，如果我們知道了它通過哪一個蛋白質粘附在導管表面，我們就可以去開發生化試劑來干擾這一過程；如果我們掌握了它的抗藥性機理，那么就可以設計抑制劑來使之封閉。”
 
盡管Steno傳染還比較少，但趨勢卻是不斷增加。另外兩種引起相似類型傳染的MRSA和C.diff卻比較常見。Avison說，“這兩類生物體的基因組序列已經存在，所以現在我們可以著眼于研究這三種超級細菌在遺傳上的共同特性，這將有助于解釋為何它們對抗生素具有如此的抵抗性。”
 
（《基因組生物學》（Genome Biology），2008, 9:R74 doi:10.1186/gb-2008-9-4-r74，Lisa C Crossman , Matthew B Avison）
 
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《基因組生物學》論文摘要

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