做了很久的WB(western blot),走了很多彎路,其實發現WB想要做好并不難,總結了WB實驗中可能會遇到的問題,分析了可能的原因及對應的解決方案,希望能成為你實驗成功的基石。
問題1:轉膜不充分
(1)膜沒有完全均勻濕透
使用100% methanol浸透膜。
(2)靶蛋白分子量小于10 000
選擇小孔徑的膜,縮短轉移時間。
(3)靶蛋白等電點等于或接近轉移緩沖液pH值
可嘗試使用其他緩沖液如CAPS緩沖液(pH 10.5)或使用低pH值緩沖液如乙酸緩沖液。
(4)甲醇濃度過高
過高甲醇濃度會導致蛋白質與SDS分離,從而沉淀在凝膠中,同時會使凝膠收縮或變硬,從而抑制高分子量蛋白的轉移。降低甲醇濃度或者使用乙醇或異丙醇代替。
(5)轉移時間不夠
對于厚的膠以及高分子量蛋白需要延長轉移時間。
問題2:背景高
(1)膜沒有完全均勻濕透
使用100% methanol浸透膜。
(2)洗膜不充分
增加洗液體積和洗滌次數。
(3)阻斷不充分
增加封閉液孵育時間,或者提高溫度。選擇合適的封閉試劑(脫脂奶粉,BSA,酪蛋白等)。
(3)二抗濃度過高
降低二抗濃度。
(4)檢測過程中膜干燥
保證充分的反應液,避免出現干膜現象。
(5)曝光過度
縮短曝光時間。
(6)抗體與阻斷蛋白有交叉反應
檢測抗體與阻斷蛋白的交叉反應性,選擇無交叉反應的封閉劑。洗滌液中加入Tween-20可減少交叉反應。
問題3:沒有陽性條帶
(1)抗體染色不充分
增加抗體濃度,延長孵育時間。
(2)酶失活
直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯物。
(3)標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低
設置陽性對照,如果陽性對照有結果,但標本沒有則可能是標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考慮增加標本上樣量解決靶蛋白含量低的原因。
(4)試劑不匹配
一抗與組織種屬,一抗與二抗或/和底物與酶系統之間不匹配。通過設置內參照可以驗證二級檢測系統的有效性。
(5)一抗失效
選擇在有效期內抗體;并選擇現配現用的工作液。
(6)HRP抑制劑
所用溶液和容器中避免含有疊氮化鈉。
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