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  • 發布時間:2019-03-27 22:53 原文鏈接: 消減雜交實驗

    試劑、試劑盒

    稀釋緩沖液雜交緩沖儲存液基三乙基溴化銨礦物油核酸和寡核苷酸

    儀器、耗材

    熱循環儀

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液、溶液和試劑

    稀釋緩沖液(20 mmol/L HEPES>HCl、pH8.3,50 mmol/LNaCl,0.2 mmol/L EDTA)

    4X 雜交緩沖儲存液:4mol/L NaCl,200 mmol/L HEPES、pH8.3,4 mmol/L 十六烷

    基三乙基溴化銨(CTAB)。最終的 1X 雜交緩沖液,用稀釋緩沖液稀釋。

    礦物油

    2. 核酸和寡核苷酸

    連接 Ad1 的檢測者 1-1(方案 1 第 4 階段第 8 步)

    連接 Ad2R 的檢測者 1-2(方案 1 第 4 階段第 8 步)

    驅動 DNA(方案 1 第 3 階段第 5 步)

    Rsa I 消化的驅動 DNA(方案 1 第 3 階段第 5 步)

    3. 專用設備

    兩臺熱循環儀(見第 11 步和第 12 步)

    二、方法

    1. 第一次雜交

    (1)按照下面的順序,將每個檢測者樣品與試劑混合。

    (2)用 1 滴礦物油覆蓋樣品,并短暫離心。

    (3)將樣品在熱循環儀中 98°C 溫育 1.5 min。

    (4)根據樣品類型,按照下面列出的時間將樣品在 68°C 溫育,然后立即進入第二次雜交。



    本方案使用 15ng 連接的檢測 DNA 和 450ng 驅動 DNAa 如果得要不同的消減效率,可以改變驅動者和

    檢測者的比例。

    2. 第二次雜交

    (9)(原文無 5~8 步—譯者注)對每個實驗的驅動 DNA, 重復下面步驟。



    將下面的試劑,加至滅菌的 0.5 ml(原文為 1ul。一譯者改)離心管中。

    (10)從混合物中取 1ul, 加至 0.5 ml 離心管中,并加 1 滴礦物油覆蓋。

    (11)在熱循環儀中 98°C 溫育 1.5 min。

    (12)將剛剛變性的驅動者離心管取出,立即放入另一臺已穩定在 68°C 的熱循環儀中。
    使用另一臺熱循環儀(或另一個 block) 可以確保樣品的迅速降溫。

    (13)然后,按照同樣的順序,依次加入已雜交的樣品 1-1 和 1-2(來自第一次雜交)。
    這樣確保在剛變性的驅動 DNA 過董的情況下,兩個雜交樣品漫合。

    (14)將雜交反應液在 68°C 溫育過夜。

    (15)加入 100ul 稀釋緩沖液,并吹吸混勻。

    (16)在熱循環儀中 72°C 溫育 7 min。

    (17)在-20°C 保存雜交反應液。


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