學者鑒定出十株噬藻體，為巢湖藍藻水華找到天敵

記者從中國科學技術大學了解到，該校生命科學與醫學部周叢照教授課題組，從巢湖成功分離五株侵染偽魚腥藻Chao 1806的噬藻體Pam1~Pam5，揭示了Pam1~Pam5的進化多樣性及它們在巢湖自然水體中的相對豐度，并以這五株實驗室純化的噬藻體基因組序列作為參考基因組，鑒定了10株尚未培養的噬藻體。相關研究成果于8月17日在線發表在《微生物群》上。

光合自養微生物藍藻作為地球上最重要的初級生產者，參與調控碳氮等物質循環。然而隨著全球變暖以及城市化和工業化發展，水體富營養化日益嚴重。全球淡水水體每年都大范圍爆發季節性藍藻水華，對周邊流域的生態環境及人畜安全造成重大危害。噬藻體是一類特異性侵染和裂解藍藻的噬菌體，是藍藻的天敵，參與調控藍藻的季節性消長，因此有望成為一種環境友好型的水華治理工具。相比于被廣泛研究的噬菌體和海洋噬藻體，迄今為止只有少數的淡水噬藻體被分離、鑒定和測序，在很大程度上限制了噬藻體的研究和應用。

通過在水華爆發季節從巢湖采集水樣，研究人員首先從巢湖水體中分離和放大培養了一株偽魚腥藻Chao 1806。以此為宿主，篩選分離得到五株尾部形態各異的淡水噬藻體Pam1~Pam5。全基因組測序表明，這五株噬藻體的雙鏈DNA基因組長度在36到142 Kb之間。隨后的比較基因組學和系統發育分析表明，Pam1~Pam5具有不同的DNA包裝機制，且在進化上是相互獨立的。利用宏基因組學分析手段，研究人員計算了它們在巢湖南淝河口水體中的相對豐度，結果表明短尾噬藻體Pam1和Pam5占主體。研究人員進一步以Pam1~Pam5和先前報道的其他淡水噬藻體基因組做參考基因組，從巢湖水體的宏基因組數據中聚類出10個新的尚未培養的淡水噬藻體重疊群。