目前,多個主流期刊和免疫印跡專家提出了看家基因已經不適合作為內參使用了。因為大多數看家基因都是高豐度蛋白,其產生的信號大多都會接近線性動態范圍的上限,當我們在檢測低豐度蛋白的時候,往往蛋白的上樣量會很大,易造成信號過飽和,這時候常見的內參產生的信號已經不能正確反應上樣量的差異了。并且研究發現一些看家基因的表達并不是恒定的,它會隨著發育階段的不同等因素產生變化,所以使用看家基因的定量并不可靠。
此外,一些雜志直接提出了內參和目的蛋白要在同一張印跡膜上,甚至直接提出最好選用總蛋白進行歸一化,如果使用看家蛋白,則需要提供看家蛋白表達穩定并且不受實驗條件影響的證據。