《PLOSGenetics》：追蹤HIV在北美的進化軌跡

　　包括西蒙佛雷澤大學(SFU)研究人員在內的一項研究，追蹤了HIV在北美的進化軌跡，他們發現證據表明，病毒隨著時間的推移慢慢地適應其人類宿主。然而，這種變化是如此循序漸進，因此不可能對疫苗設計產生影響。

　　本研究第一作者、SFU健康科學學院助理教授Zabrina Brumme稱：“許多研究都集中在HIV如何適應抗病毒藥物，我們想了解的是，隨著時間推移HIV如何適應我們人類宿主。”

　　這項研究發表在2014年4月24日的《PLOS Genetics》雜志，是由Brumme實驗室與哥倫比亞大學HIV卓越中心的科學家合作帶領，還包括哈佛大學、紐約血液中心和舊金山公共衛生部等機構。

　　Brumme稱：“HIV以可再生的方式來適應免疫反應。理論上說，如果這種突變會在群體中傳播，這對于宿主免疫力和疫苗來說，可能個壞消息。就像傳播耐藥性可以損害治療成功一樣，傳播的免疫逃避突變也可以影響我們抗擊HIV的自然能力。”

　　研究人員描述了從1979年(北美艾滋病開始流行)開始到現在的患者HIV序列。研究小組重建了傳染病的祖先HIV序列，并從那里評估了免疫逃避突變在人群中的傳播。

　　Brumme指出：“總的來說，我們的研究結果表明，病毒在北美適應的很慢。在世界HIV重災區，適應率可能會更高。”

　　Brumme補充道，本研究以一個充滿希望的消息結束，他說：“我們已經有工具，以治療的形式來遏制HIV，我們將繼續朝疫苗和治愈前進。總之，我們可以在病毒通過群體水平適應性對宿主免疫力破壞之前，阻止HIV。”

　　眾多SFU研究人員參與了這項分析，需要從歷史標本細致地恢復病毒RNA，然后進行實驗室培養。從血漿或血清中提取HIV RNA，然后利用測序特異性引物和擴增子進行巢式RT-PCR，在3130xl和/或3730xl自動測序儀上進行測序。三個SFU畢業生，包括健康科學專業的Laura Cotton，是本研究的共同第一作者。

　　Cotton指出：“這是一項艱苦的工作，但是，了解到它們對我們大陸的HIV歷史具有重要的作用，在實驗室中研究這些菌株就非常的吸引人。”眾多的本科生、研究生、博士后和教授包括客座教授Art Poon和副教授Mark Brockman也是共同作者。本研究，由加拿大衛生研究院(CIHR)和邁克爾史密斯衛生研究基金會(MSFHR)資助。