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  • 發布時間:2023-11-06 15:21 原文鏈接: 俄羅斯科學家參與創建基因組數據統一平臺

    來自俄羅斯、美國、土耳其和歐洲的科學家開發了一個Shambhala平臺,可將大量基因活性水平的大數據結合起來。該數據庫的創建將使科學家能夠將不同實驗中兼容性較差的數據結合起來。此項成果發表于《分子生物科學前沿》。

      該Shambhala平臺可將每個基因表達譜轉換為預定義的通用格式。這樣一來,所有數據都被合并到一個矩陣中,其中某些部分就可以進行相互比較。該平臺既可以協調異構數據,又考慮到了與正在研究中的基因相關的所有關鍵生物學特征。

      科研人員在六個數據集上測試了該平臺的性能,其中包含約6800個腫瘤樣本和11100個人體健康組織的基因活性水平信息。測試結果顯示,Shambhala在許多參數上都優于其他方法。


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