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  • 發布時間:2019-09-10 11:06 原文鏈接: 大量細菌克隆的雜交方法篩選實驗

               

    實驗方法原理 這一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)報道,主要用來處理由質粒 cDNA 文庫轉化的細菌。將轉化菌的混合物或者一份擴增的 cDNA 文庫直接置于不含洗滌劑的硝酸纖維素膜或尼龍膜上,復制膜用膜-膜接觸的方法制備。采用這一方法,每塊 150 mm 板上的 2X104 克隆或每塊 90 mm 板上的 1X104 克隆可以被復制,并作進一步雜交篩選。
    實驗材料

    重組質粒轉化的 E.coli

    儀器、耗材

    LB 或 SOB 瓊脂板 平頭鑷子 18 號針頭 硝酸纖維素膜 注射器 Whatman 3 MM 圓形濾紙

    實驗步驟

    一、材料

    1. 培養基

    (1) 含有適當抗菌素的 LB 或 SOB 瓊脂板。

    本方案中使用 2~3 天舊板效果最好,因為舊板更容易吸收接種物中的水分。

    (2) 含有適當抗菌素和 25% (V/V) 甘油的 LB 或 SOB 瓊脂板。

    (3) 含有氯霉素的 LB 或 SOB 瓊脂板。

    氯霉素貯存液濃度應為 170~200 μg/ml。

    2. 專用設備

    平頭鑷子(如 Millipore 鑷子)

    18 號針頭

    硝酸纖維素膜(Millipore HATF,或相當產品)或尼龍膜,無菌無去污劑污染

    注射器(3 cc)

    Whatman 3 MM 圓形濾紙。(提前準備一疊 Whatman 3 MM 濾紙(毎一硝酸纖維素或尼龍膜各準備一疊,還要加一些備用品),并裁減成比濾膜稍大一點。一些廠家已有預制好的圓形濾紙出售。用鉛箔包好濾紙,高溫高壓消毒 [ 15 psi ( 1.05 kg/cm2) 10 min ]。

    3. 載體和菌種

    重組質粒轉化的 E.coli,用作培養物。



    擴增的 cDNA 文庫,生長為培養物。

    二、方法

    1. 用軟鉛鉛筆或圓珠筆在干濾膜上作好標記,用水浸濕后將濕濾膜夾在干的 3 MM 濾紙之間,用鋁箔松散地包好,液相循環高溫高壓消毒 [ 15 psi (1.05 kg/cm2) 10 min]。

    準備足夠的濾膜用來從起始板制備 1 或 2 張備份。備份最好用消毒的無菌濾膜,但如果不再從主板制備備份,未消毒的濾膜也可以用。

    2. 用平頭鑷子將一張消過毒的濾膜,標記面向下,置于含有適當抗菌素的 LB 或 SOB 瓊脂板已制備 2~3 天,濾膜完全浸濕后,將其從板上揭下,翻過來標記面向上,再置于瓊脂板表面。

    3. 將小體積的菌液置于瓊脂板表面的濾膜中心,用一個無菌玻璃棒使菌液分散,在濾膜四周留出 2~3 mm 寬的無菌區。

    大濾膜(直徑 137 mm)可提供 0.5 ml 細菌懸液,含 2X104 個活菌;小濾膜(直徑 82 mm) 提供 0.2 ml 細菌懸液,含 ~104 個活菌。

    4. 將瓊脂板的蓋半開(不要倒置)置于通風櫥內數分鐘使接種物中的水分蒸發,蓋上蓋子,顛倒瓊脂板于 37℃ 培養直至出現直徑 0.1~0.2 mm 的小菌落(約 8~10 h)。

    5. 如需要,可在此時按步驟 6 制備備份濾膜,否則按以下步驟使菌落可凍存于 -20℃:

    (1) 將濾膜菌落面向上轉移至含有適當抗菌素和 25% 甘油的 LB 或 SOB 瓊脂板表面。

    (2) 于 37℃ 培養 2 h。

    如進行 cDNA 文庫篩選,最好將主板冰凍。冰凍可減少真菌污染使主板保存數月。含有抗菌素但不含甘油的 LB 或 SOB 板上的主濾膜可在 4℃ 保存 2 周。

    (3) 用 Parafilm 膜封好瓊脂板,顛倒置于封閉的塑料袋的于 -20℃ 保存。

    于室溫使主板(仍以顛倒位置 ) 解凍后即可制作備份。

    6. 將主膜(硝酸纖維膜或尼龍膜)菌落面上置于無菌的 Whatman 3 MM 濾紙上。

    7. 標記一張濕的硝酸纖維膜或尼龍膜,置于主膜上,防治在兩膜之間形成氣泡。

    最好將第二張濾膜稍微卷曲,以使兩張濾膜首先在中部接觸。兩膜一旦接觸,就不要相互移動。盡量使兩張濾膜不要完全重疊,以便于以后使兩者分離。

    8. 在濾膜上再蓋一張圓形 3 MM 濾紙,并在濾紙上放一個培養皿,用手掌向下緊壓培養皿以使細菌從主膜轉到濾膜上。

    9. 拿掉培養皿和頂層 3 MM 濾紙,用連接注射器的 18 號針頭在雙層濾膜作一些空,以作標記方位。

    確保針頭剌穿兩層濾膜。

    10. 使兩膜分開,將備份膜置于新鮮的含有適當抗菌素的 LB ( 或 SOB ) 瓊脂板。

    此時,可按步制備第二張備份,用主膜上已有的孔標記第二張備份膜。

    11. 將另一張備份膜和主膜置于新鮮的含有適當抗菌素的 LB ( 或 SOB) 瓊脂板,于 37℃ 培養,直到長出菌落(4~6 h)。

    12. 這一階段,當細菌生長依然很快,濾膜可以轉到含有氯霉素的(170~200 μg/ml) 的(或 SOB ) 瓊脂板,于 37℃ 培養 12 h。

    13. 將主膜轉到新鮮的含有適當抗菌素和 25% 甘油的 LB ( 或SOB ) 瓊脂板,而后按步驟 5 凍存。

    14. 裂解附著于備份膜上菌落,將釋放出的 DNA 固定于硝酸纖維膜或尼龍膜。進行雜交。

                展開           


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