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  • 發布時間:2023-01-31 10:49 原文鏈接: 第三代基因測序技術

    問題一:第三代測序技術的第三代測序技術原理 第三代測序技術原理主要分為兩大技術陣營:第一大陣營是單分子熒光測序,代表性的技術為美國螺旋生物(Helicos)的SMS技術和美國太平洋生物(Pacific Bioscience)的SMRT技術。脫氧核苷酸用熒光標記,顯微鏡可以實時記錄熒光的強度變化。當熒光標記的脫氧核苷酸被摻入DNA鏈的時候,它的熒光就同時能在DNA鏈上探測到。當它與DNA鏈形成化學鍵的時候,它的熒光基團就被DNA聚合酶切除,熒光消失。這種熒光標記的脫氧核苷酸不會影響DNA聚合酶的活性,并且在熒光被切除之后,合成的DNA鏈和天然的DNA鏈完全一樣。第二大陣營為納米孔測序,代表性的公司為英國牛津納米孔公司。新型納米孔測序法(nanopore sequencing)是采用電泳技術,借助電泳驅動單個分子逐一通過納米孔 來實現測序的。由于納米孔的直徑非常細小,僅允許單個核酸聚合物通過,而ATCG單個堿基的帶電性質不一樣,通過電信號的差異就能檢測出通過的堿基類別,從而實現測序。

    問題二:什么是第三代基因測序技術 go the wrong way

    問題三:第三代測序技術的第三代測序技術特點 1、它實現了DNA聚合酶內在自身的反應速度,一秒可以測10個堿基,測序速度是化學法測序的2萬倍。2、它實現了DNA聚合酶內在自身的延續性,一個反應就可以測非常長的序列。二代測序現在可以測到上百個堿基,但是三代測序現在就可以測幾千個堿基。3、它的精度非常高,達到99.9999%。4、直接測RNA的序列。既然DNA聚合酶能夠實時觀測,那么以RNA為模板復制DNA的逆轉錄酶也同樣可以。RNA的直接測序,將大大降低體外逆轉錄產生的系統誤差。5、第二個是直接測甲基化的DNA序列。實際上DNA聚合酶復制A、T、C、G的速度是不一樣的。正常的C或者甲基化的C為模板,DNA聚合酶停頓的時間不同。根據這個不同的時間,可以判斷模板的C是否甲基化。

    問題四:第三代測序技術的介紹 第三代測序技術是指單分子測序技術。DNA測序時,不需要經過PCR擴增,實現了對每一條DNA分子的單獨測序。

    問題五:DNA 的 1代測序,2代測序,3代測序的區別是什么啊? 第一代指雙脫氧末端終止法,擴增后通過毛細管電泳讀取序列,每次獲取數據量少
    第二代為高通量測序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次獲得數G數據,相對與第三代,都仍然需要擴增的方法放大信號,擴增后再檢測。
    第三代特點是單分子測序,多基于納米科技,無需擴增,對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過納米孔等方式直接測序,核心特點是無需擴增所以成本更低

    問題六:第三代測序技術的第三代測序平臺比較 測序方法/平臺 公司 方法/酶 測序長度 每個循環的數據產出量 每個循環耗時 主要錯誤來源 第三代測序技術 Heliscope/Helicos  Genetic Analysis  System Helicos 邊合成邊測序  /DNA聚合酶 30-35 bp 21-28 Gb 8 d 替換 SMRT Pacific Biosciences 邊合成邊測序  /DNA聚合酶 100000 bp       納米孔單分子 Oxford Nanopore 電信號測序  /核酸外切酶 無限長

    問題七:基因三代測序是什么? 三代測序是 DNA聚合酶和模板結合,4色熒光標記4種堿基(dNTP),在堿基配對階段,不同堿基的加入,會發出不同光,根據光的波長與峰值可判斷進入的堿基類型。同時這個 DNA 聚合酶是實現超長讀長的關鍵之一,讀長主要與酶的活性保持有關,它主要受激光對其造成的損傷所影響。PacBio SMRT技術的一個關鍵是將反應信號與周圍游離堿基的強大熒光背景區別出來。他們利用的是ZMW(零模波導孔)原理:在一個反應管(SMRTCell:單分子實時反應孔)中有許多這樣的圓形納米小孔,即 ZMW(零模波導孔)外徑 100多納米,比檢測激光波長小(數百納米),激光從底部打上去后不能穿透小孔進入上方溶液區,能量被限制在一個小范圍里,正好足夠覆蓋需要檢測的部分,使得信號僅來自這個小反應區域,孔外過多游離核苷酸單體依然留在黑暗中,從而實現將背景降到最低。

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