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  • 發布時間:2010-06-25 11:52 原文鏈接: 蛋白質技術實現突破IBM助力癌癥研究

      近日,IBM宣布全球網格大同盟助力”征服癌癥”項目取得重大突破,科學家可以通過計算系統對以前復雜的手動流程實現自動化,加速識別與癌癥有關的蛋白質結構,找出治愈癌癥的最佳方案。

      “結晶化”技術被攻克,蛋白質識別速度大幅提升

      據世界衛生組織透露,2007年,在全球總的死亡人口中,癌癥占13%。 該組織聲稱,2008年新增癌癥病例1270萬例,死亡760萬人。在今后20年內,每年診斷出來的新增癌癥病例將驟增至2100萬,將有1300萬人死于癌癥。

      IBM全球網絡大同盟“征服癌癥”項目旨在建立一個計算系統,用來準確識別固化蛋白質樣本,實現樣本x光檢查,方便科學家進一步探索某些可能引發癌癥的蛋白質的結構、形狀和相互之間的作用。這個蛋白質樣本固化流程叫做“結晶化”, 現已攻克。通過改進蛋白質 X 射線結晶學,研究人員能夠更快地確定多種與癌癥相關的蛋白質的結構,發現可能的藥物介入方法,以便攻克這種致命的疾病。

      在過去,人們不可能對某個給定的蛋白質的9,216張圖片全部進行人工檢查。即便有人試圖以每秒一張圖片的速度對圖像進行檢查,檢查完所有12,500個蛋白質的圖像也需要1,333天。人為評估也會有很大變化,即使同一個人也會存在不一致的情況。計算機檢查同時具有定性和定量兩方面的優勢。但是,在對晶體識別流程實現自動化的早期階段,計算機的準確率當時只有70%,而且只能對大約850個特征進行檢查,現在已經能夠對大約15,000個特征進行分析。

      現在,通過全球網絡大同盟,全球150萬電腦用戶志愿貢獻剩余計算能力,參與數據處理。借助強大的計算處理能力,新的系統下,科學家們可以成功識別80%帶有晶體的圖像以及結晶之前存在98%的清澈蛋白質溶液液滴。 與人為檢查相比,它對每個蛋白質進行檢查的圖像數量可以達到前者的6倍,而時間卻極大地縮短。

      IBM熱心公益,全球網絡大同盟服務社會

      全球網格大同盟是IBM全球公眾事業合作部公益捐贈合作項目的一項內容。當今世界,約有10億臺個人計算機,其中大多數的使用時間不到5%。想方設法使目前沒能被充分運用的計算力最終造福全人類,這就是全球網格大同盟的宗旨。IBM全球董事長及首席執行總裁彭明盛于2004年11月16日向公眾宣布全球網格大同盟將成為造福人類社會最大的公眾網格。

      全球網格大同盟目前已經成為化學領域有關蛋白質方面的權威數據庫。這些數據可以幫助全球科研人員揭開眾多癌癥生長的神秘面紗,例如,乳腺癌、前列腺癌或者兒童白血病。同時,利用IBM的慈善處理器,通過對晶體的識別實現自動化,可加速各種生物科學和基因研究項目的研究速度,可以用于對其它試圖獲取蛋白質結構的項目。例如,全球營養水稻項目――利用全球網格大同盟來探索如何培育出抗病能力更強的水稻;發現治療登革熱的藥物項目――發現有希望對抗登革熱、丙型肝炎、西尼羅河病以及黃熱病等病毒的藥物的線索等。

      據統計,全世界20%的新發癌癥病人,以及24%的癌癥死亡病人都在中國,目前中國的癌癥生存患者和治愈患者僅為13%。促進蛋白質結晶技術的快速發展,可以為預防、早期診斷及治療癌癥,提供更多的技術可行性,對中國意義重大。

      為此,IBM中國公眾事業合作部經理彭文杰女士表示:“‘征服癌癥’項目所取得的成果,說明了全球網格大同盟為科學領域帶來的巨大價值。那些自愿捐獻PC處理器計算資源的人,為中國和世界攻克癌癥的發展進程做出了巨大貢獻。他們值得為此而驕傲。”

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