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    反CRISPR噬菌體合作克服CRISPRCas免疫

    英國埃克塞特大學的研究人員發現,一種被稱為噬菌體的病毒在面對迎面而來的攻擊時,首先削弱細菌的防御力,然后再殺死細菌。 這一發現是一個關鍵性突破,它將有助于改善噬菌體療法,治療危機生命的細菌感染。 細菌有防御系統,例如眾所周知的CRISPR-Cas,以保護自身免受病毒侵襲。像軍備競賽一樣,噬菌體也裝備了“反CRISPR”分子,以便中和來自細菌的防御。 埃克塞特大學的研究表明,單個病毒粒子是不能完全抵消CRISPR-Cas系統的,但是,如果有足夠多的病毒粒子,這種“團隊合作”可以讓它們克服防御機制,迅速在細菌種群中建立感染。 “道高一尺魔高一丈,足夠多的病毒粒子是它們的攻擊利器,”文章一作Mariann Landsberger博士說。“顯然,病毒數量低于這個‘臨界點’的話,就會導致入侵者噬菌體被細菌殲滅。” 相反,噬菌體數量如果超過“臨界點”,它們就會通過同時或順序感染與細菌結合。“關于‘臨界點’的一種解釋是,兩個具有......閱讀全文

    NSMB背靠背丨黃志偉 揭示其抑制type V型Cas12a活性的新機制

      CRISPR-Cas適應性免疫系統為細菌和古細菌對抗噬菌體和質粒入侵提供了核酸序列特異性的防御機制【1】。CRISPR-Cas系統分為6個亞型,其中II型CRISPR-Cas9和V 型CRISPR-Cas12a(Cpf1)系統被廣泛應用于基因組編輯和多種多樣的生物技術應用【2,3】。在噬菌體感染

    哈工大最新發表Nature文章 再次解析CRISPR作用機制

      來自哈爾濱工業大學生命科學與技術學院的研究人員發表了題為“Structural basis of CRISPR–SpyCas9 inhibition by an anti-CRISPR protein”的文章,揭示了Anti-CRISPR 蛋白AcrIIA4抑制SpyCas9活性的分子機制。  

    哈工大Nature:揭示Anti-CRISPR蛋白抑制SpyCas9活性的分子機制

      4月28日,哈爾濱工業大學生命學院黃志偉教授課題組在《自然》(《Nature》)在線發表了題目為《Anti-CRISPR蛋白抑制CRISPR-SpyCas9活性的分子機制》(Structural basis of CRISPR-SpyCas9 inhibition by an anti-CRIS

    與CRISPR/Cas系統相愛相殺的抗CRISPR蛋白研究最新進展 一

    CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。在CRISPR/Cas系統中,CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列(clustered regularly interspaced short palindr

    噬菌體竟然可以保護自身基因組免受CRISPR核酸酶切割

      細菌和感染它們的病毒正在進行一場與生命本身一樣古老的分子軍備競賽。進化為細菌配備了一系列可靶向并破壞病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系統。但是,殺死細菌的病毒(也稱為噬菌體)已設計出了它們自己的工具來幫助它們戰勝這些最強大的細菌防御。  如今,在一項新的研究中,來自美國加州大學舊金山

    Nature首次揭示噬菌體保護自身基因組免受CRISPR核酸酶切割

      細菌和感染它們的病毒正在進行一場與生命本身一樣古老的分子軍備競賽。進化為細菌配備了一系列可靶向并破壞病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系統。但是,殺死細菌的病毒(也稱為噬菌體)已設計出了它們自己的工具來幫助它們戰勝這些最強大的細菌防御。  如今,在一項新的研究中,來自美國加州大學舊金山

    新發現!Cell:噬菌體抱團抑制細菌CRISPR免疫系統

       在2018年7月19日同時在線發表在Cell期刊上的兩篇論文中,來自兩個研究團隊的研究人員提供了當入侵含有CRISPR的細菌時,噬菌體彼此間進行合作的證據。他們發現為了壓制CRISPR的破壞,噬菌體通過聯合起來快速地感染細菌來加以適應,而且有時一個噬菌體還會為此作為引火噬菌體(primer p

    張鋒發表Science雜志CRISPR新綜述

      新一期(8月5日)的《科學》(Science)雜志發表了一篇題為“Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems”的綜述文章。瓦赫寧根大學微生物學家John van der Oos是這

    與CRISPR/Cas系統相愛相殺的抗CRISPR蛋白研究最新進展 二

    利用一種被稱作冷凍電鏡的高分辨率成像技術,這些研究人員發現了CRISPR系統和抗CRISPR蛋白的三個重要的方面。首先,他們準確地觀察這種CRISPR監視復合物如何識別病毒遺傳物質以便發現它應當在何處發起攻擊。這種監視復合物中的蛋白像握手那樣纏繞在細菌crRNA的周圍,讓這種crRNA的特定片段暴露

    Nature:CRISPR-Cas也有天敵!

      近日,來自加拿大多倫多大學的研究人員在著名國際學術期刊Nature上發表了一項最新研究進展,他們在這項研究中首次發現了噬菌體合成的用以抑制細菌體內CRISPR-CAS系統的蛋白質。  細菌與感染細菌的病毒(噬菌體)之間的生存之戰導致了許多細菌的防御系統得到進化,同時噬菌體也針對這些系統進化出了新

    Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究進展Top20

      CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種后天免疫系統,其以消滅外來的質體或者噬菌體并在自身基因組中留下外來基因片段作為“記憶”。  CRISPR/Cas系統全名為常間回文重復序列叢集/常間回文重復序列叢集關聯蛋白系統(clustered regularly inte

    生物物理所揭示噬菌體防御CRISPR-SpyCas9的分子機制

      2018年12月31日,《分子細胞》(Molecular Cell)雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組在CRISPR-Cas系統研究中取得的最新進展。標題為Phage AcrIIA2 DNA Mimicry: Structural Basis of the CRISPR and

    CRISPR技術的前景因免疫反應而蒙上陰影

      通過基因組編輯來糾正異常,這個概念似乎簡單明了。幾十年來,科學家也一直嘗試用基因編輯來開展治療,獲得了不同程度的成功。最大的障礙來自基因導入系統,它往往使用病毒,具有一定的風險。圖片來源于網絡  2013年,研究人員首次利用CRISPR-Cas9系統來編輯哺乳動物細胞的基因組,對編輯發生的位置有

    微生物所噬菌體抑制細菌CRISPR-Cas系統機制研究中獲進展

      原核生物通過一系列的防御系統來抵抗噬菌體等寄生生物的攻擊。與真核生物的免疫系統類似,原核生物的防御系統也可以分為天然免疫系統和獲得性免疫系統。天然免疫系統又包括限制性修飾(Restriction-Modification, R-M)系統、DNA干擾、毒素-抗毒素系統等,是非特異性的防御措施;而獲

    Nature: 同其它細菌共進化可保條件病原菌自身毒力

      近日,英國埃克塞特大學的研究人員在Nature上發表了題為“Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance”的文章,在自然環境中進化的細菌可能對噬菌體治療具有抵抗力,而不會喪失其毒性。  據

    Nature: 同其它細菌共進化可保條件病原菌自身毒力

      近日,英國埃克塞特大學的研究人員在Nature上發表了題為“Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance”的文章,在自然環境中進化的細菌可能對噬菌體治療具有抵抗力,而不會喪失其毒性。  據

    體積是CRISPR-Cas9的一半的新型基因編輯工具-CasΦ

      基因編輯(gene editing),又稱基因組編輯(genome editing)或基因組工程(genome engineering),是一種新興的比較精確的能對生物體基因組特定目標基因進行修飾的一種基因工程技術。基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行定點“編輯”,實現對特定DNA片段的修飾。

    CRISPR女神創辦公司放“大招”

      CRISPR的火熱及其在臨床上應用的美好愿景,令這一技術相關的公司不斷涌現,除了張鋒等人創辦的Editas Medicine,Emmanuelle Charpentier等人的ERS Genomics,另外一位CRISPR先驅Jennifer Doudna也創辦了自家公司:Caribou Bio

    將CRISPR-Cas系統用于抗菌“基因療法”

      CRISPR于1987年出現于日本,當時的研究人員報告稱,他們在大腸桿菌基因組中發現了一種不尋常的結構,其中包含一系列重復片段,中間以獨特的間隔序列隔開。后來的研究表明,間隔序列對應了感染細菌細胞的噬菌體的序列。在一些原核生物和古生物中,CRISPR和CRISPR相關蛋白(Cas)作為一種適應性

    2020年CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。圖片

    中科院Cell發表CRISPR-Cas研究新成果

      來自中科院生物物理研究所的研究人員,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系統依賴于PAM獲取間隔序列(spacer)的結構基礎及機制。這項重要的研究工作在線發布于10月15日的《細胞》(Cell)雜志上。  論文的通訊作者是中科院生物物理研究所的王艷麗(Yanli Wang)研究員,其主要研究

    中科院Cell發表CRISPR-Cas研究新成果

      來自中科院生物物理研究所的研究人員,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系統依賴于PAM獲取間隔序列(spacer)的結構基礎及機制。這項重要的研究工作在線發布于10月15日的《細胞》(Cell)雜志上。  論文的通訊作者是中科院生物物理研究所的王艷麗(Yanli Wang)研究員,其主要研究

    浙江大學Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系統

      來自浙江大學生命科學研究院的研究人員揭示出了,噬菌體蛋白AcrF3抑制Cas3的結構基礎。他們的研究結果發布在7月25日的《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。  浙江大學生命科學研究院的朱永群(Yongqun Zh

    生物谷7月份結構生物學研究進展一覽

      1. Cell:中科院生物物理所王艷麗/章新政課題組從結構上揭示Cas13a切割RNA機制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。在CR

    中科院生物物理所:從結構上揭示Cas13a切割RNA機制

      CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。在CRISPR/Cas系統中,CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列(clustered regularly interspaced short palindr

    CRISPR/Cas9應用近期重大進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    一文盤點12月CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    科學家揭示細菌對外源DNA的適應性免疫響應機制

      近期,中國科學院生物物理研究所高璞課題組與美國Sloan研究所Patel課題組合作,揭示了兩類新型CRISPR-Cas系統(Type V-A Cpf1及Type V-B C2c1)響應外源DNA的作用機制,相關研究論文分別發表于2016年8月的《細胞研究》(Cell Research)雜志和12

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