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    蛋白鑒定方法之質譜相關技術

    質譜已成為連接蛋白質與基因的重要技術,開啟了大規模自動化的蛋白質鑒定之門。 用來分析蛋白質或多肽的質譜有兩個主要的部分,1)樣品入機的離子源,2)測量被介入離子的分子量的裝置。 首先是基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)為一脈沖式的離子化技術。 它從固相標本中產生離子,并在飛行管中測其分子量。 其次是電噴霧質譜(ESI-MS),是一連續離子化的方法,從液相中產生離子,聯合四極質譜或在飛行時間檢測器中測其分子量。 近年來,質譜的裝置和技術有了長足的進展。 在MALDI-TOF中,最重要的進步是離子反射器(ion reflectron)和延遲提取(delayed ion extraction),可達相當精確的分子量。 在ESI-MS中,納米級電霧源(nano-electrospray source)的出現使得微升級的樣品在30~40 min內分析成為可能。 將反相液相色譜和串聯質譜(tandem MS)聯......閱讀全文

    你必須知道的質譜鑒定中14條FAQ

       質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,不過,目前的應用還不是特別廣泛。那么,有問題了怎么解決呢?本文收集了相關的新手對于這項技術的常見問題與解決方法。希望能更好地幫助大家了解這項技術。  問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?  答:一級質譜鑒定的方式

    2-DE 蛋白質組學的 PROTICdb 數據庫實驗

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    質譜鑒定,常見疑問解答

    問題1、一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?答:一級質譜鑒定的方式主要為胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定;二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的

    2-DE 蛋白質組學的 PROTICdb 數據庫實驗

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    你必須知道的質譜鑒定中10條FAQ

      質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,應用前景十分廣泛。那么,有問題了怎么解決呢?  問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?  答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(peptide-mass mapping, PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分

    蛋白質組學在植物科學研究中的應用

    1 植物群體遺傳蛋白質組學 1.l 遺傳多樣性蛋白質研究基于基因組學的一些遺傳標記,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

    質譜鑒定常見問題解答

       1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?  答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合

    質譜鑒定常見問題解答

    1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF

    蛋白質質譜鑒定技術概述及常見問題解決方法

      蛋白質(Protein)是生物體中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物細胞,作為生命的物質基礎之一,蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用,因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。   現代研究結果發現越來越多的多肽

    革蘭陰性菌鑒定效能評估PK!國產Clin-TOF-Ⅱ MS & Bruker Biotyper

      范欣, 肖盟, 徐志鵬, 張戈,陳欣欣,徐英春. 國產基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜系統Clin-TOF-Ⅱ MS與Bruker Biotyper質譜系統在革蘭陰性菌的鑒定效能評估 [J]. 中華檢驗醫學雜志,2017,40( 1 ): 41-45. DOI: 10.3760/cma.j.is

    蛋白質質譜鑒定技術概述及常見問題

    蛋白質(Protein)是生物體中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物細胞,作為生命的物質基礎之一,蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用,因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。現代研究結果發現越來越多的多肽同蛋白質一樣

    2-DE 蛋白質組學的 PROTICdb 數據庫實驗(四)

    4. 質譜鑒定報告文件上傳PROTICdb 兼容以制表分隔的文本格式輸出的 Sequest 鑒定報告(見注釋 13) 。( 1 ) 為演示,訪問 http: //location 一 of/your/proticdb/home/demo. php。點擊  “formto  o

    新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...(四)

    如圖 4 所示,在不同儀器之間,有很多蛋白會重復出現,即被不同儀器同時鑒定到。在 60 分鐘的分離過程中, LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 LTQ XL 得到到蛋白數目的 88% , LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 Q-TOF 得到蛋白數目的 90% ,此外,還有 570 個

    北京師范大學質譜中心學術交流及工作研討會在京舉行

       布魯克·道爾頓公司 潘晨松 應用技術支持工程師   布魯克·道爾頓公司的潘晨松應用技術支持工程師在報告“全力打造基于質譜的科學工具”中,通過為客戶進行的實際樣品分析實例講解了micrOTOF-QⅡ液相色譜四級桿飛行時間質譜儀的功能和分析方法。   潘工程師介紹,micrOTOF-QⅡ

    分離膠促凝管聯合MALDI-TOF MS直接檢測血培養陽性細菌

    引言隨著廣譜抗菌藥物的廣泛應用、多種侵入性診療手段的普遍應用以及各種原因導致的免疫功能低下患者的日益增加, 血流感染的患病率呈逐年上升的趨勢。美國的統計數據顯示, 血流感染連續多年位于疾病死亡率排名前10位。國內報道院內血流感染的總死亡率平均為30%~40%。相對傳統培養鑒定流程, 基質輔助激光解析

    臨床微生物實驗室:質譜應用的廣闊前景

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    周曉光:MALDI誕生30年小記

      基質輔助激光解吸電離(也就是通常所說的MALDI)于1987年首次由Hillenkamp 及Karas提出,如今已經30年。從那時起,通過應用這一“軟電離”技術與飛行時間質譜(MALDI -TOF MS)的結合,成功地實現了為生物大分子提供快速和高度可靠檢測手段的目的,同時也為生命科學領域提供了

    植物蛋白質組學和糖基化實驗

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    融智生物發布全球首個商用化生物組學微生物質譜數據庫

      近日,融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。  傳統上,基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異,對核糖體蛋白組的質譜測試,可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI-TO

    超4000種 融智生物發布商用化生物組學微生物質譜數據庫

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    一小時DDA鑒定DIA定量4000個Hela蛋白(二)

    Skyline 中嵌入的 mProphet 軟件會根據同一肽段的多個子離子峰的 feature 進行打分。 Feature 包括子離子共流出峰形、保留時間偏差、 dotp 值、信噪比等。為了區分假陽性的子離子峰, mProphet 可以建立 decoy 庫,也可以將打分排名第二的肽段作為decoy,

    一小時 DDA 鑒定 DIA 定量 4000 個 Hela 蛋白(二)

    500 ng Hela 細胞裂解液用相同的色譜柱,相同的色譜梯度,將 QE HF 切換至 DIA 掃描模式進行 3 次 DIA 數據采集。在一次掃描循環中,目標母離子質核比范圍 400–1000,四極桿的隔離窗口為 12 Da,包含 50 次 MS/MS 掃描。每一張 MS/MS 譜圖中

    沃特世在第55屆美國質譜年會推出的新品

    沃特世公司在2007年美國質譜年會上重新定義分子描述方法  創新技術推動生物學和化學分子科學的前沿,改進研發和定量手段 第55屆美國質譜年會于6月3日至7日在印第安納州,印第阿波利斯市舉行。沃特世公司(Waters Corporation)(股票代碼NYSE:WAT)在會上推出新型質譜,

    MALDI-TOF MS技術在臨床微生物實驗室中的應用前景

    質譜技術在臨床微生物實驗室中的應用前景引言自20世紀80年代起, 質譜技術就已經成為科學研究中用于蛋白分析的強大工具。隨著技術的不斷成熟和廣泛使用, 其在微生物檢驗常規診斷中的作用越來越受到關注, 基質輔助激光解析電離飛行時間質譜技術(matrix-assisted laser desorption

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(三)

    對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比

    蛋白質組技術的研究進展

      大規模基因組測序計劃的實施已改變生命科學的重心,在相當短的時期內,一些原核生物和某些低等真核生物的基因組序列已被測定. 1995年,流感嗜血桿菌基因組序列首次被破譯,在此后不到兩年的時間,近50個細菌的基因組序列已被完成. 然而,這僅僅是理解有機物功能的一個起點. 在基因組時代,許多DNA序列信

    雜質蛋白鑒定與定量的完美結合—Hi3分析方法

    液質數據中,不但含有蛋白藥序列表達是否正確的肽圖信息,其它雜質蛋白同樣可以被挖掘出來。然而,單純的雜質蛋白鑒定卻又是不夠遠遠的,其確切的含量信息同樣至關重要。沃特世PLGS軟件可以在肽圖液質數據中,進一步鑒定其中的雜質蛋白,并其相對含量信息進行分析。 一、“順便”完成的雜質蛋白鑒定與相對定量使用相應

    質譜沙龍第三十三期活動報道

      2011年9月25日,第三十三期質譜沙龍活動在北京大學分析測試中心成功舉行。來自第二炮兵總醫院、北京大學、中科院微生物研究所、中國醫學科學院基礎醫學研究所、空軍總醫院、AB SCIEX公司、北京艾米諾醫學研究有限公司等,近四十位專家、學者、技術工程師參加了本次沙龍活動,本次沙龍以大分子為主題,共

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    基于Q-OT-qIT 平臺的第二代“三合一”超高分辨質譜介紹

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