從修飾肽序列中判定修飾肽的溶解性方法
1.非HPLC純化的修飾肽中有哪些雜質?答:粗品和脫鹽級別的修飾肽中修飾肽和非修飾肽類雜質:如非全長修飾肽和修飾肽后處理的一些原料如DTT、TFA等。2.HPLC純化的修飾肽有哪些雜質?答:經過HPLC純化的修飾肽,仍會有一些一些雜質存在,其中的雜質主要是短肽和微量TFA。3.多長的修飾肽為合適?答:修飾肽合成需要考慮修飾肽的長度,電荷,親疏水性等因素。長度越長,合成粗品的純度和產率都隨著降低,純化的難度和無法合成的幾率就會大些。當然修飾肽功能區的序列是無法改變的,但是為了修飾肽的順利合成,有時不得不在功能取的上下游增加一些輔助氨基酸,以改善修飾肽的溶解性和親疏水性。如果修飾肽太短,合成也可能有問題,主要問題是合成的修飾肽在后處理過程中有一定的難度,5肽以下的修飾肽,一般要有疏水的氨基酸,否則后處理難度加大。15個氨基酸殘基以下的修飾肽一般都可以得到滿意的產率和得率。4.如何從修飾肽序列中判定修飾肽的溶解性?(1)修飾肽中如果含......閱讀全文
從修飾肽序列中判定修飾肽的溶解性方法
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熒光標記肽技術常用的多肽修飾熒光物質
熒光標記所依賴的化合物稱為熒光物質。熒光物質是指具有共軛雙鍵體系化學結構的化合物,受到紫外光或藍紫光照射時,可激發成為激發態,當從激發態恢復基態時,發出熒光。熒光標記技術指利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上,利用它的熒光特性來提供被研究對象的信息。熒光標記的無放射物污染,操作簡
電泳分離的蛋白質肽譜和序列分析實驗
方案1 蛋白質的過甲酸氧化實驗 方案2 蛋白質還原和S-羧甲基化:大規模方法 方案3 蛋白質還原和S-羧甲基化:微量方法 方案4 用Ellman 試劑測定自由巰基和二硫鍵實驗 方案5 蛋白質的胰酶消化實驗 方案6 用溴化氰切割 M
電泳分離的蛋白質肽譜和序列分析實驗
實驗材料 凍干的純化蛋白樣品試劑、試劑盒 甲酸氫溴酸過氧化氫NaOH 固體儀器、耗材 旋轉蒸發器小試管實驗步驟 1.加入 100ul 過氧化氫到 900ul 甲酸中,在室溫下放置讓,將反應產生過甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷凍過甲酸至 0°C。3.在預冷的小試管中,將蛋白質溶解于 50ul 過
PK120-的純化及肽段氨基酸序列分析實驗
實驗方法原理 實驗材料 PK-120試劑、試劑盒 Q-Sepharose 樹脂S-Sepharose 樹脂Hudroxyapatite 羥基磷灰石Sephacryl S-200 凝膠賴氨酸內切酶乙腈三氯醋酸儀器、耗材 Applied Biosystems model 477A 氣相蛋白質測定儀A
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蛋白質內序列分析用肽段的分離與純化實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 考馬斯亮藍 G 乙酸 甲醇 Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸 乙腈 2-丙醇
蛋白質內序列分析用肽段的分離與純化實驗
分子生物學中最重要的環節之一是對微量蛋白質進行分析,使對編碼待研究蛋白的 cDNA 序列的克隆成為可能。為有效地做到這一點,通常需要知道蛋白質的內序列。在這一方面,肽段的有效分離是極重要的。本實驗來源于蛋白質純化與鑒定實驗指南,作者:朱厚礎。試劑、試劑盒考馬斯亮藍 G乙酸甲醇Achromobacte
蛋白質內序列分析用肽段的分離與純化實驗
試劑、試劑盒 考馬斯亮藍 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇儀器、耗材 SpeedVac 型旋轉濃縮器Tween-20UltrafreeTM MC 濾器C18 反相 HPLC 柱實驗步驟 材料與設備考馬斯亮藍 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液)乙酸 (5
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基本方案 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 PK-120
依那西普類融合蛋白的序列覆蓋-度和翻譯后修飾表征
電荷異構體是生物藥,尤其蛋白類藥物的關鍵質量屬性之一,對藥物的穩定性、溶解性、免疫原性、體內外生物學活性和藥物動力學功能發揮具有重要的影響。選擇一種靈敏度高、特異性強的電荷異構體檢測分析方法,是控制和穩定藥物生產質量的有效手段。電荷異構體作為衡量生物制劑質量的關鍵屬性,可以反映出抗體生產工藝的穩
原料藥、目錄肽和合成肽分別是什么,有和區別?
何謂多肽的純度?修飾肽的純度是指HPLC法在214nm波長處檢測到的目標多肽的含量(214nm是肽鏈的吸收波長),紫外分光光度計檢測不到水和殘留的鹽。一般而言,純化后的修飾肽包含的雜質多為序列被修改的多肽,比如:缺失序列(缺失了一個或多個氨基酸殘基的靶序列),截斷序列(加帽過程中產生的序列)脫保護不
用ETD線性離子阱質譜成功鑒定蛋白和翻譯后修飾
? ? 在翻譯后修飾和/或極堿肽的序列分析方面,電子轉移裂解( ETD )線性離子阱質譜是很有優勢的工具。傳統的誘導活化裂解(CAD)常用來鑒定蛋白,并試圖確定和找到他們修飾的位點,但這種技術有其本身固有的缺點,下面將詳細敘述。與線性離子阱的結合使用的ETD是蛋白質組學研究的一個可靠的技術,可以很容
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Pepfinder軟件對單克隆抗體進行肽圖分析(一)
1前言在蛋白質藥物產品的質控要求中,肽圖分析是其中重要的一環。肽圖分析包括對蛋白氨基酸序列進行確證及相關修飾的鑒定和定量。根據蛋白藥物質譜分析特點和生物制藥應用的特殊需求,Thermo Fisher與Amgen聯合開發了PepFinderTM 軟件。?PepFinder不僅具有最基本的肽段序列確證、
BiopharmaLynx軟件在蛋白質肽圖分析中的應用(一)
在新藥研發中,蛋白質藥物正在占據越來越大的比重,而蛋白質分子結構的復雜性又要求對蛋白質藥物必須進行全面的表征,以滿足新藥報批、工藝改進和ZL保護的要求。目前蛋白質藥物的研發和表征還面臨很多挑戰,尤其是在重組蛋白的序列確證、微量雜質蛋白的檢測和定量、不同批次間產品的比較和質量控制等方面。質譜在蛋白質的
用ETD線性離子阱質譜成功鑒定蛋白和翻譯后修飾
By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific ????? 在翻譯后修飾和/或極堿肽的序列分析方面,電子轉移裂解( ETD )線性離子阱質譜是很有優勢的工具。傳統的誘導活化裂解(CAD)常用
RGD環肽,AMC(香豆素)修飾多肽
1. RGD環肽簡介在了解RGD肽之前,我們先簡單介紹一下整合素,整合素即整聯蛋白,是一類介導哺乳動物細胞黏附與信號轉導的異二聚體跨膜糖蛋白受體,由α和β亞單位組成,參與包括細胞遷移、細胞侵襲、細胞和細胞間的信號傳導、細胞黏附及血管新生過程等多種細胞活動的調節,其中對整合素αvβ3的研究最為廣泛。整
關于I超家族的基本信息介紹
已發現了幾十個I-超家族芋螺毒素(I-CTX),該家族毒素比一般的芋螺毒素要大,并且成熟肽超變異。I-超家族芋螺毒素通常由33~46個氨基酸組成,含有4對二硫鍵。分子生物學研究發現,每個芋螺毒素均有單一的mRNA編碼,原始翻譯產物是它們的蛋白前體。前體通常由N-端的信號肽,中間的Pro區和C-端
有效增加難溶肽溶解度的3種方法
多肽廣泛應用于醫藥,材料,染料等多種領域,多肽的溶解性也是關系實驗室實驗成功與否的重要因素。 一般來說,多肽的溶解性通常與整條肽鏈的氨基酸序列密切相關,通常整體顯酸性的多肽溶解困難時可以加入適量的堿性溶液,而顯堿性的多肽溶解困難時可以加入適量的酸性溶液,序列中含有大量疏水性氨基酸或中性氨基
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前導序列
中文名前導序列外文名leader sequence前導序列是結構基因中編碼區之前的一段序列,這部分序列能被轉錄,但不被翻譯,在mRNA是從5′端起至結構基因第一編碼子開始點(通常 AUG)為止,在蛋白質合成過程中不被翻譯。
MALDITOF/TOF-和LCMS/MS有什么區別
1、與LC/MS/MS相比,MALDI-TOF的識別結果不可靠,特別是當一個點中含有多個蛋白時。對于一個點的水解蛋白液來說,其中含有大量的多肽,并且經常含有修飾基團。一般來說,一個蛋白能水解出20~50種肽。用MALDI-TOF質譜測量多肽混合物時,待測組分不能完全離子化,對于一個蛋白得不到足夠的肽
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未解析碎片離子的檢索實驗——方案優化
實驗材料蛋白樣品儀器、耗材質譜儀實驗步驟除了人工解析碎片離子譜外,還有兩種基本檢索手段用于匹配數據庫中序列產生的碎片離子譜。第一種方法依靠人工解析部分譜圖來鑒別某一特定系列 (b 或v) 離子的連續離子元素(例如鑒別出相互之間相差一個氨基酸殘基質量的碎片離子),解析出部分序列信息,再結合以下參數:①
肽、多肽、活性肽與大肽如何劃分?
分子量段在50~5000之間的才能稱為肽。分子量段在5000~10000之間的稱為大肽。分子量段在50~2000之間的稱為小肽、寡肽、低聚肽,也稱為小分子活性多肽。生物學家將肽稱為“氨基酸鏈”,將小分子活性多肽統稱為“生物活性肽”。常見的有二肽(Dipeptide),三肽(Tripeptide),甚
長肽合成及難溶多肽合成技術
1. 長肽合成技術:在現代生物學研究中,經常會用到序列比較長的多肽,對于序列中含有60個以上氨基酸的多肽,通常會采用基因表達及SDS-PAGE法來獲得,但是這種方法周期長,最終產物分離效果差等,使固相法長肽合成技術成為一種需要。肽谷生物經過長期的摸索與積累,對合成工藝及方法不斷優化,解決了長肽合成難
肽質量檢索實驗
基本方案 其他方案 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 蛋白樣品