從修飾肽序列中判定修飾肽的溶解性方法
1.非HPLC純化的修飾肽中有哪些雜質?答:粗品和脫鹽級別的修飾肽中修飾肽和非修飾肽類雜質:如非全長修飾肽和修飾肽后處理的一些原料如DTT、TFA等。2.HPLC純化的修飾肽有哪些雜質?答:經過HPLC純化的修飾肽,仍會有一些一些雜質存在,其中的雜質主要是短肽和微量TFA。3.多長的修飾肽為合適?答:修飾肽合成需要考慮修飾肽的長度,電荷,親疏水性等因素。長度越長,合成粗品的純度和產率都隨著降低,純化的難度和無法合成的幾率就會大些。當然修飾肽功能區的序列是無法改變的,但是為了修飾肽的順利合成,有時不得不在功能取的上下游增加一些輔助氨基酸,以改善修飾肽的溶解性和親疏水性。如果修飾肽太短,合成也可能有問題,主要問題是合成的修飾肽在后處理過程中有一定的難度,5肽以下的修飾肽,一般要有疏水的氨基酸,否則后處理難度加大。15個氨基酸殘基以下的修飾肽一般都可以得到滿意的產率和得率。4.如何從修飾肽序列中判定修飾肽的溶解性?(1)修飾肽中如果含......閱讀全文
肽質量檢索實驗
實驗方法原理 實驗材料 蛋白樣品儀器、耗材 質譜儀實驗步驟 鑒定數據庫中已有序列的蛋白質的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切點專一的試劑水解蛋白質產生的,通常用已知切點專一的蛋白酶。(2) 這些肽段的質量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精確測定。(3) 計符蛋白序列數據庫中的每一序列被
肽質量檢索實驗_基本方案
實驗材料蛋白樣品儀器、耗材質譜儀實驗步驟鑒定數據庫中已有序列的蛋白質的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切點專一的試劑水解蛋白質產生的,通常用已知切點專一的蛋白酶。(2) 這些肽段的質量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精確測定。(3) 計符蛋白序列數據庫中的每一序列被實驗中所用水解試劑水
肽質量檢索實驗
基本方案 其他方案 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 蛋白樣品
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾(二)
(2)在整條肽中的某個Lys側鏈接入FITC,Lys側鏈為末端為-NH2的四碳直鏈烷基,直接起到了降低空間位阻的作用。這種修飾方式能夠靈活的在整條肽中任何位置進行FITC修飾,而不僅僅局限于末端。我們所采用的FITC修飾多肽的兩種形式,都具有操作簡便,成功率高,容易分離純化等優點。2.AMC修飾7-
【分享】質譜分析蛋白的原理與方法
質譜技術具有較好的靈敏度、準確度,能準確測定蛋白質。目前質譜主要測定蛋自質一級結構包括分子量、肽鏈氨基酸排序及多肽或二硫鍵數目和位置,在對蛋白質結構分析的研究中占據了重要的地位。[1,2]質譜有進樣器、離子源、質量分析器、離子檢測器、控制電腦及數據分析系統等組成。傳統的質譜僅用于小分子揮發物質
關于膠原的合成與組裝的介紹
膠原的合成與組裝始于內質網,并在高爾基體中進行修飾,最后在細胞外組裝成膠原纖維。在膠原蛋白在粗面內質網膜結合的核糖體上起始合成前α鏈,并在內質網切除信號肽,通過內質網和高爾基體的加工、修飾和組裝,形成三股螺旋的前膠原并分泌到胞外,形成原膠原最后組裝成膠原原纖維和膠原纖維。 前膠原是原膠原的前體
測定蛋白質的構型和功能要用什么儀器
構型這個概念是指 一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構型的改變往往使分子的光學活性發生變化。蛋白質的構型就是一級結構,指其氨基酸排列順序。測定蛋白質的構型的主要有兩種方法:Edman降解(Edman degradation)和質譜法。EDM
一種全新的高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
PEG-在醫藥行業主要有什么用途
1、對蛋白藥物修飾的研究及應用進展蛋白藥物的PEG修飾已卓有成效,國際知名的制藥公司已經或正在積極推進蛋白藥物的PEG修飾,1991年第一種用PEG修飾的蛋白藥物PEG-ADA被FDA批準上市,近幾年上市的有PEG-干擾素、PEG-GSF、PEG-生長抑素。目前處于臨床前研究的PEG修飾的蛋白藥物有
信號肽
信號肽用作靶向信號,使細胞轉運機制能夠將蛋白質引導至特定的細胞內或細胞外位置。雖然尚未確定信號肽的共有序列,但仍有許多具有特征性的三方結構:靠近N端的帶正電的親水區域。靠近信號肽中間的10到15個疏水氨基酸的跨度。靠近C末端的弱極性區域,通常偏愛在接近切割位點的位置具有較小側鏈的氨基酸。在蛋白質到達
科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
肽的應用抗菌活性肽
當昆蟲受到外界環境刺激時會產生大量具有抗菌活性的陽離子多肽,2013年已從中篩選出百余種抗菌肽。體內外實驗證實,很多抗菌肽不僅有很強的抗菌、殺菌能力,而且還能殺死腫瘤細胞。
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾
熒光標記所依賴的化合物稱為熒光物質。熒光物質是指具有共軛雙鍵體系化學結構的化合物,受到紫外光或藍紫光照射時,可激發成為激發態,當從激發態恢復基態時,發出熒光。熒光標記技術指利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上,利用它的熒光特性來提供被研究對象的信息。熒光標記的無放射物污染,操
PEG修飾及其修飾GLP1的意義
PEG修飾是一個使多肽或蛋白質在治療或生物技術方面的效力得以提高的重要過程。當PEG以適當的方式連接在蛋白質或多肽上時,它能改變許多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特異結合位點,可以保留下來。PEG修飾通過如下幾種途徑改善藥物的性能。首先,PEG連接在蛋白質或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽熒光標記——FITC修飾和AMC修飾
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生物質譜——蛋白質組學研究的肱股之臣
分析測試網訊 2017年11月29日,由北京大學,首都科技條件平臺主辦,安特百科(北京)技術發展有限公司(分析測試百科網)協辦的題為“生物質譜在蛋白質組學研究中的應用”的講座在北京大學化學與分子工程學院化學樓A201報告廳舉辦,來自蛋白質行業的專家學者參與了此次講座。北京大學分析測試中心、美國密
關于肽指紋圖譜測定的相關介紹
質譜技術作為蛋白質組研究的三大支撐技術之一,除了用于多肽,蛋白質的分子量測定外,還廣泛的應用與肽指紋圖譜測定及氨基酸序列測定。 肽指紋圖譜(Peptide Mass Fingerprinting PMF)測定是對蛋白酶解或降解后所得多肽混合物進行質譜分析的方法。質譜分析所得肽斷與多肽蛋白數據庫
醫美界的熱門選手-|-膠原蛋白檢測方案介紹
膠原蛋白是一類含有至少 20 種在遺傳學上不同類型的分泌蛋白質家族,主要擔任機體的結構支撐功能,具有獨特的由三條多肽鏈(被稱為 a 鏈)組成的三螺旋構型。從類型來說,可以分為Ⅰ型膠原、Ⅱ 型膠原、Ⅲ 型膠原、Ⅳ 型膠原等。其中Ⅰ型和 Ⅲ 型膠原蛋白主要存在于皮膚、肌腱、韌帶、關節等結締組織,是真皮層
核酸序列分析
【實驗目的】1、?掌握已知或未知序列接受號的核酸序列檢索的基本步驟;2、?掌握使用BioEdit軟件進行核酸序列的基本分析;3、?熟悉基于核酸序列比對分析的真核基因結構分析(內含子/外顯子分析);4、?了解基因的電子表達譜分析。【實驗原理】針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因,找出基因的位置和
磷酸化蛋白質組鑒定技術路線及經典案例
蛋白質翻譯后修飾(PTMs)幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程,并發揮十分重要的調控作用。蛋白修飾已經成為國際上蛋白質研究的一個極其重要的領域,目前研究比較成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。蛋白質磷酸化是生物體中最常見、最重要的一種蛋白質翻譯后修飾方式,它可以通過激發、調節諸多信號通路進而
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗4
五、質 譜 分 析質譜儀器的多種設計和配置都支持蛋白質組的動態性質及其相關 P T M 的研究工作 。對 鑒 定 PTM 而言,質譜儀的最重要的兩個特征(feature) 就是其質量準確度和分辨率 。與蛋白質鑒定不同 (其通常是基于鑒定同一蛋白質中的多個獨立肽段)P T M 必須通過單獨的 MS/M
關于芋螺毒素的翻譯介紹
芋螺毒素是所發現的翻譯后加工最為復雜的生物多肽。成熟毒素段的高度翻譯后修飾則是芋螺毒素多樣性的另一個重要途徑。蛋白前體中有一個可由翻譯后修飾酶類識別的特殊信號肽段。多種翻譯后修飾過程進一步生成更多新序列的芋螺毒素分子。常見的有谷氨酸γ-羧基化、脯氨酸羥基化、C末端酰胺化,此外還有一些罕見的修飾,
設計引物用cds序列和cdna序列的區別
cDNA和mRNA的序列是互補的,如果用兩個引物,最后的兩條DNA序列分別對應于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向從5‘至3’,所以兩個引物對應于mRNA和cDNA中相應序列即可。
沖激序列信號與階躍序列信號各有什么特性
單位脈沖序列只在n=0 處有一個單位值1,其余點上皆為0;單位階躍序列只有在n>=0時,才取非零值1,當n
RNA加工修飾
中文名RNA加工修飾所屬領域生物學定義RNA加工修飾,主要加工方式是切斷和堿基修飾,真核生物tRNA前體一般無生物學特性,需要進行加工修飾。
翻譯后修飾
中文名翻譯后修飾外文名Post-translational modification定義翻譯后修飾是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。
ADC-單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以...(四)
3.2 糖基化位點確定ADC 單抗蛋白與其他單抗蛋白相同,也都包含 N-糖基化修飾,一般發生在保守序列 NXS 或 NXT 中(X 為除脯氨酸外的任意氨基酸)。在糖鏈完整的情況下,直接進行 trypsin 酶解,我們在搜庫時進行 G0F 糖基化可變修飾設定,可以直接獲得該 N 糖基化位點:重
單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定-二
質譜分析條件:具體見表 4;?表 3. 氨基酸序列測定的色譜分析條件表 4. 氨基酸序列測定的質譜分析條件?2.2.3 數據分析方法采用 Proteome Discoverer 1.3 軟件對原始譜圖進行數據庫搜索,具體搜庫參數為:包含單抗氨基酸序列的數據庫;半胱氨酸(C)烷基化(+57.021
磷酸化蛋白質組鑒定技術路線及經典案例介紹
今天,小編跟您聊聊磷酸化蛋白質組鑒定! 蛋白質翻譯后修飾(PTMs)幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程,并發揮十分重要的調控作用。蛋白修飾已經成為國際上蛋白質研究的一個極其重要的領域,目前研究比較成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。 蛋白質磷酸化是生物體中最常見、最重要的