綜述:代謝組學研究加快醫學生物標志物的發現
生物標志物(Biomarker)是指“一種可客觀檢測和評價的特性,可作為正常生物學過程、病理過程或治療干預藥理學反應的指示因子”,作為個體化醫療的“關鍵詞”之一,尋找和發現有價值的生物標志物已經成為當前醫學領域的研究熱點。 01研究現狀和發展趨勢 第一個腫瘤標志物可追溯到1846年由H Bence-Jones所證實的本周氏蛋白(Bence Jones Protein),對多發性骨髓瘤有一定的診斷作用。170余年后的今天,隨著基因組學、蛋白質組學、肽組學、代謝組學等在內的組學平臺,以及包括納米技術、生物信息學、抗體芯片等前沿在內的手段與方法,都為快速獲得及篩選生物標志物帶來了極大的可能。 基因組學及轉錄組學描述的是機體可能發生改變的生理指標, 而代謝物則是存在于信號通路的終端產物,反映的是機體當時的生理狀態。與其他組學相比,代謝組學由于與表型更為接近,因此更適于疾病分型和標志物發現的研......閱讀全文
綜述:代謝組學研究加快醫學生物標志物的發現
生物標志物(Biomarker)是指“一種可客觀檢測和評價的特性,可作為正常生物學過程、病理過程或治療干預藥理學反應的指示因子”,作為個體化醫療的“關鍵詞”之一,尋找和發現有價值的生物標志物已經成為當前醫學領域的研究熱點。 01研究現狀和發展趨勢 第一個腫瘤標志物
綜述:代謝組學研究加快醫學生物標志物的發現
生物標志物(Biomarker)是指 “一種可客觀檢測和評價的特性,可作為正常生物學過程、病理過程或治療干預藥理學反應的指示因子”,作為個體化醫療的“關鍵詞”之一,尋找和發現有價值的生物標志物已經成為當前醫學領域的研究熱點。Biomarker的研究現狀和發展趨勢: 第一個腫瘤標志物可追溯到18
綜述:代謝組學研究加快醫學生物標志物的發現
生物標志物(Biomarker)是指“一種可客觀檢測和評價的特性,可作為正常生物學過程、病理過程或治療干預藥理學反應的指示因子”,作為個體化醫療的“關鍵詞”之一,尋找和發現有價值的生物標志物已經成為當前醫學領域的研究熱點。 01研究現狀和發展趨勢 第一個腫瘤標志物可追溯到1846年由H Be
如何通過代謝組學發現新的生物標志物
重癥肌無力(Myasthenia gravis,MG)是一種慢性的、讓人逐漸疲乏無力的自體免疫疾病,臨床上表現為隨意肌的受累。如果不加以治療,重癥肌無力的癥狀會加重甚至導致死亡。目前,對于重癥肌無力還沒有發現較穩定的生物標志物。因此,迫切需要一種新的診斷方法和生物標志物來提高重癥肌無力的診斷和治
代謝組學與臨床醫學的研究進展
人體是一個復雜的系統,存在于這一系統中的生物分子相互關聯、互相依賴。近年來,人們已經意識到生物學的整體復雜性以及基因構成與環境因素之間的復雜交互作用,而對這些交互作用的理解已經不能單單從基因組學、蛋白質組學或轉錄組學水平去揭示。關注生物分子之間途徑及網絡的動態變化和關系的系統生物學(system
代謝組學與臨床醫學的研究進展
人體是一個復雜的系統,存在于這一系統中的生物分子相互關聯、互相依賴。近年來,人們已經意識到生物學的整體復雜性以及基因構成與環境因素之間的復雜交互作用,而對這些交互作用的理解已經不能單單從基因組學、蛋白質組學或轉錄組學水平去揭示。關注生物分子之間途徑及網絡的動態變化和關系的系統生物學(
綜述:代謝組學在疾病中的應用
代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起,實現一次性檢測堅定上千種物質,同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點,創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測,為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。 應用代謝組學的定義事件的預測生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的?? ? ? ?代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學在口腔醫學研究中的應用現狀
代謝組是指生物體內源性代謝物質的動態整體,代謝組學是研究代謝組的一門學科,研究對象多為相對分子質量在1000以內的小分子物質。代謝組學研究目的是通過檢測代謝物水平的整體和動態變化,提取相關的生物代謝標志物群體或標志物簇,在此基礎上尋找所受影響的相關代謝途徑,確立代謝網絡調控機制。目前,代謝組學已
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
做好代謝組學研究的關鍵
首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物:(1)對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征;(2)以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點,已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次
代謝組學——腫瘤研究的利器
細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,代謝物更多地反映了細胞所處的環境,比如細胞現在是不是健康?藥物是否起效?環境污染物是不是正在傷害細胞?等等。由此,20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什么? 1、腫瘤與代謝組學 腫瘤
長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示
長生不老是人類自古以來的夙愿。 中國古代神話故事中,有菩提老祖的大品天仙訣,王母娘娘盛會上的蟠桃,太上老祖煉丹爐里的不老丹,還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中,《史記》記載秦始皇東巡碣石,攜童男童女入海求仙,尋求長生不老藥;在現代科學中,衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之
綜述-|AD的蛋白質組學格局發病機制和生物標志物新見解
導 讀 基于質譜的蛋白質組學使得對阿爾茨海默癥(AD)的蛋白質組和蛋白質翻譯后修飾(PTM)的深入剖析成為可能。在這里,我們回顧了AD蛋白質組學研究的歷史和近期的進展以及局限。作為遺傳圖譜的補充,蛋白質組學研究不僅驗證了典型的淀粉樣蛋白和tau通路,而且還發現了蛋白質網絡中的新組成部分,如RN
近億元!百趣生物完成A輪融資,加快代謝組學產品轉化
近日,代謝組學專精特新企業——上海百趣生物宣布,完成近億元 A 輪融資,本輪融資由啟明創投獨家領投。此次融資將主要用于百趣生物代謝組學科研服務儀器平臺的擴建、檢測試劑的研發及生產,促進代謝組學與蛋白質組學等多組學的技術融合,加快代謝組學產品的臨床轉化進程,推進質譜在生命科學領域的快速發展。百趣生物是
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度的穩定性、重現
代謝組學技術在臨床醫學中的應用
代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新發展起來的一門學科,它通過對人體內小分子代謝物(50~1,500 Da)進行精準定性定量,分析代謝物與人體生理病理變化的關系,研究疾病發生發展、尋找疾病生物標記物、預測疾病預后等。代謝組學在臨床診斷上將有廣闊的發展前景,主要應用方向有四個方面:在臨床診斷(B
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(二)
案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現,CrPV
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一線的醫務工作者和科研人員將有更多精力和時間對冠狀病毒進行更深一步的研究和認識。我們此次調研了基于Orbitrap超高分辨的代謝組學,脂質組學,以及藥物治療在病毒學研究中的應用。致敬白衣天使和深耕醫學研究的學者。?目前的研究顯示,新型病毒進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣,
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后,所收集到的常見問題,供大家學習和參考。Q:如何設置驗證集和測試集?A:按我理解你想問的問題是:training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念,通常
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣,中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明,已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息,減輕繁重的數據處理工作量,成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
時空組學技術助力生物學和醫學發展
一直以來,科學家們努力解讀由30億堿基對組成的生命“天書”。隨著細胞組學向時空組學的全面突破,人們可以在時間和空間的維度上,清晰地看到身體每個細胞的全景特征,為理解基因組“天書”以及生物學和醫學研究帶來新機遇。8月22日,《細胞》刊發了華大生命科學研究院團隊的綜述文章。該文章系統闡述了時空組學技術如
時空組學技術助力生物學和醫學發展
一直以來,科學家們努力解讀由30億堿基對組成的生命“天書”。隨著細胞組學向時空組學的全面突破,人們可以在時間和空間的維度上,清晰地看到身體每個細胞的全景特征,為理解基因組“天書”以及生物學和醫學研究帶來新機遇。 8月22日,《細胞》刊發了華大生命科學研究院團隊的綜述文章。該文章系統闡述了時空組
利用代謝組學發現中醫黃疸病證候的關鍵生物標記物
國際蛋白質組學領域權威雜志《Molecular & Cellular Proteomics》(5-Year IF:9.392)2012年第8期發表了黑龍江中醫藥大學中藥血清藥物化學國家中醫藥管理局重點研究室王喜軍課題組利用代謝組學全面解析中醫黃疸證的研究論文《尿液代謝組學分析黃疸證的關鍵生物
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子,按質荷比m/e大小分