馮銀剛課題組揭示新細菌轉錄調控因子的結構功能機制
近年來，在一些梭菌和桿菌中發現一類廣泛存在的σ因子及其共轉錄的抗σ因子——SigI和RsgI，它們的一些結構域和已知蛋白沒有同源性，代表了一類新的特殊的細菌σ/抗σ因子。熱纖梭菌等一些產纖維小體細菌具有8-16對的SigI/RsgI因子，這在其他已知類型的σ/抗σ因子中比較少見。已有的研究表明這些SigI/RsgI因子負責纖維小體的調控表達，但其結構與功能機制仍未闡明。最近，中國科學院青島生物能源與過程研究所代謝物組學研究組研究員馮銀剛帶領科研人員在熱纖梭菌的纖維小體調控因子SigI/RsgI的結構功能機制研究中取得新進展，相關成果發表在國際期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。 纖維小體是由一些厭氧的梭菌分泌的多酶復合體，是高效的木質纖維素降解分子機器，在木質纖維素資源的降解利用和生物技術開發中有重要的應用價值。纖維小體的酶組分受到胞外底物種類的調控，關于纖維小體調控機制的研究對理解纖維小......閱讀全文
細菌DNA轉錄偶聯修復的結構基礎
?活躍的轉錄基因中的DNA損傷修復比基因組中不活躍的區域更迅速。在細菌中，這個過程被轉錄修復偶聯因子（transcription repair coupling factor , TRCF）介導。TRCF破壞DNA損傷位點的處的RNA聚合酶，并重新啟動DNA切除修復機制（DNA excisi
研究揭示細菌固有轉錄終止的結構基礎
1月12日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心合成生物學重點實驗室張余研究團隊、美國威斯康辛大學麥迪遜分校Robert Landick團隊與浙江大學馮鈺團隊合作，在《自然》（Nature）上，發表題為Structural basis for intrinsic transcription ter
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。 實驗材料 N-表達質粒 E.coi
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編：鄭曉飛。實驗方法原理一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒儲
天津工生所藍細菌轉錄組研究獲進展
原綠球藻(Prochlorococcus)是分布在全球熱帶和亞熱帶海域的藍細菌，也是目前發現的海洋中含量最豐富的光合生物。雖然只具有極小的細胞體積(直徑約0.6 um)和基因組(可以小到～1.6Mbp)，但原綠球藻細胞數量的龐大以及高效的光合作用，使得其對于全球生物圈初級產物的生產和碳循環具
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料 N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒 儲存液緩沖液儀器、耗材 蛋白胨培養基蛋白胨平板N-表達質粒組合文庫培養板實驗步驟 ―、材料與設備1. 通過比較 β-半乳糖苷酶表達
中科院團隊揭示細菌固有轉錄的“剎車”機制
1月12日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心合成生物學重點實驗室張余研究團隊、美國威斯康辛大學麥迪遜分校Robert Landick團隊與浙江大學馮鈺團隊合作，在《自然》（Nature）上，發表題為Structural basis for intrinsic transcription termi
張余課題組揭示細菌Class－III轉錄激活機制
9月28日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心合成生物學重點實驗室研究員張余課題組在Nature Chemical Biology上，在線發表題為CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究論文，主要研究細菌
揭示腸道細菌調控表觀轉錄組修飾促進結直腸癌轉移機制
結直腸癌是常見惡性腫瘤之一，是全世界發病人數第三、死亡人數第二的惡性腫瘤。結直腸癌在我國同樣不容樂觀。盡管結直腸癌的治療手段不斷發展，但晚期轉移性結直腸癌患者的預后生存仍然不理想，我們需要對結直腸癌的轉移機制有更深刻的認識。 近年來，隨著宏基因組測序等研究手段的不斷進展，人們發現腸道菌群能廣泛
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
RNA的轉錄和逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA復制、轉錄與逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
馮銀剛課題組揭示新細菌轉錄調控因子的結構功能機制
近年來，在一些梭菌和桿菌中發現一類廣泛存在的σ因子及其共轉錄的抗σ因子——SigI和RsgI，它們的一些結構域和已知蛋白沒有同源性，代表了一類新的特殊的細菌σ/抗σ因子。熱纖梭菌等一些產纖維小體細菌具有8-16對的SigI/RsgI因子，這在其他已知類型的σ/抗σ因子中比較少見。已有的研究表明這
轉錄因子的轉錄調控區的介紹
同一家族的轉錄因子之間的區別主要在轉錄調控區。 轉錄調控區包括轉錄激活區（transcription activation domain）和轉錄抑制區（transcription repression domain）二種。近年來，轉錄的激活區被深入研究。它們一般包含DNA結合區之外的30-10
關于體外轉錄的轉錄條件介紹
轉錄模板必須滿足： 1. 在基因組全長克隆過程中，在正向引物5‘末端添加T7啟動子序列； 2. 以T7啟動子作為體外轉錄啟動子，在啟動子后面靶位序列連續帶有3個G,轉錄效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一個帽子G,有利于提高體外轉錄RNA分子的侵染活性。
關于轉錄因子的轉錄抑制區的介紹
也是轉錄因子調控表達的重要位點，但是對其作用機理研究尚不深入。可能的作用方式有三種：1）與啟動子的調控位點結合，阻止其它轉錄因子的結合；2）作用于其它轉錄因子，抑制其它因子的作用；3）通過改變DNA的高級結構阻止轉錄的發生。 轉錄因子必須在核內作用，才能起到調控表達的目的。因此，轉錄因子上的核
核轉錄分析
? ? ? ? ? ? 實驗材料 cDNA 0.45um 硝酸纖維素 尼龍膜 酵母 tRNA 試劑、試劑盒 PBS
RNA－反轉錄
? ? ? ? ? ? 實驗材料 poly(A)+RNA 反轉錄酶 鼠源反轉酶 ?或禽源反轉錄酶 試劑、試劑盒 oligo
體外轉錄
·?????????In Vitro RNA Transcription?(Promega)For?in vitro?preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f
CCAAT轉錄因子
中文名稱CCAAT轉錄因子英文名稱CCAAT transcription factor定 義可與啟動子中的CCAAT元件發生特異性相互作用的轉錄因子。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
輔助轉錄因子
中文名稱輔助轉錄因子英文名稱ancillary transcription factor定 義協助RNA聚合酶同啟動子結合，并促進已結合的RNA聚合酶啟動轉錄速率的轉錄因子。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
RNA－反轉錄
?實驗材料 poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin實驗步驟 一材料與設備1)p
轉錄因子組成
真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分：亞基RNA聚合酶的亞基，它們是轉錄必須的，但并不對某一啟動子有特異性。復合物某些轉錄因子能與RNA聚合酶結合形成起始復
轉錄的特點
轉錄時,細胞通過堿基互補的原則來生成一條帶有互補堿基的mRNA,通過它攜帶密碼子到核糖體中可以實現蛋白質的合成。與DNA的復制相比,轉錄有很多相同或相似之處,亦有其自己的特點。轉錄中,一個基因會被讀取并復制為mRNA。就是說,以特定的DNA片段作為模板,以DNA依賴的RNA聚合酶作為催化劑,合成前體
核轉錄分析
實驗材料 cDNA0.45um 硝酸纖維素 尼龍膜 酵母 tRNA試劑、試劑盒 PBS NP-40 裂解緩： 20XSSC LNaOH 甘油儲存緩沖液 10X 轉錄緩沖液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 無 RNase 的 DNase
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息，從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile)：指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
RNA的轉錄與逆轉錄相關介紹
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
信使RNA的反轉錄酶與反轉錄過程
定義：以反義RNA為模版，通過反轉錄酶，進行的RNA轉錄 1．概念反轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程，也稱逆轉錄。這是DNA生物合成的一種特殊方式。 2．反轉錄酶與反轉錄過程 反轉錄過程由反轉錄酶催化，該酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶（RDDP），即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。合
RNA復制的轉錄與逆轉錄的過程介紹
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程,經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中,再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的,以RNA分子中的一條鏈為模板,在逆轉錄酶的作用下,以四種脫氧核苷酸為原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
RNA－大量轉錄合成
? ? ? ? ? ? 實驗材料 模板 DNA 或質粒 試劑、試劑盒 TE ? TE 飽和酚 ? 氯仿