中國誕生全球首張水稻全基因組育種芯片
中國中化集團公司下屬中國種子集團有限公司聯合華中農業大學、北京大學近日共同研制出全球首張水稻全基因組育種芯片,將大幅提高種子真實性檢測準確性,有助提高育種效率,杜絕假種子危害。 中種公司生命科技中心喻輝輝博士表示,目前業內判斷水稻種子真實性通常采用國標推薦的24個SSR標記檢測結果,而新的水稻基因芯片能用分布于全基因組的約5000多個位點來判斷,可使品種真實性檢測結果更加準確可靠。 同時,該基因芯片在育種材料背景分析方面的優勢,能準確判斷育種中間材料的背景并對其精確控制,從而幫助育種家根據需要快速選擇材料特性,顯著提升水稻育種效率。 “傳統育種周期長、不可預見,全憑育種家的經驗和肉眼篩選。有了這個工具,我們可把大田搬到實驗室,進行大規模精準篩選,排除95%以上的單株,剩下少量單株種到大田,大大減少了田間工作量。”喻輝輝說,原來一個品種平均8到10年的育種周期,現在只要3到5年就可完成。 ......閱讀全文
中國誕生全球首張水稻全基因組育種芯片
中國中化集團公司下屬中國種子集團有限公司聯合華中農業大學、北京大學近日共同研制出全球首張水稻全基因組育種芯片,將大幅提高種子真實性檢測準確性,有助提高育種效率,杜絕假種子危害。 中種公司生命科技中心喻輝輝博士表示,目前業內判斷水稻種子真實性通常采用國標推薦的24個SSR標記檢測結果,
美國科學家開發全基因組測序水稻變體
水稻不僅是全球一半人口的主食,也為研究能源作物提供了模型。為優化生物燃料作物,科學家正尋找決定水稻產量、抗病性和灌溉效率等性狀的基因。 最近在《植物細胞》雜志刊登的一篇論文中,美國加州大學戴維斯分校的研究團隊與來自能源部聯合基因組研究所的合作者,宣布開發出粳稻Kitaake的第一個全基因組測
中國煙草局聯合Affymetrix成功研發煙草全基因組基因芯片
煙草全基因組基因芯片(Tiling)目前由中國煙草制作完成。該芯片是全球第一套基于全基因組水平的高密度表達譜芯片,是現有煙草基因芯片中探針密度最高、覆蓋基因數最多的一款芯片。這是在絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列精細圖譜繪制完成基礎上,我國煙草基因組計劃重大專項取得的又一項重要的標志性成果。
農科院研究揭示水稻全基因組功能單倍型自然變異特征
近日,中國農業科學院作物科學研究所(以下簡稱作科所)水稻分子設計技術與應用創新團隊構建了一個全基因組基因功能單倍型(gcHap)數據集,全面揭示了亞洲栽培稻基因功能單倍型自然變異特征,提出亞洲栽培稻多起源(馴化)假說,并開發了適用于功能單倍型數據全基因組關聯分析和全基因組預測的軟件包“HAPS”
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
水稻地方品種農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析獲進展
水稻地方品種重要農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析取得進展 近日,中國科學院北京基因組研究所/中科院上海生科院植生生態所韓斌研究員課題組,通過與中國水稻所、中科院遺傳與發育研究所、美國密歇根州立大學、華中農業大學和美國康奈爾大學等單位的研究人員合作,結合第二代測序技術和自主開發的基因
煙草和水稻葉綠體cpDNA基因組成特點
1.基因組由兩個反向重復序列(IR)和一個短單拷貝序列(short single copy sequence, SSC)及一個長單拷貝序列(long single copy sequence, LSC)組成;2.IRA和IRB長各10-24Kb,編碼相同,方向相反。3.cpDNA啟動子和原核生物的相
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同,海馬呈現高度特殊的形態,例如頭部前方具有管狀長嘴,無腹鰭和尾鰭,尾端卷曲,全身覆蓋硬骨骼,沒有鱗片
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA,解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本,不會造成偏差,擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w