引物合成介紹(1)
1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。申能博彩公司采用的合成儀主要機型為ABI3900高通量合成儀,合成長鏈主要采用Beckman 1000M和PE8909 DNA合成儀,引物修飾和高OD數合成采用ABI394等。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的特點。亞磷酰胺三酯法是將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的,合成的方向是由待合成引物的3'端向5'端合成的,相鄰的核苷酸通過3'→5'磷酸二酯鍵連接。 第一步是將預先連接在固相載體CPG上的活性基團被保護的核苷酸與三氯乙酸反應,脫去其5'-羥基的保護基團DMT,獲......閱讀全文
引物合成介紹(1)
1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種,?主要都是由ABI/PE?公司生產,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。申能博彩公司采用的合成儀主要機型為ABI3900高通量合成儀,合成長鏈主要
引物合成介紹(5)
25.用軟件設計的引物為什么不管用?答:引物是否好用,能否擴增出您需要的引物,與是否用軟件設計沒有太多的關系。引物設計有一定的指導意見,軟件就是根據這些要求設計而成。不要迷信軟件給您設計的引物,軟件中一些參數您可能不明白,弄錯了反而麻煩。其實,PCR擴增的成敗最關鍵的是反應模板的制備和反應條件的控制
引物合成介紹(4)
17.長鏈引物為什么出錯的幾率非常高?答:引物合成時,每一步反應效率都不能達到100%,產生堿基插入,缺失,置換突變的因素客觀條件都有一直存在。引物鏈越長,突變的頻率累加起來就越高。研究人員總希望合成的引物萬無一失,這種心情可以理解。但是猶如PCR擴增,不可能絕對保證擴增產物中沒有突變,引物合成也不
引物合成介紹(2)
5.需要什么級別的引物?答:引物常用的純化方式C18脫鹽,OPC純化,PAGE純化,HPLC純化。根據實驗需要,確定訂購引物的純度級別。應用???????引物長度要求???????純度級別要求一般PCR擴增??????< 45base?OPC??????>45 base?PAGE診斷PCR擴增???
引物合成介紹(3)
11.引物(含修飾)的分子量是如何確定的?答:非修飾的引物的Molecular Weight在隨引物提供的報告單上都有明確的標示。如果需要估計一個引物的分子量按每個堿基的平均分子量為324.5,引物的分子量=堿基數?x?堿基的平均分子量。或按下列公式計算MW= (NA * WA) + (NC * W
引物合成詳解
1. 引物是如何合成的? 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀,可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不
引物合成詳解
1. 引物是如何合成的? 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀,可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不
引物合成的步驟及方法介紹
Oligo DNA的人工化學合成始于50年代初期,1980年,全自動的固相DNA合成儀面市后,使得快速、高效合成Oligo DNA成為可能,這大大地推動了生物工程技術的蓬勃發展。 現在一般都采用β-乙腈亞磷酰胺化學合成Oligo DNA,將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的合成
引物合成的步驟及方法介紹
Oligo DNA的人工化學合成始于50年代初期,1980年,全自動的固相DNA合成儀面市后,使得快速、高效合成Oligo DNA成為可能,這大大地推動了生物工程技術的蓬勃發展。現在一般都采用β-乙腈亞磷酰胺化學合成Oligo DNA,將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的合成時從3'
引物合成的過程
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。? ? (1) 去保護:加入Deblocking脫去堿基上5'- OH的保護基團DMT,獲得游離的5'- OH;?
引物合成的步驟
引物合成是指通過測定引物的OD值,溶解引物,最終合成引物的一個完善的過程。目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的特點。亞磷酰胺三酯法是將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端
引物是如何合成的?
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的特點。亞磷酰胺三酯法是
引物合成如何處理?
切割與脫保護基:將合成好的寡核苷酸鏈從支持物上化學切割下來。常用新鮮的濃氨水來裂解CPG與初始核苷之間的酯鍵。斷裂下來的寡核苷酸帶有自由的3’羥基。純化:根據所合成寡核苷酸的組成和應用來選定純化的方法。常用的純化方法有:C18、OPC、PAGE和HPLC。定量:根據寡核苷酸在260nm處的紫外吸收來
引物是如何合成的?
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。(1)??? 去保護:加入Deblocking脫去堿基上5'- OH的保護基團DMT,獲得游離的5'- OH;(2)
引物合成后如何處理?
切割與脫保護基:將合成好的寡核苷酸鏈從支持物上化學切割下來。常用新鮮的濃氨水來裂解CPG與初始核苷之間的酯鍵。斷裂下來的寡核苷酸帶有自由的3'羥基。? ? 純化:根據所合成寡核苷酸的組成和應用來選定純化的方法。常用的純化方法有:C18、OPC、PAGE和HPLC。? ? 定量:根據寡核苷酸在
引物合成相關問題25答
1. 引物是如何合成的? 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀,可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和
引物合成的步驟及方法
第一步是將預先連接在固相載體CPG上的活性基團被保護的核苷酸與三氯乙酸反應,脫去其5'-羥基的保護基團DMT,獲得游離的5'-羥基;? ? ? 第二步,合成DNA的原料,亞磷酰胺保護核苷酸單體,與活化劑四氮唑混合,得到核苷亞磷酸活化中間體,它的3'端被活化,5'-羥基
引物合成及各種問題總結
1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的
概述合成cDNA引物的選擇
1、隨機六聚體引物:當特定mRNA由于含有使反轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時,可采用隨機六聚體引物這一不特異的引物來拷貝全長mRNA。用此種方法時,體系中所有RNA分子全部充當了cDNA第一鏈模板,PCR引物在擴增過程中賦予所需要的特異性。通常用此引物合成的cDNA中96%來源于rRNA
合成的引物應如何保存?
沒有溶解的引物非常穩定,可以在-20℃下保存至少1年,溶解好的引物可以事先稀釋為100 μmoL/L 的儲存液,分裝數份保存于-20℃冰箱,可以保存至少半年以上(反復多次凍融會降低使用壽命)。使用前,將濃溶液稀釋成工作液(10 pmol/ml或20 pmol/ml)后進行實驗。注意:工作液千萬別用T
最長可以合成多長的引物?
我們合成過100base的引物,但是產率很低。除非需要,建議合成片段長度不要超過80base。引物越長,出現問題的概率就越大,按照目前的引物合成效率,大于80base的粗產品,全長引物的百分比不高,后續處理還有丟失很多,最后的產量很低。
引物需要合成多少OD數?如何計算引物的濃度?
根據實驗目的確定。一般PCR擴增,2 OD引物,可以做500-1000次50ul標準PCR反應。如果是做基因拼接或退火后做連接,1 OD就足夠了。引物保存在高濃度的狀況下比較穩定。一般情況下,我們建議將引物的濃度配制成100pmol/ul,稱為保存濃度,而引物的工作濃度一般配制成10-50pmol/
分子雜交技術隨機引物合成法
隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是:(1)Klenow片段沒有5'→3'外切
引物合成常見問題解析
Q1.引物是如何合成的? 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環用時的多少。 (1) ? ?去保護:加入Deblocking脫去堿基上5'- OH的保護基團DMT,獲得游離
PCR技術是如何合成引物的
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的特點。亞磷酰胺三酯法是將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相鄰的核苷酸通過3′→5′磷酸二酯鍵連接。第一步是將預先連接在固相載體
引物合成及各種問題總結(2)
1.如何測定引物的OD值??用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量,請注意紫外分光光度計的使用,測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2-0.8之間(吸光度太高或太低會有較大的誤差)。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,取部分溶液稀釋到1ml并在1ml標準比色皿中測定其吸光度,即為所
如何利用LAMP引物設計平臺設計IMSA引物?1
IMSA,全稱為isothermal multiple-self-matching-initiated amplification,中文名為等溫多自配引發擴增。該技術的詳細介紹可見本公眾號歷史文章:“分子診斷萬花筒” 開篇——等溫多自配引發擴增技術簡介。在這里隆地熊為大家介紹一種如何利用LAMP引物
雙鏈DNA探針隨機引物合成法
? 隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是:(1)Klenow片段沒有5'→3'外切
DNA合成由RNA引物引發過程
DNA聚合酶不能發動新鏈的合成,只能催化已有鏈的延長;RNA聚合酶則不同,只要有模板存在,不需引物,就可以合成新RNA鏈。因此在體內先由RNA聚合酶合成RNA引物,DNA聚合酶再從RNA引物的3‘-OH端開始合成新的DNA鏈。催化RNA引物合成的酶稱為引物合成酶。引物長度通常只有幾個~10多個核苷酸
分子雜交技術隨機引物合成法操作步驟
(1) 200ng雙鏈DNA(1μl)和7.5ng隨機引物(1μl)混合后置于eppendorf管內,水浴煮沸5分鐘后,立即置于冰浴中1分鐘。 (2) 與此同時,盡快在一置于冰浴中的0.5ml eppendorf管內混合下列化合物: 20mmol/L DTT 1μl 未標記的dNTP溶液