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    《科學》:基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究

    3000種基因經初次篩選后,大約24個符合要求 多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點,以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術,有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》(Science)上。 2005年,美國國立衛生研究院斥資15億美元發起“癌癥基因組地圖”(TCGA)項目,目的是搜尋在很多癌癥中發生變異的基因。不過有很多科學家批評說,TCGA過分強調基因測序而忽視了功能性研究,而后者能夠確定哪種變異是最重要的。哈佛醫學院的遺傳學家Stephen Elledge就是持這種觀點的人之一。 在最新的研究中,Elledge和冷泉港實驗室的分子生物學家Gregory Hannon及同事一道,構建了新的病毒載體,每一個載體都含有一個RNA分子,用來關閉帶有補充序列的基因。載體還帶有DNA“條形碼”,這樣研究人員稍后就能確定哪......閱讀全文

    Cell特輯:癌癥標記物

      “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊,主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文,評論性文章以及snapshots,涉及了同一領域的方方面面,更為重要的是這些文章由贊助商贊助,可以免費獲取。  癌癥生物標記物是

    Cell特輯:從基因組到代謝組學——癌癥標記物的進展

      “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊,主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文,評論性文章以及snapshots,涉及了同一領域的方方面面,更為重要的是這些文章由贊助商贊助,可以免費獲取。  癌癥生物標記物是

    英國欲成為DNA檢測行業全球領先者

      新一代測序技術的快速發展帶來的對更多物種、更多個體、更多層次上進行全基因組測序以及大規模的基因組數據的分析和管理,正在成為推動生命科學創新的源泉,并將為人類重大疾病預測、預防、診斷和治療奠定基礎。正式基于這樣的共識,各國紛紛啟動自己的基因組計劃,美國建議啟動“百萬人美國人基因組計劃,英國政府正式

    AI+全基因組測序推動精準醫療發展來自紐約基因IBM新研究

      近日,美國神經學會(AmericanAcademyofNeurology)官方雜志Neurology?Genetics發布了一項研究結果,紐約基因組中心(NYGC)的研究人員、洛克菲勒大學(RockefellerUniversity)、其他NYGC成員機構及IBM公司聯合宣布,IBMWatson

    Cell:非吸煙肺癌的基因組重排早于癌癥確診前30年

      在一項新的研究中,來自韓國科學技術高級研究院(KAIST)和首爾大學等研究機構的研究人員發現早在童年和青春期發生的災難性基因組重排可導致非吸煙者在晚年患上肺癌。這一發現發有助于解釋一些與非吸煙有關的肺癌是如何產生的。相關研究結果近期發表在Cell期刊上,論文標題為“Tracing Oncogen

    頻頻被“潑冷水” CRISPR/Cas基因編輯未來究竟何去何從?

       CRISPR/Cas這項基因編輯技術自從問世以來,已經吸引了無數歡呼和掌聲,在短短幾年之內,它已經成為了生物科學領域最炙手可熱的研究工具。然而它最近也頻頻被“潑冷水”,那么基因編輯未來究竟何去何從呢?  基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現對特定DNA片段的敲除、加入等。CRI

    從基因的戰略安全性談談速食時代科學精神的缺位

      隨著人類對基因研究的不斷深入和生物技術的不斷發展,在大數據驅動的當下,作為控制生物性狀的基本遺傳單位,基因在快速被人們認知的同時,其信息安全性也成為了人們關注的焦點。  然而,破譯復雜生命遺傳密碼并不是一項簡單的工程,其極高的專業門檻使得多數人知其然而不知其所以然。人們在物質文明裹挾著快速前行的

    新方法可校正CRISPR篩選的癌癥基因依賴性數據中的假陽性

      在一項新的研究中,布羅德癌癥依賴性圖譜(Broad Cancer Dependency Map)團隊將來自342種癌細胞系的基于CRISPR的數據添加到他們不斷增加的癌癥基因依賴性目錄中,并且提供一種新的方法來確保這些數據的準確性。相關研究結果于2017年10月30日在線發表在Nature Ge

    劉小樂教授發布CRISPR實用工具

      必需基因是指細胞生存的關鍵基因。近年來,研究基因重要性(gene essentiality)的功能基因組技術發展很快。舉例來說,大規模shRNA篩選已經被用于多個細胞系,幫助人們尋找必需基因。如果一個轉錄因子使細胞在特定條件下存活,就可以用ChIP-seq鑒定其調控靶標,進而找出必需基因。最近,

    謝曉亮院士:單分子技術透視生命之謎

      2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差異。  MAL

    人工智能能幫人類更有效的抗擊癌癥嗎?

      美國科學家計劃利用人工智能對抗癌癥。  作為美國“抗癌登月計劃”、精密醫學計劃、美國國家戰略計算計劃三項國家性計劃的結晶之一,美國能源部與美國國家衛生研究院下屬的國家癌癥研究所合作,發起“先進癌癥計算解決方案的聯合設計(Joint Design of Advanced Computing Sol

    連全基因組測序也找不出原因,天知道我到底得了什么病

      根據Global Genes統計,全球大約有3.5億人患有罕見病,其中一半是兒童,約有80%的罕見病屬于遺傳性疾病。  從上世紀60年代開始,科學家們就開始對一些異常疾病進行DNA篩查;2003年,人類基因組測序完成之后,通過閱讀個體測序所得的DNA序列,將其與健康個體的DNA序列進行比較,科學

    IBM超級計算機將投身腫瘤基因組研究

           日前,IBM公司與紐約基因組研究中心(New York Genome Center;下簡稱NYGC)宣布建立伙伴關系,聯手對沃森(Watson)——曾在智力競賽節目《危險邊緣》(Jeopardy)中奪魁的計算機—— 進

    兩院院士評選中國世界十大科技進展新聞揭曉

       由中國科學院、中國工程院主辦,中國科學院學部工作局、中國工程院辦公廳、中國科學報社承辦,中國科學院院士和中國工程院院士投票評選的2015年中國十大科技進展新聞、世界十大科技進展新聞,2016年1月19日在京揭曉。  此項年度評選活動至今已舉辦了22次。評選結果經新聞媒體廣泛報道后,在社會上產生

    上海交大《柳葉刀》子刊揭示新肝癌標記物

      來自上海交通大學、復旦大學、第二軍醫大學和蘇州大學附屬第一醫院等多家機構的研究人員在一項大規模、多中心的研究中就測量血清 Dickkopf-1 (DKK1)是否能改善肝癌的診斷準確性進行了評估。研究結果證實血清DKK1可作為一種有效的肝癌診斷蛋白質標記物。相關研究論文發布在6月26日的《柳葉

    “垃圾DNA”中發現潛在癌癥病源

      人類基因組中僅有1%~2%是負責蛋白質編碼的基因,其余非編碼區域早先被認為是毫無用處的“垃圾DNA”。但是,美、英等國研究人員最近在這個“垃圾”區域中找到近百個乳腺癌與前列腺癌的潛在“導火索”,提示研究“垃圾DNA”對了解癌癥的重要性。   美國耶魯大學、英國韋爾科姆基金會桑格研究所等機構的研

    北大謝曉亮教授:單分子技術透視生命之謎

    2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差

    2020年CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。圖片

    科學家揭開“垃圾”DNA的神秘角色!

      生物學家們在很長一段時間里都認為,既然幾乎所有具體的生理機能都要由蛋白質來完成,那么不編碼蛋白質的DNA應該是沒有用的,可以稱為“垃圾DNA”;而且人類基因組項目發現人的基因組中僅有1.5%的序列是給蛋白質編碼的,其余的98.5%的序列是以前認為的“垃圾”DNA。  此前研究人員進行了一項名為E

    Science:外顯子組測序讓“生命密碼”解讀更容易

            簡單來說,外顯子組就是遺傳代碼中蛋白質編碼的組分,占整個基因組的1%-2%。測序儀每跑一次僅能讀取一定數量的堿基,但通過測序外顯子組,研究人員能更快地生成更多的堿基。與全基因組相比,它也可以用更低的成本做出更好的分

    新型單細胞擴增技術有助避免遺傳病

      中美研究人員在新一期美國《科學》雜志上報告說,他們研制出一種新型單細胞全基因組擴增技術,在此基礎上不僅有望避免許多遺傳性疾病遺傳給后代,從基因組角度更深入地認識癌癥也將成為可能。  單細胞研究是當前生命科學研究的重要方向之一。許多關鍵的生命活動都和細胞間個體差異密切相關;許多重要的生命科學和醫學

    2019年,中國“大農業”里那些高科技

       今年,我國“大農業”科研領域又誕生了諸多令人驚奇的發現,每一條都與我們息息相關。它們涵蓋了觀賞農業、林業、作物、醫學等各個領域,包括睡蓮、玉米、硅藻等進展。為了展現這些成就,本報特此就我國農業科學家今年發表的大部分重要論文進行梳理,以饗讀者。野生玉米大芻草、SK、現代玉米自交系ZHENG58的

    新技術能窺探更細微基因變異

      中美研究人員在新一期美國《科學》雜志上報告說,他們研制出一種新型單細胞全基因組擴增技術,在此基礎上不僅有望避免許多遺傳性疾病遺傳給后代,從基因組角度更深入地認識癌癥也將成為可能。  單細胞研究是當前生命科學研究的重要方向之一。許多關鍵的生命活動都和細胞間個體差異密切相關;許多重要的生命科學和醫學

    30億 癌癥“登月”計劃啟動

      美國最大的癌癥中心——德州大學(UT)MD Anderson癌癥中心9月宣布,推出一項“登月”計劃,將針對幾種類型的癌癥,在未來的十年中集中研究,希望顯著提高癌癥生存率,這項計劃預期資助力度為30億美元。不過也有一些外界研究人員對于只通過一個機構就能克服癌癥表示遲疑。   這項計劃的背后是

    利用真實世界數據,驗證癌基因組學特征與臨床結果聯系

      近日,在一項發表在《美國醫學會雜志》(JAMA)上的最新研究中,來自美國Flatiron Health和Foundation Medicine公司的研究人員利用大型臨床基因組學數據庫,證實了以前已知的非小細胞肺癌(NSCLC)患者基因組學特征與臨床結果的聯系,并證明了利用病人日常護理過程中獲得的

    癌癥已成兒童主要殺手 為何我們的研發投入卻遠遠不足

      中國兒童癌癥患者數量一直在持續攀升,癌癥已經是15歲以下兒童死亡的第二大原因。  癌癥,整體來說是一種老年病:隨著年齡的增加,癌癥發病率逐年增高,近90%的癌癥患者在50歲以上。由于人口老齡化,不健康生活方式流行,環境污染等因素,中國近期癌癥發病率呈現指數式增長,如何防癌抗癌成了越來越多人關注的

    系統生物學的前世今生--P4 China北京2016國際精準醫療大會

      系統生物學是以一種新角度從生物動力學系統出發進行研究的,其具有信息學科特點。在醫藥方面,它以生物網絡角度來分析疾病的原因。系統生物學使我們獲得了以前未知的信息。事實上,系統生物學和人類基因組計劃有著密切的關系。在基因組學、蛋白質組學等新型學科發展的基礎上孕育了系統生物學。系統生物學的誕生又進一步

    癌癥治療新曙光:癌癥建模

      現在科學家們將患者的腫瘤細胞接種到小鼠體內,進而建立腫瘤模型,以用于分析和開展藥物測試。目前研究人員已鑒定了一系列小兒實體腫瘤模型,同時相關數據的允許免費獲取。  罕見癌癥的研究面臨著兩方面的挑戰:可用的腫瘤樣本少;缺乏相應的小鼠模型。最近科學家們非常成功地開發了將人類腫瘤細胞高效移植到免疫缺陷

    NCI-MATCH驚現“贗品樣本”,美“精準醫療”項目進程被耽擱

      2015年7月,美國國家癌癥研究院(NCI)拋出了NCI-MATCH試驗計劃,也被稱作EAY131研究,計劃招募3000名志愿者進行腫瘤靶向藥物的臨床研究,整合了以特定基因突變為靶點的20余種在研藥物或藥物組合,從而將試驗中的各例患者與針對其腫瘤分子異常的治療加以匹配。  2015年8月的時候已

    Facebook創始總裁創辦研究所,組建消滅癌癥強大軍團

      編者按:癌癥是世界上最具毀滅性的疾病之一。三分之一的女性和二分之一的男性有可能會在一生中會遇到癌癥。我們該怎么打敗它?   作為一個成功的科技企業家,肖恩·派克(Sean Parker)曾與扎克伯格一起創立在線社交網絡公司Facebook,并擔任創始總裁。由于自身過敏和免疫疾病,派克很早就對免

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