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  • 發布時間:2016-04-19 15:18 原文鏈接: QIAGEN推出液體活檢新產品

      也許你正在用Apple Pay,但是你大概還不知道,液體活檢(Liquid biopsy)與Apple Pay一樣是2015年度的十大突破技術。這是一種非侵入性的方法,可以利用體液(如血液),在癌癥等疾病的早期檢測和分析疾病,帶來更好的預后和治療。

      為了促進液體活檢研究的數據分析,QIAGEN公司近日推出了RNA-seq Explorer Solution。這是一種新的工具,整合了Ingenuity? Pathway Analysis?、Biomedical Genomics Workbench?及其他QIAGEN生物信息學方案,有助于改善癌癥的檢測、診斷和治療。

      RNA-seq Explorer Solution促進了生物標志物的發現和驗證,讓研究人員能從FASTQ格式的原始數據中獲得重要線索,從而追蹤癌癥的遺傳驅動因素。這個方案利用Ingenuity Pathway Analysis(IPA),基于后臺高度結構化的Ingenuity Knowledge Base實現表達數據的分析、整合和理解。它還整合了Biomedical Genomics Workbench,為NGS實驗結果的比對、標準化和統計分析提供了全面的分析流程。

      “RNA-seq Explorer Solution帶來了強大的生物信息學工具,適用于液體活檢樣本RNA測序數據的分析和解釋,包括腫瘤來源的exosomes。液體活檢的新一代測序是檢測和鑒定癌癥最有前途的方式之一,但是需要高度準確的工具來理解帶有噪音的數據,”QIAGEN生物信息學部門的高級副總裁Laura Furmanski談道。

      液體活檢的分析對象有好幾種,包括循環腫瘤細胞(CTCs),從腫瘤上脫落的活細胞;循環腫瘤DNA(ctDNA),來自死細胞的遺傳物質;以及外泌體(exosomes),在體液中循環的微囊泡。

      對于這些樣本的分析,QIAGEN都提供了相應的產品。例如,QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit可從人類血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA,用于特異性的腫瘤檢測。同時,QIAGEN的單細胞全基因組/全轉錄組擴增方案可讓你輕松跨過樣本量低的限制,幫你深度解析CTCs內隱藏的信息。

      此外,QIAGEN也推出了一種基于離心柱的簡便方法來分離細胞外囊泡,并提取出其中的RNA。有了exoEasy Maxi Kit,25分鐘即可完成exosomes的分離。exoRNeasy Midi和Maxi試劑盒在此基礎上,分離出樣本中的RNA,用于后續的RNA-Seq分析。

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