SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測外源蛋白的表達

[實驗原理]

SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS—PAGE）是蛋白分析中經常使用的一種方法。它是將蛋白樣品同離子型去垢劑十二烷基硫酸鈉（SDS）以及巰基乙醇一起加熱，使蛋白變性，多肽鏈內部的和肽鏈之間的二硫鍵被還原，肽鏈被打開。打開的肽鏈靠疏水作用與SDS結合而帶負電荷，電泳時在電場作用下，肽鏈在凝膠中向正極遷移。不同的大小的肽鏈由于在遷移時受到的阻力不同，在遷移過程中逐漸分開，其相對遷移率與分子量的對數間成線形關系。

pGLO是將綠色熒光蛋白（GFP）的基因克隆在阿拉伯糖啟動子之后的一種表達載體。攜帶有pGLO的大腸桿菌在含有相應誘導物和素的條件下培養，可以表達GFP，這比不加誘導物的同樣的大腸桿菌在SDS—PAGE凝膠上要多出一條明顯的條帶。表達的蛋白也可用非變性的聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測，紫光燈下可以看到誘導后的樣品在凝膠上有綠色熒光條帶出現。還可以通過**印跡染色（Western—blotting）的方法，用GFP的抗體檢測表達的外源蛋白。

[儀器、材料和試劑]

(一)儀器

1．垂直板電泳槽及配套的玻璃板，梳子

2．電泳儀

3．干式恒溫培養器

4．微波爐

(二)材料

1． pGLO表達質粒轉化的大腸桿菌的培養物：用阿拉伯糖誘導的和沒有加阿拉伯糖誘導的

(三)試劑

1．1.5mo1／L  Tris-HCl pH 8.8  (已加SDS )

2．0.5mo1／L  Tris-HCl pH 6.8  (已加SDS)

3．10％SDS

4．30％Acr／Bis  29.2g Acr + 0.8gBis，用雙蒸水定容至100mL，過濾備用，4℃存放。

5．10％Ap (-20℃存放)

6．2x樣品緩沖液

0.5mo1／L Tris-HCl pH6.8       2mL

甘油                           2mL

20％SDS                       2mL

0.1％溴酚藍                    0.5mL

2—?—巰基乙醇                 l.0mL

雙蒸水                         2.5mL

7．5x電極緩沖液

Tris      7.5g

G1y     36 g

SDS      2.5g

雙蒸水溶解，定容至500mL，使用時稀釋5倍使用

8．染色液：0.2g考馬斯亮藍R250 + 84mL 95％乙醇 + 20mL冰醋酸，定容至200mL，過濾備用。

9．脫色液： 酒精：冰醋酸：水＝7.5：7.5：85

[實驗步驟]

1．裝配做膠用的玻璃板"三明治"：做1.0mm厚的膠。選擇兩側的玻璃夾條為1mm的玻璃板，將其夾條面朝上平放在桌面上，把灰色的U形硅膠夾條在上面擺好，然后把帶兩個“耳朵”的凹玻璃放在上面，使U形硅膠夾條平整、服帖地夾在兩塊玻璃板之間。小心地把這玻璃板“三明治”放到“提籃架子”上，用塑料的“楔子”夾緊，注意底部的U形硅膠夾條在夾緊的過程中依然保持平整、服帖。在玻璃板“三明治”的夾縫加滿蒸餾水，檢驗是否漏，如果漏水必須重裝。

2．配制濃度為12％的分離膠 (凝膠濃度應根據被分離蛋白的分子量進行選擇)，配方如下：

雙蒸水                           3.3 mL

1.5mo1／L Tris-HCl (pH 8.8)            2.5 mL

Acr／Big(30％)                     4.0 mL

10％ SDS                         100 μL

TEMED                           10 μL

10％AP                          100 μL

總體積                           10 mL （剛好灌制兩塊膠）

混勻后加入兩玻璃夾縫中，并小心在膠面上加入1cm蒸餾水(在膠面上加蒸餾水稱水封，目的是保持膠面平整，并防止膠與空氣接觸，影響膠的聚合)，室溫放置，等膠自然凝聚后（此時在膠面與水封之間可見清晰的界限），將水封傾去。這時可以開始配制4％的濃縮膠，配方如下：

雙蒸水                         1.8 mL

0.5mo1／L Tris-HCl pH 6.8           0.75mL

Acr／Bis (30％)                  0.4 mL

10％ SDS                        30 μL

TEMED                           5μL

10％Ap                           30μL

總體積                         3.0 mL （夠做兩塊板的濃縮膠）

混勻后加入到"三明治"玻璃板的夾縫中，然后在把1mm的梳子**濃縮膠中，注意在梳子和濃縮膠之間不要留有氣泡。如果發現有較大的氣泡，一定要想法去掉（可以插拔梳子或指彈氣泡處的玻璃等），否則會影響電泳結果。待濃縮膠凝固后，小心拔出梳子。如果發現拔出梳子后形成的加樣孔之間的間隔發生扭曲，用注射器的針頭小心加以整理，使之齊整。

3．培養物SDS-PAGE樣品的制作：同時做L-阿拉伯糖誘導的和未加L-阿拉伯糖的兩個大腸桿菌樣。取培養物1.5mL加到1.5mL小離心管中，12000r/m離心3分鐘，去上清。在離心沉淀中加約等體積的蒸餾水，用槍頭小心地吹打，使充分懸浮，直到沒有明顯的小團塊，然后加入等體積的2×樣品緩沖液，在100℃沸水浴(或干式培養器)中保溫5min。此時如用槍頭吸取樣品，會發現非常粘稠，呈鼻涕狀，這是因為有樣品中含有大量DNA的結果。要用胰島素注射器將樣品從極細的針頭中打出，反復多次才能將DNA分子打斷，使樣品變得不再粘稠為止。將樣品14000r/m離心5分鐘，使不溶物沉淀下來，小心吸取上清加樣。電泳樣品的處理直接關系到電泳結果的好壞，一定要認真做樣，否則跑不出好膠來。

4．瓊脂封底：做好膠后，把玻璃板“三明治”從架子中取出，將兩玻璃板之間的硅膠夾條去掉。去掉夾條后在凝膠的底部會留下一空隙，此空隙要用2%融化的瓊脂填滿，否則在玻璃板浸到電極緩沖液后空隙中的空氣將很難徹底排除掉，電泳時會明顯影響導電，嚴重時會使整個電泳失敗。瓊脂封底時注意不要產生氣泡。

5．電泳槽組裝：封底后將玻璃板“三明治”凹玻璃面向內重新裝到“提籃架子”上，固定好后，將整個部件放到電泳槽的外殼中，然后加電極緩沖液。加液時要使內外槽中的液面基本等高，內槽液的液面要高出玻璃板“三明治”的凹玻璃至少5mm，以保證能夠導電，且電場均勻。

6．加樣：按事先設計好的順序與加樣量依次加樣。在樣品的濃度未知的情況下，同一樣品可加一梯度，即每一泳道的加樣量依次減半。這樣，在做第二次電泳時可以其作為參考，正確加樣。蛋白分子量標準可以加在靠中間的加樣孔中，也可加在離邊的第2道處（靠邊的一道樣品往往會明顯跑斜）。

7．電泳：將電泳槽的蓋子蓋上，把電泳槽的兩個電極接到電泳儀上（注意電極不要接錯），然后接通電源。先將電壓調到80V，當樣品進入分離膠時，調節電壓使恒定在150V。當溴酚藍移動到離底部約0.5cm時，關掉電源，停止電泳。將玻璃板從電泳槽中取出，小心地用舊的電話卡撬開兩玻璃板，暴露出膠面。將濃縮膠部分去掉不要，分離膠放到塑料盒中染色。

8．染色和脫色：凝膠在考馬斯亮藍染色液中染色20分鐘（搖床上緩慢振蕩），然后傾去染色液（染色液回收，可反復用數十次），用自來水洗幾下，去掉凝膠上和塑料盒中的染色殘液，加脫色液脫色（搖床上緩慢振蕩），1小時后換一次脫色液，振蕩脫色過夜。徹底脫色后的凝膠蛋白條帶清晰，背景透明干凈。這時可以將凝膠拍照或用掃描儀進行掃描，作為記錄。