質譜鑒定常見問題解答
1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的結果從而實現蛋白質的鑒定。二級質譜能夠得到部分肽短的序列,具有更高的可靠性。隨著現在雜志對數據的要求越來越嚴格,二級質譜鑒定是蛋白鑒定的大趨勢,而且即使目前做一級質譜鑒定的結果,也需要挑選部分PMF結果做二級質譜驗證。 2. 研究的物種不是模式生物怎么辦? 答:可以參考親緣關系最近的模式生物做比對而實現蛋白質的成功鑒定,如果質譜圖很好而沒有鑒定結果說明這是一個全新的蛋白,可以采用de-novo等技術做深入分析與鑒定。 3. 該如何評價質譜效果的好壞? 答:做PMF一般得分超過60分(P<0.05)就算成功鑒定,而......閱讀全文
質譜鑒定,常見疑問解答
問題1、一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?答:一級質譜鑒定的方式主要為胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定;二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的
蛋白鑒定方法之質譜相關技術
質譜已成為連接蛋白質與基因的重要技術,開啟了大規模自動化的蛋白質鑒定之門。 用來分析蛋白質或多肽的質譜有兩個主要的部分,1)樣品入機的離子源,2)測量被介入離子的分子量的裝置。 首先是基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)為一脈沖式的離子化技術。 它從固相標本中產生離子,并在飛
質譜鑒定微生物的原理
在應用MALDI-TOF MS時,通常將微生物樣本與一種飽和的低分子量無機化合物溶液(稱為基質)進行混合加在靶板上,待干后樣本與基質共結晶后形成了以基質包裹構架的樣本固體沉淀。樣本基質結晶體經激光輻射,基質從激光中吸收能量使樣品吸附,基質與樣品之間發生電荷轉移使得樣品分子電離,離子在加速電場下獲
質譜鑒定常見問題解答
1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合
質譜鑒定常見問題解答
1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF
細菌鑒定讓MALDI-TOF質譜煥發青春
? ? ? MALDI,即基質輔助激光解析電離(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization),是指離子源,也就是激發部分。這就好像是槍支的子彈,有圓形單頭和尖形單頭,有的善于穿甲、有的善于爆破。MALDI離子源屬于軟電離,相比之下還有其他離子源,其電離方
好消息 美研究人員開源了脂質質譜鑒定軟件LIQUID
分析測試百科網訊 近日,一份基于LC-MS/MS ,針對脂質鑒定的開源軟件被發布出來。 脂多糖在許多代謝疾病中起關鍵作用,包括高血壓,糖尿病和中風。因此,身體的脂質-其“脂質體”的完整概況非常重要。 脂質體研究通常基于與串聯質譜聯用的液相色譜(LC-MS / MS)。但是研究人員很難快速處理
奧美拉唑藥物雜質高分辨質譜快速鑒定(二)
II. Mass Frontier 用于未知物的結構鑒定采用Mass Frontier 的“碎片離子搜索”(FISh)功能處理HRAM 全掃描和 MS/MS 數據,見圖 3-a。 FISh 能輕易識別出與母體化合物具有相同碎片離子的化合物,見圖 3-b,并根據碎片推斷出可能的雜質結構,見圖
你必須知道的質譜鑒定中14條FAQ
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,不過,目前的應用還不是特別廣泛。那么,有問題了怎么解決呢?本文收集了相關的新手對于這項技術的常見問題與解決方法。希望能更好地幫助大家了解這項技術。 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式
你必須知道的質譜鑒定中10條FAQ
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,應用前景十分廣泛。那么,有問題了怎么解決呢? 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(peptide-mass mapping, PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分