WIKI資訊
北卡羅來納大學的研究人員近日開發出一種全基因組范圍的測序分析，可定位DNA切除修復。這種被稱為切除修復測序（XR-seq）的方法發表在新一期的《Genes & Development》雜志上。 這項研究的通訊作者是北卡羅來納大學醫學院生物化學及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大學人類遺傳學系的Jason D. Lieb。Sancar在一份聲明中表示：“在60億個堿基對中，挑選出一個位點，我們將告訴你它是如何修復的。” 當紫外線（UV）或其他一些物質造成基因組損傷時，此位點的一些DNA片段被切下，隨后與TFIIH蛋白結合。利用與酶結合的抗體，研究人員能夠分離出DNA片段-蛋白質復合物，并將它們拉出細胞，進行測序。然后研究人員能夠將片段定位回基因組中，顯示DNA修復發生在哪個位置。 據研究人員介紹，對于細胞中兩種類型的UV誘導損傷：環丁烷嘧啶二聚體（CPD）和(6-4)嘧啶-嘧啶酮光產物（(6-4)PP......閱讀全文
(六)產前DNA測序：成長的煩惱 自香港科學家盧煜明(音譯)在1997年發現孕婦血液中存在胎兒DNA這一現象至今，無創產前DNA測序以前所未有的速度從實驗室邁向市場。胎兒全基因組測序已經成為基因組革命的下一個前沿領域，隨著測序技術的發展，胎兒全基因組測序也不再只是一個技術問題，而成為一個重
摘要： CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術（也稱高通量測序技術），是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用，有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢？在哪些研究領域或方向上可以聯用呢？上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗
2018年，各國科學家繼續卯足了勁，對本國的珍（qi）稀（pa）動物進行基因組測序。他們的目標是保護瀕危動物（如考拉、金槍魚），對付入侵物種（如小龍蝦、海蟾蜍），抑或是從中發現長壽的秘密（如烏龜、鸚鵡）。 與之前采用單一技術的研究不同，如今的基因組測序研究大多結合Illumina短讀長和Pac
1月20日，滬上百余位知名媒體人及社會各界名流云集悅達889廣場6樓云健康醫療科技集團總部（Cloud Health Medical Group，Ltd），共同見證航母級健康平臺——云健康的上海首度公開亮相。當天云健康宣布啟動 Illumina HiSeq X Ten 全基因組測序，同時旗下云健
Roche 454（GS FLX Titanium System）超高通量測序技術原理2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸測序法的超高通量基因組測序系統——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》雜志以里程碑事件報道，開創了邊合成邊測序的先河。2007
四．CRISPR/Cas9技術與新一代測序技術的聯用 革命性技術總是發展迅速、應用廣泛的。作為另一項革命性的生命科學研究技術，DNA新一代測序技術在近五、六年得到快速發展和推廣。它已經用于生命科學相關領域的許多方面。同樣地，也可以用在CRISPR/Cas9相關的研究中。兩者之間的應用領域有
David Roy Smith是來自加拿大韋仕敦大學的一位生物學助理教授，近期他在The Scientist雜志上發文，指出目前涌現了太多線粒體基因組測序論文，2014年GenBank中新增的線粒體基因組序列信息多達上千條，這幾乎比上一年激增了15%。 Smith指出，很少有人會質疑這些線粒體
隨著測序成本的持續下降，人們已經破譯了許多生物的基因組。不過新一代測序產生的讀取數據大多比較短，在分析重復元件的時候存在一定的技術限制，而這樣的元件在人類基因組很常見。為了更好的描述人類的復雜基因組區域，可能還需要用到其他的基因組分析技術。 暨南大學和南加州大學的研究人員通過長讀取測序技術從頭
青藏高原平均海拔超過4000米。大多數人在那里會遇到問題，因為隨著海拔升高，除氣壓外，氧分壓也會隨之降低，帶來的后果就是呼吸困難和高原病。因此動物如何應對高海拔地區缺氧環境的快速適應機制也就成為了科學家們關注的熱點問題。 近期來自云南大學、中科院昆明動物研究所、中科院北京基因研究所等
大千世界無奇不有，這都是進化的功勞。大航海時代，科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今，科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，我國學者參與的兩項測序研究格外引人注目。 種屬：虎鯨（Orcinus orc
近年來，隨著全基因組測序所需時間和成本的降低，個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明，開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析，有助于預測患者的預后，幫助患者選擇最佳的治療方案。 全基因組測序（Whole-genome seque
2015年12月24日，中國深圳--全球最大的基因組研發機構華大基因今天宣布與實時單分子測序技術（SMRT）領導者加利福尼亞太平洋生物科學公司（Pacific Biosciences of California, Inc.，以下簡稱PacBio）再次合作，購入亞洲第一臺Seque
12月24日，華大基因宣布與實時單分子測序技術（SMRT）領導者加利福尼亞太平洋生物科學公司（PacificBiosciencesofCalifornia,Inc.，以下簡稱PacBio）再次合作，購入亞洲第一臺Sequel測序系統，并有后續購買計劃，會將SMRT測序平臺納入其全球業務。今年初華
即將在本周《美國科學院院刊》（PNAS）的網絡版上發表的一篇論文中，一個國際研究小組介紹了一項利用高通量的轉錄組測序來發現乳腺癌細胞系中的基因組重排的原理論證研究。美國克萊格凡特研究院（J.Craig Venter Institute）、Lugwig癌癥研究所的三個分所、以及紐約斯隆-凱特琳癌癥
大姑娘出嫁——頭一回!3月10日出版的國際頂級學術期刊《科學》,以封面的形式同時刊發了中國科學家的4篇研究長文! 由天津大學、清華大學和華大基因分別完成的這4篇長文,介紹了真核生物基因組設計與化學合成方面的系列重大突破:完成了4條真核生物釀酒酵母染色體的從頭設計與化學合成——要知道,釀酒酵母總
如今，在生物制造技術方面，合成生物技術已經成為綠色生物制造產業高速發展的引擎。利用合成生物技術改變傳統的工業生產方式，將減少對自然資源的依賴，以更小的環境代價獲得高經濟產出，破解資源、能源、健康、環境、安全等重大難題。 在我國的“十三五”科技創新戰略規劃中，合成生物技術已被列為重點發展方向，到
遺傳疾病是指由于遺傳物質的改變導致的疾病，能夠通過生育遺傳給后代，是困擾人類健康的一類重要疾病。徹底根治遺傳疾病的方法是通過基因治療的手段在生殖細胞中修復改變的遺傳物質，并將正確的遺傳物質傳遞給下一代，產生健康的個體，從而在人群中徹底清除遺傳缺陷。然而，目前存在的基因修飾手段不能有效地在生殖細胞
12月5日，《細胞研究》期刊在線發表了中科院上海生科院生化與細胞所李勁松研究組和吳立剛研究組以及北京大學湯富酬研究組的一項合作研究成果，研究人員利用CRISPR-Cas9技術，在小鼠的精原干細胞中修復了遺傳缺陷，產生了完全健康的后代。專家認為，這項研究為人類基因治療提供了一個新的思路。 據悉，
本文中，小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果，與大家一起學習！ 【1】Cell：開發出空間單細胞測序技術，有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎 doi：10.1016/j.cell.2017.12.007 在一項新的研究中，來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳
今年，我國“大農業”科研領域又誕生了諸多令人驚奇的發現，每一條都與我們息息相關。它們涵蓋了觀賞農業、林業、作物、醫學等各個領域，包括睡蓮、玉米、硅藻等進展。為了展現這些成就，本報特此就我國農業科學家今年發表的大部分重要論文進行梳理，以饗讀者。野生玉米大芻草、SK、現代玉米自交系ZHENG58的
隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域，要想提供蛋白因子直接調控的證據，需要直接檢測蛋白質-DNA的相互作用，而染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）就是一種研
在2013年，來自麻省總醫院的研究人員發現使用CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶的一個重要局限：會在預期靶點以外的位點上生成多余的DNA突變。此后陸續有研究直接說明了CRISPR/Cas9存在嚴重的脫靶性，即該技術可以發生非特異性切割，引起基因組非靶向位點的突變，這樣會造成研究結果的不確定
新興的CRISPR技術在短短一年多的時間內掀起了基因組編輯的熱潮。然而，對于這些基因改造手段的效率和結果，我們仍難以評估。目前的一些工具如熒光報告基因、克隆分析，缺乏生成報告細胞系時所需的靈敏度。高通量測序方法雖然能克服這一問題，但無奈讀長太短，而供體DNA模板往往很長。 到目前為止，還沒
目前，三分之一的世界經濟是由生物技術驅動，生物技術在醫藥、農業等領域正在發揮越來越重要的作用。可以說，整個世界都在圍繞DNA發展。 隨著基因技術的不斷進步，獲取、解讀DNA序列的成本也會越來越低。預計到2020年，人類基因組測序就會變得像沖馬桶一樣不費吹灰之力。而普通人利用生物技術來提升生活質
我們身體細胞內的DNA每日都會由于各種原因而受損，因此可以說細胞間DNA修復系統是維持生命的基礎，但是對于這個基礎機制科學家們并沒有完全弄明白。近期來自北卡羅來納州大學教堂山分校的研究人員利用先進的測序技術，分析澄清了這些修復系統中的關鍵分子細節，發現了核苷酸切除修復的奧秘。 這一研究成果公布
本周又有一期新的Science期刊（2019年4月19日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。圖片來自Science期刊。 1.Science：開發出一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法---DISCOVER-Seq doi:10.1126/science.aav9023； doi:1
來自中科院遺傳與發育生物學研究所、深圳華大基因研究院和亞利桑那大學等機構的研究人員完成了對短花藥野生稻(Oryza brachyantha)的全基因組測序，并揭示出了稻屬基因組進化的機制。相關成果發表在3月12日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。
編者按：癌癥是世界上最具毀滅性的疾病之一。三分之一的女性和二分之一的男性有可能會在一生中會遇到癌癥。我們該怎么打敗它？ 作為一個成功的科技企業家，肖恩·派克（Sean Parker）曾與扎克伯格一起創立在線社交網絡公司Facebook，并擔任創始總裁。由于自身過敏和免疫疾病，派克很早就對免
據《新科學家》雜志網站5月30日報道，美國科學家通過全基因組測序發現，CRISPR基因編輯技術能引起基因組內大量非靶標區內的基因發生突變，包括1500多種單核苷酸突變和100多種大片段序列的敲入和敲除。發表在《自然·方法學》雜志上的這一論文表明，CRISPR的脫靶效應可能遠超人們此前的估計。
2016年，David Liu團隊在 Nature 期刊上首次報道了基于胞嘧啶脫氨酶APOBEC1（能催化C脫氨基變成U，而U在DNA復制過程中會被識別成T）和尿嘧啶糖基化酶抑制劑UGI（能防止尿嘧啶糖基化酶將U糖基化引起堿基切除修復）的單堿基編輯工具（BE3）首次實現可以在不引入DNA雙鏈斷裂