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一些研究表明，目前已經公布的基因組存在多種污染，隨著這個問題越來越突出，我們需要找出方法來應對 Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為了比對這些微生物的代謝途徑，但后來他發現了幾乎無處不在的序列，“我以為我們發現了一些新的東西，”他回憶道，“在這些不同的微生物中，這整個噬菌體基因組是完整地保留下來的。” 但當Mukherjee一開始分析這個噬菌體序列時，他就知道這就是 PhiX 序列，一種Illumina公司測序試劑盒中用做標準品的噬菌體。PhiX 本來是作為一種質控檢測指標，用于追蹤每個測序過程中出現的錯誤率的，但在上百個案例中，Mukherjee發現研究人員都沒有從其公布的基因組序列中剔除Phi X的序列。 并不是只有Mukherjee一人發現此種情況，最近大量的報告表......閱讀全文
結核桿菌可以導致全身性疾病，特別是在發展中國家，其發病率較高，危害性極大.近幾年結核桿菌的變異性較大，對抗癆藥物的耐藥性增加，從而使結核病的發病大幅度增高.雖然傳統的涂片抗酸染色、細菌培養以及胸片檢查對大部分結核能作出正確的診斷，但對某些病人亦可造成誤診或漏診;動物接種雖特異性較高，但因時間較長
核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性，它已成為分子生物學中最常用的基本技術，被廣泛應用于基因克隆的篩選，酶切圖譜的制作，基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下（適宜的溫室度及離子強度等）可按堿基互補原成雙鏈。雜交的
Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。并不是只有Mukherjee一 人發現此種情況，最近大量的報告表明，發表的基因組出現污染要比之前想象的多得多。那么這些污染是如何出現的呢？我們又能做些什么，避免這些
概念 引物，是一小段單鏈DNA或RNA，作為DNA復制的起始點，在核酸合成反應時，作為每個多核苷酸鏈進行延伸的出發點而起作用的多核苷酸鏈，在引物的3′-OH上，核苷酸以二酯鏈形式進行合成，因此引物的3′-OH，必須是游離的。類型 存在有自然中生物的DNA復制引物（RNA引物）和聚合酶鏈式反應(
在新世紀之初，由于全球人增地減、資源匱乏，人類對環境的依賴性愈來愈強烈。隨著人類的生活要求和工農業生產的迅速發展，大量人工合成的并難以被天然微生物迅速降解轉化的污染性化合物進入到自然環境中，成為嚴重威脅人類及其他生物正常生存發展的土壤污染區，污染還導致資源環境中生物重組，使物種的分布與
在新世紀之初,由于全球人增地減、資源匱乏,人類對環境的依賴性愈來愈強烈.隨著人類的生活要求和工農業生產的迅速發展,大量人工合成的并難以被天然微生物迅速降解轉化的污染性化合物進入到自然環境中,成為嚴重威脅人類及其他生物正常生存發展的土壤污染區,污染還導致資源環境中生物重組,使物種的分布與多度均發生深刻
實驗步驟 一、桿狀病毒表達載體 最簡單的經典桿狀病毒表達載體是一個重組的桿狀病毒，其基因組含有一段外源核酸序列，通常為編碼目標蛋白質的dDNA，在多角體蛋白啟動子控制下進行轉錄。這個嵌合的基因由多角體蛋白啟動子和外源蛋白編碼序列組成
進化遺傳學具有兩個并列的研究方向：系統發育的重建和種群分析。自1962年， Zuckerkandl和Pauling提出蛋白質序列和基因序列的比較可以象分子種一樣用于標志 現存物種分化的時間以來，各種生化方法被用于系統發育的研究。在最初二十年內， 同功酶的電泳分析、免疫學比較和蛋白質序列分析被廣泛地應
法醫DNA檢測技術的現狀及展望龐曉東 陳學亮 榮海博 俞麗娟 管樺 張濤公安部第一研究所DNA檢測技術的應用,為法醫學帶來了一場技術革命。通過對遺傳物質DNA的序列多態性及長度多態性的檢驗,即可實現個體識別及親權鑒定,該技術正在成為當前法醫物證鑒定最
蛋白酶A缺失及抗老化啤酒酵母工程菌的構建 6月底，《西安晚報》以《細菌吃淤泥 城河水變清》為題，報道了西安護城河玉祥門到西門清淤示范區內，運用菌種清淤，在1個多月的時間里，讓河水重新變清的消息。這顯示了微生物在污水治理方面的巨大威力。 科學家發現一種絮凝基因，把它轉入到具有污水處
一些研究表明，目前已經公布的基因組存在多種污染，隨著這個問題越來越突出，我們需要找出方法來應對 生物通報道：Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為
為貫徹落實中共中央辦公廳、國務院辦公廳《關于深化審評審批制度改革鼓勵藥品醫療器械創新的意見》(廳字〔2017〕42號)和《國務院關于改革藥品醫療器械審評審批制度的意見》(國發〔2015〕44號)，國家食品藥品監督管理總局組織對《藥品注冊管理辦法》進行了修訂，起草了《藥品注冊管理辦法(修訂稿)》，
RNAi實驗原理與方法近年來的研究表明，將與mRNA對應的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞，可以使mRNA發生特異性的降解，導致其相應的基因沉默。這種轉錄后基因沉默機制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被稱為RNA干擾（
近年來的研究表明，將與mRNA對應的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞，可以使mRNA發生特異性的降解，導致其相應的基因沉默。這種轉錄后基因沉默機制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被稱為RNA干擾（RNAi）。一、RNA
實驗概要設計PCR引物。實驗步驟1. 引物最好在模板cDNA的保守區內設計。 DNA序列的保守區是通過物種間相似序列的比較確定的。在NCBI上搜索不同物種的同一基因，通過序列分析軟件（比如DNAman）比對（Alignment），各基因相同的序列就是該基因的保守區。 2. 引物長度一般在15~30堿
PCR引物設計的11條黃金法則 1.引物最好在模板cDNA的保守區內設計。 DNA序列的保守區是通過物種間相似序列的比較確定的。在NCBI上搜索不同物種的同一基因，通過序列分析軟件（比如DNAman）比對（Alignment），各基因相同的序列就是該基因的保守區。 2.
1.引物最好在模板cDNA的保守區內設計。 DNA序列的保守區是通過物種間相似序列的比較確定的。在NCBI上搜索不同物種的同一基因，通過序列分析軟件（比如DNAman）比對（Alignment），各基因相同的序列就是該基因的保守區。 2.引物長度一般在15~30堿基之間。&nbs
幾十年來生物學上最重要的進展，也許是關于RNA分子能調節基因表達的發現。RNA干涉（RNAi）是指雙鏈RNA分子使基因表達沉寂的現象，是在線蟲中發現的，在 1998年的一篇Nature論文中被公諸于眾。 此后，科學家們明白，RNAi還有其他形式，它既
一．原理應用定量PCR技術，用一種標準作對照能夠估計出一種特異性靶DNA或RNA分子的相對含量。參照物：在定量 PCR 中必須加入參照物，用來作為擴增系統的陽性對照，并作為未知樣本定量的標準，且通過競爭性作用校正擴增系統內管間的擴增效率，使其具有可比性。參照物按其性質不同可分為內參照和外參照。內參照
聚合酶鏈反應（polymerase chain reaction, PCR）是微量核酸擴增的有效工具，由于其靈敏、特異、快速等優點，在醫學上已廣泛應用與病毒、細菌病原體及遺傳病、腫瘤的早期診斷。隨著PCR技術的發展，特別是病毒或腫瘤的治療監測、疾病的診斷、機體基因表達調控方面，不僅需要檢測其存在是否
細菌等微生物之間的橫向基因轉移（lateral gene transfer）現象頻繁發生，這對于它們的進化發展至關重要。美國科學家最新研究發現，細菌也能將基因轉移到復雜有機體中去。這將促使科學家重新思考種間基因轉移在進化中的作用，也使得遺傳學家今后在為新基因組排序時，不得不采用新的方法以過濾掉細菌基
1. 引物最好在模板cDNA的保守區內設計。DNA序列的保守區是通過物種間相似序列的比較確定的。在NCBI上搜索不同物種的同一基因，通過序列分析軟件（比如DNAman）比對（Alignment），各基因相同的序列就是該基因的保守區。2. 引物長度一般在15~30堿基之間。引物長度（primer le
畜禽養殖場作為動物疫病傳播的源頭，在疫病發生時及時進行病原診斷，采取相應的應對措施，是目前動物疫病防控的關鍵環節。 目前國內動物疫病的病原學診斷試劑選擇范圍有限。而在通用的血清學檢測試劑中，絕大多數是檢測血清中抗體的免疫試劑，其結果更多反應了疫苗免疫效果，對病原感染只能間接分析，無法確診，
今天，由國內外二十家實驗室負責人聯名撰寫的一篇名為“Questions about NgAgo”的學術論文在Protein Cell雜志上發表（Burgess et al., 2016），首次公開以公開發表學術論文的形式提出無法重復韓春雨的NgAgo實驗，將針對韓春雨的NgAgo技術的爭論推入了
摘 要： RACE是一種快速克隆cDNA末端的方法，目前, 該方法被廣泛應用于未知堿基序列基因的克隆，尤其是SMART RACE技術更為人們所青睞。本文總結了我們實驗室用SMART RACE技術克隆基因的一些心得體會，希望對用RACE方法克隆基因的同行有些幫助。關鍵詞： RACE; RN
近年來，隨著微生物基因組學的發展，微生物基因檢測迎來了新的機遇。2000年，Makino等已經完成V．p的基因組測序，V．p毒力基因及特異的基因序列得到進一步確定。根據V．p特異基因序列，設計引物，進行PCR檢測，是現階段檢測V，p的最快速準確的方法。目前應用于檢測V．p的PCR方法主要有任意引物
定量PCR 定義 以參照物為標準對PCR終產物進行分析或對PCR過程的進行監測，來評估樣本中靶基因的拷貝數，稱為定量PCR相對定量→絕對定量， 手工操作→自動化檢測， 靈敏度與特異性多有很大的提高。 定量PCR的可行性 定量一般是在PCR擴增的指數期進行的。 特定的待擴增基因片段 起始含量越大，則指
為加強第二代測序技術檢測試劑的規范和指導，進一步保證和提高相關產品的質量，8月8日，中國食品藥品檢定研究院（中檢院）組織制定了《第二代測序技術檢測試劑質量評價通用技術指導原則》（下稱《指導原則》）。 該文件是中檢院發布的首個質量評價技術指導原則，旨在對產品設計、研發及驗證的各關鍵環節進行規范，
一．前言 本指導原則主要針對第二代測序（next generation sequencing，NGS）技術檢測試劑（以下簡稱“NGS檢測試劑”）產品質量提出指導性要求，涉及基本原則、主要原材料、檢測流程及性能評價等方面。 本指導原則是對企業和檢驗人員的指導性文件，但不包括注冊審批所涉及的行政
核酸分子雜交是基因診斷的最基本的方法之一。它的基本原理是：互補的DNA單鏈能夠在一定條件下結合成雙鏈，即能夠進行雜交。這種結合是特異的，即嚴格按照堿基互補的原則進行，它不僅能在DNA和DNA之間進行，也能在DNA和RNA之間進行。因此，當用一段已知基因的核酸序列作出探針，與