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  • CSCO:腫瘤二代測序技術應用重在規范

    “二代測序技術應用于臨床腫瘤精準診治最關鍵的問題,是規范測序公司的標準和操作方法,只有規范的技術才能保證后續的精準發現和精準治療。”前不久,中國臨床腫瘤學會(CSCO)理事長吳一龍教授在《二代測序技術應用于臨床腫瘤精準診治的共識》(以下簡稱《共識》)發布會上表示,《共識》旨在為二代測序(NGS)技術應用于臨床腫瘤驅動基因分析,提供相關指導性建議并規范臨床實踐。 NGS是一種高通量的大規模平行測序技術,可同步獲得腫瘤患者個體特定樣本中數以十億計的DNA堿基序列信息,是發現已知和未知疾病相關基因變異的高效手段。盡管在單基因遺傳病、產前診斷等方面已廣泛應用,但當前NGS用于腫瘤基因檢測仍缺乏統一規范和共識。 我國腫瘤患者數目龐大,基因診斷和檢測需求巨大,但實際應用中,因為準入門檻低、缺乏業界公認的指導規范,可能存在檢測質量低下、結果準確性差、解讀不專業,甚至盲目追求基因檢測結果等現象。 鑒于此,......閱讀全文

    基因測序腫瘤檢測

    臨床醫生在腫瘤治療中發現,人體腫瘤千差萬別,即使是同一個部位的腫瘤,治療效果和方法也應因人而異,這種因人、因病而采取的不同疾病治療方法稱為“個體化治療”。因此在癌癥治療過程中,只有同病異治,因人而異,實施個體化治療,才能針對不同類型的病人選擇合適他們的藥物。下圖中給出的是在乳腺癌中HER2基因的表達

    腫瘤NGS基因檢測

    ⑴?隨著腫瘤分子檢測領域的發展,臨床藥效的分子標志物將不再局限于單基因或單位點,包含更多基因和位點的NGS檢測已逐漸成為腫瘤基因檢測主流技術;⑵ 2018年11月,JCO發表了一項美國腫瘤NGS基因檢測調研報告,報告顯示:75.6%的美國腫瘤醫生都在使用NGS基因檢測技術指導腫瘤治療,超50%的美國

    基因檢測,腫瘤治療重中之重

      根據臨床可實施性,或者基于腫瘤基因組分析產生的異構信息,決定是不是該采取臨床行動,仍然是科學家和臨床醫生的主要挑戰。  醫學博士Rodrigo Dienstmann等人,2014年在Molecular Oncology(“Standardized decision support in next

    腫瘤標志物檢測不等于腫瘤基因檢測

    隨著腫瘤的發病率逐年升高,人們對自身健康與疾病預防越來越重視。幾乎所有的體檢機構,已經把腫瘤篩查項目放進體檢套餐。那么,這些篩查項目對我們有哪些作用?腫瘤標志物的檢測與腫瘤基因檢測有什么區別?本文將為您來回答這2個問題。什么是腫瘤標志物檢測?腫瘤標志物通常是一些與腫瘤的發生發展相關的蛋白、酶或者糖抗

    腫瘤基因檢測:抽血行不行

      有不少腫瘤患者和家屬咨詢抽血做基因檢測的準確度,是否靠譜等。由于很多患者晚期多處轉移,病灶不是很好取,再就是穿刺取組織樣本具有一定的創傷性,會引起氣胸等并發癥。所以抽一管靜脈血做基因檢測,這不管是從體驗上,還是其他方面都引起了患者和家屬興趣。  但是故事剛剛開了個頭,隨著很多患者交上了那么一大疊

    腫瘤檢測p53基因檢測介紹

    p53基因檢測介紹:  正常的p53基因編碼53kD的蛋白,在細胞周期中起重要的調節作用,對細胞癌變有抑制作用,并由此而得名。當該基因發生點突變、缺失和滅活時,即由野生型轉變為突變型,反而促進腫瘤的發生和發展。p53基因檢測正常值:  無突變。p53基因檢測臨床意義:  該項檢測用于各類腫瘤發生機制

    腫瘤檢測p16基因檢測(MTS)介紹:

    p16基因檢測(MTS)介紹:  P16基因又叫MTS(multiple tumor suppressor 1)基因,是1994年美國冷泉實驗室Kamb等發現的新抗癌基因,這是一種細胞周期中的基本基因,直接參予細胞周期的調控,負調節細胞增殖及分裂,在人類50%腫瘤細胞株純發現有純合子缺失,突變,認為

    實體腫瘤檢測UMPS基因介紹

    這個基因編碼尿苷5'-單磷酸合酶。編碼的蛋白質是一種雙功能酶,對從頭嘧啶生物合成途徑的最后兩個步驟進行催化。第一個反應是由N-末端的酶-磷酸核糖基轉移酶進行的,該酶將乳清酸轉化為5'-單磷酸鹽。末端反應是由C末端酶OMP脫羧酶進行的,該酶能將5'-單磷酸列替丁轉化為單磷酸尿苷

    實體腫瘤檢測BRAF基因介紹

    該基因編碼蛋白屬于raf/mil家族的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,參與調控MAP/ERKs信號通路,在細胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突變與各種癌癥相關,包括非霍奇金淋巴瘤,結直腸癌,惡性黑色素瘤,甲狀腺癌,非小細胞肺癌,肺腺癌。

    實體腫瘤檢測EGFR基因介紹

    EGFR編碼的蛋白是一種跨膜糖蛋白,也是表皮生長因子受體家族中的一員,該家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也屬于受體酪氨酸激酶家族。EGFR作為細胞表面蛋白可與配體如表皮生長因子(EGF)結合,EGFR可被激活,

    實體腫瘤檢測NBN基因介紹

    該基因突變與nijmegen破碎綜合征(一種以小頭畸形、生長遲緩、免疫缺陷和癌癥易感性為特征的常染色體隱性染色體不穩定綜合征)有關。編碼蛋白是由5種蛋白質組成的MRE11/RAD50雙鏈斷裂修復復合物的成員。這種基因產物被認為與DNA雙鏈斷裂修復和DNA損傷誘導的檢查點激活有關。Mutations

    實體腫瘤檢測ATR基因介紹

    該基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族,與ATM(一種在共濟失調性毛細血管擴張癥中突變的基因編碼的蛋白激酶)關系最為密切。這種蛋白和atm與pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是細胞周期停滯和DNA損傷修復反應中所需的細胞

    實體腫瘤檢測MTRR基因介紹

    該基因編碼一個成員的鐵氧還蛋白NADP(+)還原酶(FNR)家族的電子轉移酶。該蛋白通過將蛋氨酸合酶再生到功能狀態在蛋氨酸合成中發揮作用。由于蛋氨酸合成需要葉酸供體的甲基轉移,編碼酶的活性對葉酸代謝和細胞甲基化很重要該基因突變可引起同型膀胱尿巨幼細胞性貧血,cbl E型該基因的選擇性剪接導致多個轉錄

    實體腫瘤檢測RET基因介紹

    RET蛋白是一種受體酪氨酸激酶,可以激活下游多種信號途徑,如RAS、PI3K及STAT等,誘導細胞增生。RET常以本身斷裂再與另一基因融合,重組成一新基因,具備自我磷酸化且持續激活,KIF5B-RET、CCDC6-RET、TRIM33-RET和NCOA4-RET是非小細胞肺癌中已發現的RET融合基因

    實體腫瘤檢測FANCL基因介紹

    這個基因編碼泛素連接酶,它是范科尼貧血互補組(FANC)的成員。這一組的成員通過組裝成一個共同的核蛋白復合物而不是通過序列相似性來聯系。該基因編碼互補群L的蛋白,該蛋白介導FANCD2和FANCI的單泛素化。范科尼貧血是一種遺傳異質性隱性疾病,其特征是細胞遺傳不穩定、對dna交聯劑過敏、染色體斷裂增

    實體腫瘤檢測ALK基因介紹

    ALK基因編碼一種受體酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),為跨膜蛋白,屬于胰島素受體超家族,在大腦發育與及特定的神經元中起重要作用。最初在間變性大細胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)發現ALK-NPM1融合蛋白,目

    實體腫瘤檢測BLM基因介紹

    bloom綜合征基因產物與含有dna解旋酶的desh盒recq亞群有關,具有dna刺激的atp酶和atp依賴的dna解旋酶活性。引起布魯姆綜合征的突變會刪除或改變螺旋酶基序,并可能使3'-5'螺旋酶活性喪失。正常蛋白可能起到抑制不適當重組的作用。The Bloom syndrome

    實體腫瘤檢測KDR-基因介紹

    KDR所編碼的蛋白也命名為血管內皮生長因子受體-2(Vascular endothelial growth factor receptor-2,VEGFR-2),是血管生長因子重要信號轉導的重要受體,迄今已發現的VEGF信號轉導的主要受體包括fms樣酪氨酸激酶VEGFR-1,即Flt- 1,胎兒肝激

    實體腫瘤檢測KIT基因介紹

    KIT基因編碼的蛋白是干細胞因子受體SCFR,也被稱為原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一種受體酪氨酸激酶,這個基因突變與胃腸道間質瘤,肥大細胞病,急性髓性白血病有關。

    實體腫瘤檢測NRAS-基因介紹

    NRAS基因是GDP/GTP結合蛋白,比較重要的同家族基因還包括KRAS和HRAS。NRAS與GTP結合呈激活狀態,與GDP結合呈關閉狀態,該基因的突變與黑色素瘤密切相關,機制為該基因的突變導致其下游基因的如Raf激酶的異常持續激活。

    實體腫瘤檢測PoLE基因介紹

    該基因編碼DNA聚合酶epsilon的催化亞單位。這種酶參與DNA修復和染色體DNA復制。該基因突變與結直腸癌12和面部畸形、免疫缺陷、利維多和身材矮小有關。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The

    實體腫瘤檢測FANCC基因介紹

    Fanconi貧血互補組(FANC)目前包括Fanca、Fancb、Fancc、Fancd1(也稱為brca2)、Fancd2、Fance、Fancf、Fancg、Fanci、Fancj(也稱為brip1)、Fancl、Fancm和Fancn(也稱為palb2)。先前定義的組fanch與fanca相

    實體腫瘤檢測HRAS基因介紹

    HRAS編碼的HRAS蛋白為GTP酶,HRas是一種小的G蛋白,屬于小GTP酶超家族,當HRas與鳥苷三磷酸結合后,會結合Raf激酶比如c-Raf,再進一步激活MAPK/ERK通路。這個基因的突變與多種癌癥相關,包括膀胱癌,濾泡狀甲狀腺癌,口腔鱗狀細胞癌。

    實體腫瘤檢測PTEN基因介紹

    PTEN基因編碼的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂質磷酸酶活性,是第一個具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是繼p53和Rb基因之后,與腫瘤發生密切相關的一種抑癌基因,其主要機制因為PTEN是PI3K/Akt通路的主要負調控因子。PTEN的功能缺陷在人類多種腫瘤中廣泛存在。

    實體腫瘤檢測CDA基因介紹

    這個基因編碼一種參與嘧啶搶救的酶。編碼蛋白形成一個四聚體,分別催化胞苷和脫氧胞苷不可逆水解脫氨為尿苷和脫氧尿苷。它是維持細胞嘧啶池的幾種脫氨酶之一。該基因突變與用于治療某些兒童白血病的胞嘧啶核苷類似物阿糖胞苷敏感性降低有關。This gene encodes an enzyme involved i

    實體腫瘤檢測MTOR基因介紹

    雷帕霉素(mTOR)的哺乳動物靶標,也稱為雷帕霉素和FK506結合蛋白12-雷帕霉素相關蛋白1(FRAP1)的機制靶標,是人類中由MTOR基因編碼的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相關激酶家族的成員。 mTOR與其他蛋白質結合,并作為兩種不同蛋白質復合物的核心成分,mTOR復合物1和m

    實體腫瘤檢測ATRX基因介紹

    該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域,因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化,它調節其核基質和染色質的結合,并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯(XLMR)綜合征有關,通常伴有α-地中海貧血(ATR

    實體腫瘤檢測EPCAM基因介紹

    該基因編碼癌相關抗原,是一個家族的成員,至少包含兩種I型膜蛋白。這種抗原在大多數正常上皮細胞和胃腸道癌上表達,并作為一種同型鈣依賴性細胞粘附分子發揮作用。該抗原正被用作人類癌免疫治療的靶點。該基因突變導致先天性叢生性腸病。This gene encodes a carcinoma-associate

    實體腫瘤檢測TERT基因介紹

    端粒酶是一種核糖核蛋白聚合酶,通過添加端粒重復序列TTagg來維持端粒末端。這種酶由一種具有逆轉錄酶活性的蛋白質成分(由該基因編碼)和一種作為端粒重復模板的RNA成分組成。端粒酶的表達在細胞衰老中起作用,因為它通常在出生后的體細胞中被抑制,導致端粒逐漸縮短。體細胞端粒酶表達的放松調控可能與腫瘤發生有

    實體腫瘤檢測GNAS基因介紹

    GNAS作為一個重要的信號轉導蛋白,主要功能是在G蛋白偶聯受體信號轉導途徑中,激活腺苷酸環化酶,導致cAMP水平的升高,參與調控細胞生長和細胞分裂。

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