上海生科院科研人員研發了premRNA可變剪接分析軟件CASH
4 月 6 日，國際著名生物信息學期刊 Briefings in Bioinformatics 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）馮英組和浙江農林大學吳文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究進展“CASH： a constructing comprehensive splice site method for detecting alternative splicing events”。該研究開發了 pre-mRNA 可變剪接分析軟件 CASH（Comprehensive Alternative Splicing Hunting），并利用該軟件研究了剪接蛋白 SRSF10 在不同物種中的剪接調控模式的保守和演化。 pre-mRNA 可變剪接事件的發現，是研究可變剪接的前提步驟，而基因組注釋（包括人類、擬南芥等最受重視的模式生物）存在不準確或未注釋的可變剪接；不同細胞或組織中往往又存在異常的......閱讀全文
SEM圖像分析軟件
SEM圖片是電子掃面的圖片，把微觀世界放大到幾千甚至上萬倍，這個圖片是需要你結合自身的知識背景加以專業的判斷才能得出的結論的，而不是有什么軟件會告訴你什么圖片能說明啥。
XRD相關分析軟件
1）pcpdfwin屬于第二代物相檢索軟件。它是在衍射圖譜標定以后，按照d值檢索。一般可以有限定元素、按照三強線、結合法等方法。所檢索出的卡片多數時候不對。一張復雜的衍射譜有時候需要花幾天的時間。2）search match一個專門的物相檢索程序，屬于第三代檢索軟件，采用圖形界面，根據圖譜實體來對譜
STARe熱分析軟件
功能強大的多用途STARe軟件具有獨特的靈活性及無限的數據評估可能性。STARe軟件是堅持不懈開發的結果，以“提高性能、滿足全球客戶需求”為目標。無限的數據評估可能性-極大的的靈活性可靠的自動化 — 帶結果評估的高樣品量極大地提高了效率集成式數據庫-確保了最高程度的數據安全性免費的STARe評估軟件
2024年，西湖大學施一公團隊合作再取進展
U2小核核糖核蛋白(snRNP)對pre-mRNA分支位點(BS)的選擇對于剪接前體 (A complex)的組裝至關重要。RNA解旋酶PRP5校對BS選擇，但其潛在機制尚不清楚。 2024年1月9日，西湖大學施一公及中國科學技術大學張曉峰共同通訊在Nature Structural & Mo
異常剪接?
中文名異常剪接定????義指對序列庫中異常剪接mRNA的鑒定和分析隸屬領域生物領域主要功能處理多順反子性轉錄單元，調控轉錄效率和mRNA的穩定性，同時可以增加產物蛋白的多樣性
RNA－剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子，連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
自剪接
自剪接(self-splicing)出現在稀少的內含子組成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情況下代替了剪接體的功能。自剪接的內含子有兩種，稱為I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型內含子以與剪接體類似的方式進行剪接，但不需要任何蛋白質。這種相似性使人相信這些內含子與剪接體在演化過程上有著關連。自剪接亦可能是非常古老，且
揭示lncRNA在EMT過程中發揮的作用
西班牙塞利維亞大學教授José A Pintor-Toro長期從事生物化學與細胞生物學研究， 近期，其實驗室利用Arraystar LncRNA芯片研究發現了在TGF-β誘導的上皮-間質細胞轉化（EMT）過程早期起直接調控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1，TGF-β誘導直接引起lnc-Sp
Nature子刊：揭示lncRNA在EMT過程中發揮的作用
西班牙塞利維亞大學教授José A Pintor-Toro長期從事生物化學與細胞生物學研究， 近期，其實驗室利用Arraystar LncRNA芯片研究發現了在TGF-β誘導的上皮-間質細胞轉化（EMT）過程早期起直接調控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1，TGF-β誘導直接引起lnc
CRNKL1基因編碼功能及結構描述
果蠅曲頸基因（crn）是胚胎發生的關鍵基因，被認為參與細胞周期的進程和mrna前剪接。由這個人類基因座編碼的蛋白質被發現定位于細胞核中的前mrna剪接復合物，是前mrna剪接所必需的。另外，已經描述了剪接轉錄變體。[由RefSeq提供，2013年7月]The crooked neck (crn) g
CRNKL1基因編碼功能及結構描述
果蠅曲頸基因（crn）是胚胎發生的關鍵基因，被認為參與細胞周期的進程和mrna前剪接。由這個人類基因座編碼的蛋白質被發現定位于細胞核中的前mrna剪接復合物，是前mrna剪接所必需的。另外，已經描述了剪接轉錄變體。[由RefSeq提供，2013年7月]The crooked neck (crn) g
CRNKL1基因編碼功能及結構描述
果蠅曲頸基因（crn）是胚胎發生的關鍵基因，被認為參與細胞周期的進程和mrna前剪接。由這個人類基因座編碼的蛋白質被發現定位于細胞核中的前mrna剪接復合物，是前mrna剪接所必需的。另外，已經描述了剪接轉錄變體。[由RefSeq提供，2013年7月]The crooked neck (crn) g
CRNKL1基因突變與藥物因子介紹
果蠅曲頸基因（crn）是胚胎發生的關鍵基因，被認為參與細胞周期的進程和mrna前剪接。由這個人類基因座編碼的蛋白質被發現定位于細胞核中的前mrna剪接復合物，是前mrna剪接所必需的。另外，已經描述了剪接轉錄變體。[由RefSeq提供，2013年7月]The crooked neck (crn) g
前加州大學圣地亞哥分校教授付向東已加入西湖大學
西湖大學官網近日更新后顯示,RNA生物學的國際領軍人物、前加州大學圣地亞哥分校細胞與分子醫學杰出教授付向東已加入西湖大學,擔任RNA生物學與再生醫學講席教授。 付向東1982年畢業于武漢大學,并獲得病毒學學士學位,1983年通過中美生物化學聯合招生（CUSBEA）計劃留學美國凱斯西儲大學,并于
可變性紅斑角皮癥病例分析
1 病歷摘要 患者男， 22 歲。因掌跖增厚 20 余年，全身反復鱗 屑性紅斑伴瘙癢 5 年，于 2012 年 7 月 12 日來本院就 診。患者出生后不久雙手掌、足跖皮膚增厚，表面附有 薄層鱗屑，繼而出現線狀皸裂，未診治。5 年前患者自 述無明顯誘因于軀干及四肢出現大小不等片狀暗褐色
開年新篇！施一公團隊Science再發剪接體新成果
2016年1月8日，清華大學生命學院施一公教授研究組在《科學》（Science）就剪接體的結構與機理研究再發長文（Research Article），題為《U4/U6.U5 三小核核糖核蛋白復合物3.8埃的結構：對剪接體組裝及催化的理解》（The 3.8 A Structure of the U
Cell丨施一公組完成酵母剪接體結構最后拼圖
真核生物pre-mRNA剪接由超分子復合物剪接體（spliceosome）完成。完整的剪接過程主要分為八種不同的狀態，預催化剪接體的前體（pre-B），預催化剪接體（B），活化復合物（Bact），催化活化復合物（B*），催化步驟I復合物 （C），催化步驟II活化復合物（C*），催化后剪接體（P）
?DNA損傷修復信號通路SF3B1基因的臨床解釋
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
白血病相關的基因突變及臨床解釋??SF3B1基因
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
乳腺癌相關的SF3B1基因突變類型及臨床解釋
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
SF3B1基因的作用介紹
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
DNA損傷修復信號通路相關因子SF3B1
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
與白血病相關的SF3B1基因編碼功能描述
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
與乳腺癌相關的SF3B1基因編碼功能描述
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
與肺癌相關的SF3B1基因編碼功能描述
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
SF3B1基因突變因子與藥物介紹
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
實體腫瘤檢測SF3B1基因介紹
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
SF3B1基因編碼的功能和結構描述
該基因編碼剪接因子3b蛋白復合物的亞單位1。剪接因子3b與剪接因子3a和12s RNA單元一起形成u2小核核糖核蛋白復合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a復合物以序列獨立的方式結合內含子分支位點上游的pre-mRNA，并可能將u2 snrnp錨定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
科學家找到深度學習基因組學應用的一頂“黑帽子”
研究人員首次將深度學習與貝葉斯假設檢驗結合，利用深度學習強化RNA可變剪接分析的準確性。 在生命科研領域，常有人說深度學習的基因組學應用好比是“一個盲人在一間黑暗的房子里尋找一頂并不存在的黑色帽子”。言下之意，是遺憾深度學習的基因組學應用并沒有給人們帶來太多驚喜。不過，近日賓夕法尼亞大學和費
商業共定位分析軟件
大多數商業共定位分析軟件都能計算上面所描述的參數，包括 Pearson′s 相關系數、總 overlap 系數以及 k(X)， m(X)和 M(x)共定位系數。此外，許多分析軟件包含的算法可進行背景校正，產生整幅圖的散點圖，且可在一個雙通道合成圖或共聚焦圖的感興趣區域進行計算。從這些軟件中獲得的最重