NaturePlants文章:精準高通量檢測Rloop分布的新方法
來自清華大學生科院,清華-北大生命科學聯合中心的研究人員發表了題為“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次報道了精準、高效、高通量檢測R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物擬南芥基因組中R-loop的分布特征。 這一研究成果公布在Nature Plants雜志上,文章的通訊作者為清華大學生科院孫前文和楊雪瑞,第一作者為徐煒博士。Nature Plants雜志專門邀請加州大學戴維斯分校Frederic Chedin教授為本研究撰寫評論文章,彰顯此項研究在領域內的重要性。Metaplot分析顯示擬南芥基因組中既存在正義R-loops(sense R-loops,由基因自身轉錄本與其模板鏈形成的R-loop),也存在反義R-loop(antisense R-loops,大多是由基因的反義轉錄本在正義鏈轉錄起始位點......閱讀全文
Nature-Plants文章:精準高通量檢測Rloop分布的新方法
來自清華大學生科院,清華-北大生命科學聯合中心的研究人員發表了題為“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次報道了精準、高效、高通量檢測R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物擬南芥
Rloop檢測:一種更精確高效的方法
R-loop是一種特殊的染色體結構,由一條RNA:DNA雜合鏈和一條單鏈DNA所組成。目前越來越多的證據發現這種獨特的染色質結構在原核和真核生物中普遍存在,在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等。 R-loop的異常導致多種人類疾病的發
研究揭示RNA甲基化調控Rloop形成及轉錄終止機制
R-loop是一種由RNA:DNA雜合鏈和單鏈DNA組成的特殊核酸結構,在原核和真核生物的基因組中分布廣泛且普遍存在。R-loop在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等,但其如何被精確調控的機制尚不清楚。m6A修飾作為信使RNA上豐度最高
利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化調控Rloop形成及轉錄終止機制
R-loop是一種由RNA:DNA雜合鏈和單鏈DNA組成的特殊核酸結構,在原核和真核生物的基因組中分布廣泛且普遍存在。R-loop在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等,但其如何被精確調控的機制尚不清楚。m6A修飾作為信使RNA上豐度最高
Cell-Reports-|-一種更精確高效檢測Rloop的方法
R-loop是生物體在轉錄過程中形成的特殊的三鏈核酸結構,轉錄過程中新合成的RNA鏈與模板DNA鏈互補配對,形成的DNA:RNA雜合雙鏈與非模板DNA鏈一起被稱為R-loop【1】。R-loop在生物體內普遍存在,并參與了許多生物學過程,例如轉錄過程、DNA復制、基因組不穩定性以及染色體重排等【
R環(Rloop)的結構特點
R環(R-loop),是指當某些基因轉錄形成mRNA分子難與模版鏈分離時,會形成RNA-DNA雜交體,這時非模板鏈與RNA-DNA雜交體共同構成r環結構。
高通量檢測的優化網絡講座
IDEX Health & Science 很高興為您帶來網絡講座有關: (時間:2010年7月1日 北京時間凌晨02:00 時長:60分鐘 演講語言:英語)?高通量檢測的優化 主題:花費更少、效率更高的分析檢測技術 名額有限! 該網絡講座將討論: ? 在改善和優化檢測方法時
高通量檢測:痕量毒品瞬間畢露
小型化SPRi原型機 新聞背景 當前,我國已由毒品過境為主轉變為過境與國內消費并存,2008年我國在冊吸毒人數累計已達112.67萬人。近年來,設計型毒品也在不斷出現,對毒品檢測鑒定提出了更高要求。然而國內對毒品及代謝物的快速分析,主要利用進口的免疫試劑盒,此方法干擾因素多,經常出現
高通量的轉錄因子活性檢測
轉錄因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表達過程中發揮著重要作用,或調節基因表達的強度,或控制目的基因的時空特異性表達,或應答外界刺激和環境脅迫。近年來,隨著干細胞研究的不斷升溫,人們對轉錄因子的興趣也日益濃厚。同一個基因組,為何最終分化成不
高通量農藥殘留檢測儀介紹
農藥殘留現在已經造成比較嚴重的社會影響,不光對人的身體健康有比較大的傷害,還對農產品的出口也造成嚴重的影響和掣肘,因為國際社會對農藥殘留的檢查和標準非常嚴格,我們有不少農產品因為農藥殘留超標的問題已經被阻攔,對農業生產的經濟影響是很大的,所以需要對農藥殘留的問題重視起來,加強對農藥殘留的檢測,保
高通量農藥殘留檢測儀簡介
高通量農藥殘留檢測儀(прибор для обнаружения остатков пестицидов )-高通量農藥殘留檢測儀擁有24個檢測通道,可以同時測試多個樣品,循環檢測,即放即檢,每個樣品由程序控制分別獨立工作,不會互相干擾。農產品農藥殘留檢測關于保證農產品安全以及顧客的健康安全具有重
感染病原高通量基因檢測意義
高通量基因測序檢查技術優點,能對臨床上未知病原體篩查,避免臨床上對許多疾病的未知因素檢查效果,以及未知...
新技術RChIP特異性識別Rloop并繪制細胞內全基因組圖譜。
最新論文研發出了一種新技術R-ChIP,可特異性識別體內形成的R-loop,通過富集和文庫的建立與測序,即可繪制細胞內R-loop的全基因組圖譜。 當由轉錄產生的RNA與模板DNA通過堿基互補配對形成雜合鏈時,另外一條非模板DNA鏈將處于單鏈狀態,由此形成的三鏈核酸結構稱為R-loop。R-
生物高通量檢測分析服務網絡
近日,由中國科學院科技服務網絡計劃(STS計劃)項目支持,中科院青島生物能源與過程研究所、北京生命科學研究院、天津工業生物技術研究所、微生物研究所共同承擔的“生物高通量檢測分析服務網絡”項目結題驗收。 經過5年的實施,該項目研制出了單細胞拉曼分選儀工程化樣機(RACS-Mini),開發了單
SpectraScan高通量作物果實品質檢測方案
我國幅員遼闊,自然環境的巨大差異造就了豐富的生物多樣性,不同地域生長的經濟作物品種繁多,果實五花八門,品質良莠不齊。而果實品質的好壞直接影響膳食營養及食品安全,與人類健康密切相關,也是衡量作物經濟效益的重要因素。因此,作物果實品質的快速、批量分析評價對于衡量作物經濟效益,規避經濟損失、優化栽培品種及
種子萌發率高通量檢測與活力評估
種子活力是種子發芽和出苗率、幼苗生長的潛勢、植株抗逆能力和生產潛力的總和(發芽和出苗期間的活性水平與行為),是種子品質的重要指標,具體包括吸漲后旺盛的代謝強度、出苗能力、抗逆性、發芽速度及同步性、幼苗發育與產量潛力。種子萌發實驗無疑是最為直接有效的種子活力檢測方法。但一般的傳統方法需要人工計數來測量
如何用FFPE組織樣品進行高通量檢測?
福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的樣品代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料,如何從這些樣品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技術有限公司針對FFPE樣品的高通量分析,建立了整套的SOP 標準解決方案,幫助廣
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福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的樣品代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料,如何從這些樣品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技術有限公司針對FFPE樣品的高通量分析,建立了整套的SOP 標準解決方案,幫助廣大科
高通量基因分型檢測平臺及其應用案例
Agripheno?高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar?模塊化內聯液體處理與分析系統、Soellex?高通量PCR水浴熱循環系統和Araya?內聯熒光檢測系統。Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA,通量達到800個樣本/3小時。同時,適用于多
高通量測序
高通量測序技術又稱“下一代”測序技術,以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括:大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DN
全球首個飼料中霉菌毒素高通量檢測標準發布
??近日,由中國農業科學院農業質量標準與檢測技術研究所飼料質量安全檢測與評價創新團隊首席蘇曉鷗研究員主持制定的農業行業標準《飼料中37種霉菌毒素的測定液相色譜串聯質譜法》發布,并將于2021年4月1日起實施。該標準檢測方法成功研發,擴大了我國飼料及畜產品中霉菌毒素監測范圍,提升了發現風險的能力。
高通量疫苗、獸藥研發及獸藥殘留檢測公共平臺
前言:本文摘選自《××農業大學高通量疫苗、獸藥研發及農藥殘留檢測公共平臺的認證報告》,分為上下兩篇。該系列分為高通量疫苗研發技術簡介,獸藥研發及農藥殘留檢測技術簡介,高通量疫苗及、獸藥研發及農藥殘留檢測公共平臺共三期,希望對廣大動物科學研究者有所幫助。 【平臺簡介】 高通量疫苗、獸藥研發及獸
Nature-Methods發布高通量細胞脂質檢測新工具
脂類,是一種復雜的物質,除了主要成分脂肪酸還包括許多其他成分。在生命體中,脂質構成細胞壁,儲存能量,在必要時釋放能量,并在細胞信號轉導中起重要作用。有關脂類的很多知識都還沒有答案,用質譜測繪大量樣本的高通量脂質分子結構檢測方法研究還處于初級探索階段。 越來越多證據表明,脂質成分變化在癌癥、脂肪
我所發展人乳寡糖高通量定量檢測方法
近日,我所病毒侵染機制研究組(2806組)閆競宇副研究員團隊與中國疾病預防控制中心營養所賴建強研究員團隊合作,在人乳寡糖高通量絕對定量方法研究方面取得新進展。? 母乳作為新生兒唯一的天然營養來源,在為嬰幼兒提供必需營養物質的同時,也在完善其免疫系統、促進生長發育等方面發揮重要作用。人乳寡糖是一類
鐘聲教授團隊開發高通量蛋白互作檢測技術
通過深入了解基因組產物形成的相互作用網絡,人類基因組注釋功能得以飛速發展。隨著技術的進步,我們已經實現了DNA-DNA、蛋白質 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因組映射圖譜。但完成人類蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)的全基因組映射圖譜仍然是一項艱巨任務。 目前,大規模PP
高通量細胞篩選庫模擬病人檢測抗癌藥物
記者從中科院了解到,近期中科院強磁場科學中心已建成目前世界上規模最大的基于癌癥激酶靶點的高通量細胞篩選庫,填補了國內新藥創制領域此類檢測體系的空白,將為抗腫瘤新藥研發提供有力支撐。 中科院強磁場科學中心劉青松藥物學團隊以小鼠細胞為原始模板,采用基因工程的手段,針對目前臨床常見的癌癥相關激酶靶點
“生物高通量檢測分析服務網絡”項目通過驗收
3月26日,由中國科學院科技服務網絡計劃(STS計劃)項目支持,中科院青島生物能源與過程研究所、北京生命科學研究院、天津工業生物技術研究所、微生物研究所共同承擔的“生物高通量檢測分析服務網絡”項目結題驗收。 經過5年的實施,該項目研制出了單細胞拉曼分選儀工程化樣機(RACS-Mini),
高通量組織研磨儀應用于種子純度檢測優勢
近年來,種子市場活躍,優良的種子品質市場需求非常大。而企業為了確保種子品質,就需要開展大量的種子檢測工作,而種子純度檢測就是其中的一項重要內容。在這項檢測項目中,最重要的一項內容就是進行樣品的制備,獲得粉碎度較高的粉碎樣品,過去是采用人工研磨小麥、大麥、玉米、綠豆等樣品,而現在是利用高通量組織研磨
高通量蛋白質檢測技術獲重大突破
后基因組時代蛋白質組閃亮登場中國計量院高通量蛋白質檢測技術研究取得重大突破 “高通量蛋白質分離檢測關鍵技術研究取得的突破給我們很大鼓舞,但這只是我們大規模系統集成研究的一部分,我們正在著力于系統后續的研究。相信,在不久的將來,這套集成系統將為蛋白質組的分析提供一個完整規范的平臺。”談起不久前通過項
高通量組織研磨儀在農殘檢測中的應用
農藥殘留檢測是保障蔬菜等農產品安全的重要步驟,也是避免農產品安全事故的一項重要措施,隨著農業的發展,農殘檢測變得越來越重要,同時也需要提高檢測的 速度來適應社會發展的需要,過去傳統的農殘檢測方法,在研磨樣品的時候耗時、費力、效率低,而現在采用高通量組織研磨儀,在3-5min之內,就可以完成12個樣品