高通量的轉錄因子活性檢測
轉錄因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表達過程中發揮著重要作用,或調節基因表達的強度,或控制目的基因的時空特異性表達,或應答外界刺激和環境脅迫。近年來,隨著干細胞研究的不斷升溫,人們對轉錄因子的興趣也日益濃厚。同一個基因組,為何最終分化成不同的表型,這正是轉錄因子讓人著迷的地方。 過去,對于轉錄因子的活性檢測,人們常常采用電泳遷移率改變分析(EMSA)。這是一種經典技術,過去通常采用32P放射性同位素標記的DNA顯現實驗結果,需要數天。當然,現在也采用化學發光檢測來取代同位素。不過,EMSA 操作相當繁瑣,整個過程包括了核蛋白的抽提、定量,探針的標記與純化,探針與蛋白質的結合,電泳與顯影等若干步,且每次只能檢測一個轉錄因子。 然而,一種特定的細胞信號通道通常可同時激活多種轉錄因子,一個特定基因的表達在多種轉錄因子的控制之下,因此同時檢測多種轉錄因子的活性......閱讀全文
啟動子與轉錄因子/基因表達調控蛋白
目的基因的表達調控生命活動豐富多彩、千變萬化。但是萬變不離其宗,不管如何變化都圍繞著中心法則展開。核酸作為遺傳物質指導蛋白質的表達,表達產生的一些特殊蛋白(如轉錄因子、調控蛋白)反過來又對DNA指導合成蛋白質的過程進行調控。對基因表達調控的研究一直是生物學研究熱點,涉及到生命活動的各個過程,也是各類
高通量的轉錄因子活性檢測
轉錄因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表達過程中發揮著重要作用,或調節基因表達的強度,或控制目的基因的時空特異性表達,或應答外界刺激和環境脅迫。近年來,隨著干細胞研究的不斷升溫,人們對轉錄因子的興趣也日益濃厚。同一個基因組,為何最終分化成不
信使RNA的啟動子和轉錄因子
一定義:酶識別、結合、開始轉錄的一段DNA序列。強啟動子2秒鐘啟動一次轉錄,弱啟動子10分鐘一次。 二原核生物:大腸桿菌在起點上游約-10堿基對處有保守序列TATAAT,稱為pribnow box,有助于局部解鏈。在其上游還有TTGACA,稱為-35序列,提供RNA聚合酶識別的信號。 三真核
基因表達的轉錄機制介紹
轉錄過程由RNA聚合酶(RNAP)進行,以DNA為模板,產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動,留下新合成的RNA鏈。 基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成,每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”(產生RNA轉錄物的模板)和“編碼鏈”(含有轉錄本序列的
啟動子—基因表達的發動機
眾所周知,一段基因從轉錄開始,最終形成蛋白質執行功能,離不開一個高效、匹配的啟動子。啟動子的一般結構包括核心啟動子元件和上游調控元件。核心啟動子元件又包括轉錄起始點和TATA框,主要作為RNA聚合酶結合并起始轉錄的位點,上游調控元件能夠通過與對應的反式作用因子相結合改變轉錄的效率,如圖1。
啟動子—基因表達的發動機
眾所周知,一段基因從轉錄開始,最終形成蛋白質執行功能,離不開一個高效、匹配的啟動子。啟動子的一般結構包括核心啟動子元件和上游調控元件。核心啟動子元件又包括轉錄起始點和TATA框,主要作為RNA聚合酶結合并起始轉錄的位點,上游調控元件能夠通過與對應的反式作用因子相結合改變轉錄的效率,如圖1。?????
基因表達轉錄調控的主要途徑
基因表達轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。
基因表達的轉錄調控的介紹
可分為三種主要途徑: 1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用); 2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用; 3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合
Cell-reports:轉錄激活因子抑制基因表達——一切皆有可能
近日,來自韓國的科學家在國際學術期刊cell reports在線發表了他們的最新研究進展,他們發現Hippo腫瘤抑制途徑下游一直作為轉錄共激活因子的YAP和YAZ,也能夠通過與具有TEA結構域的轉錄因子相互作用發揮轉錄共抑制因子活性,促進腫瘤進展。 YAP和TAZ是位于Hippo腫瘤抑制途徑下
FoxD3調控結果由基因環境可以決定
Nanog主要在胚泡的內細胞團(inner cell mass, ICM)中表達。相關研究表明,Nanog基因表達與細胞的分裂、分化情況以及細胞的干細胞特性密切相關。在分裂旺盛的細胞中,Nanog基因高表達,而隨著細胞分化程度的加深Nanog基因的表達量逐漸降低,直至在完全分化的細胞中不表達
微孔板振蕩器
微孔板振蕩器采用直流無刷電機驅動振蕩,主要應用于酶標板(96孔/384孔板)、細胞培養板(24孔板、48孔板、96孔板等)等溶液的混勻振蕩。可應用于免疫測定和染色等實驗,可在室溫低的環境或培養箱中使用,產品外觀緊湊,操作簡潔方便,安全穩定無噪音。 微孔板振蕩器廣泛應用于各種電泳凝膠的固定,
基因轉錄因子的相關介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態,RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄,只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后,基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
基因表達的轉錄后調控的介紹
真核生物的RNA被翻譯之前需要通過核孔輸出,因此核輸出對基因表達有著顯著影響。所有進出細胞核的mRNA的運輸都是通過核孔進行的,受到各種輸入蛋白和輸出蛋白的控制。 攜帶遺傳密碼的mRNA需要存活足夠長的時間才能被翻譯,因為mRNA在翻譯之前必須經過很長距離的運輸。在典型的細胞中,RNA分子僅在
T細胞基因的轉錄激活及其表達
? TCR/CD3復合物與配體結合后,經多種信號轉導途徑傳遞信號,最終導致T細胞活化和增殖。信號轉導中所涉及的基因根據其活化時間可以分為早早期、早期、晚期基因三種類型(表8-5)。早早期基因的轉錄不需蛋白的合成,而早期及晚期基因的轉錄則需蛋白的合成。早早期及早期基因轉錄在有絲分裂期之前,而晚期基因轉
Science:端粒酶的調控
對于所有多次分裂的細胞來說,維持染色體兩端端粒(telomere)的長度是至關重要的。一種稱作端粒酶(telomerase)的酶可使兩端得以延長,以抵消每次染色體拷貝所發生染色體縮短。端粒酶是細胞生存的必要條件,端粒酶功能喪失可導致干細胞自我更新障礙,從而引起諸如先天性角化不良、再生障礙性貧血和
廣州生物院揭示人多能干細胞神經分化的分子調控機制
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院潘光錦研究組在對神經細胞命運決定的分子調控機制的研究中,發現在人多能干細胞中miRNA簇miR -379-656的一個成員——miR-376c可以促進神經干細胞分化進程,而抑制miR-376c則有相反作用。相關研究成果于8月11日在線發表在The FASEB J
研究發現影響血液干細胞中特殊基因表達的關鍵元件
基因轉錄通常會被啟動子和調節元件(比如增強子和沉默子)之間的染色質環來進行調節,不同的轉錄因子(TFs,transcription factors)能夠與這些調節元件結合,并以一種細胞類型特異性的方式來調節啟動子-增強子環。盡管其在控制基因表達方面發揮著重要作用,但轉錄因子如何促進啟動子-增強子
最新研究發現植物干細胞命運決定新機制
固著生長的高等植物能夠不斷調整器官發生和發育進程,從而適應復雜多變的環境條件。與動物相比,植物的生長發育表現超強的可塑性,這主要取決于其干細胞組織結構。以模式植物擬南芥根尖分生組織為例,干細胞組織中心(靜止中心,Quiescent center,QC)與其周圍干細胞共同構成根尖干細胞微環境,為根
雙向啟動子的轉錄機制
雙向啟動子的雙向轉錄機制可能是兩個RNA聚合酶同時聚集在無核小體區的邊界,然后在兩個方向上起始轉錄.雙向啟動子在真核生物基因組中廣泛分布 ,大多數的雙向啟動子缺少TATA盒,而具有較高的GC含量和豐富的CpG島。
細胞成像微孔板檢測系統
細胞成像微孔板檢測系統是一種用于生物學、農學、畜牧、獸醫科學、基礎醫學領域的分析儀器,于2016年10月27日啟用。 技術指標 孵育溫度范圍:室溫以上5℃-65℃;CO2和O2控制范圍:0-20%(CO2);1-19%(O2)控制分辨率:+0.1%(CO2和O2)穩定性:+0.2%at5%C
多功能微孔板讀數儀
多功能微孔板讀數儀是一種用于農學、食品科學技術領域的分析儀器,于2018年6月1日啟用。 技術指標 1 光吸收、熒光、發光三種模式均采用獨立的光源、光路及檢測器; 2 分光系統:四光柵光路及濾光片光路,激發和發射分別為雙光柵; 3 適用板型:1-384孔板、微量檢測板、Cellchip、比色
CRISPR觸發的內源Oct4或Sox2基因位點染色質重塑激...(一)
CRISPR觸發的內源Oct4或Sox2基因位點染色質重塑激活細胞重編程題目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus EnablesReprogramming to Pluripotency期刊:C
Cell子刊發布首個植物轉錄因子文庫
近日科學家們借助自動化平臺,建立了首個植物遺傳學開關的綜合性文庫,以幫助全球學者更好的理解植物對環境改變的適應,培育更好的植物品種。相關論文于七月十七日發表在Cell旗下的Cell Reports雜志上。 該文庫的建立耗時八年,包含大約兩千個植物轉錄因子的克隆。轉錄因子是天然的遺傳學開關,研究
北京大學發現調控植物分枝形成基因
植物分枝的多少,是植物在形態上適應環境的一種非常重要的方式,還可以影響糧食產量。那么植物的分枝是如何形成的呢?分枝形成的過程又是如何調控的呢?北京大學秦跟基課題組發現了一個重要的調控植物分枝的基因。相關成果日前發布于《植物細胞》。 一些名為“腋芽分生組織調控因子”(RAX)的MYB類轉錄因子
熒光素酶報告基因的技術流程
啟動子的預測轉錄因子的預測報告基因質粒的構建實驗方法及結果分析?用生物信息學方法分析并預測啟動子區可能的轉錄因子結合位點。設計引物用PCR法從基因組DNA中克隆所需的靶啟動子片段,將此片段插入到熒光素酶報告基因質粒(pGL3-basic)中。篩選陽性克隆,測序。擴增克隆并提純質粒備用。擴增轉錄因子質
熒光素酶報告基因的技術流程
啟動子的預測轉錄因子的預測報告基因質粒的構建實驗方法及結果分析?用生物信息學方法分析并預測啟動子區可能的轉錄因子結合位點。設計引物用PCR法從基因組DNA中克隆所需的靶啟動子片段,將此片段插入到熒光素酶報告基因質粒(pGL3-basic)中。篩選陽性克隆,測序。擴增克隆并提純質粒備用。擴增轉錄因子質
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(一)
概述長鏈非編碼RNA?(LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結
如何證明基因需要轉錄調控元件調控表達
如何證明基因需要轉錄調控元件調控表達如果此轉錄因子能夠激活靶啟動子,則熒光素酶基因就會表達,從而對基因的表達起抑制或增強的作用,通過檢測熒光的強度可以測定熒光素酶的活性:(1)構建一個將靶啟動子的特定片段插入到熒光素酶表達序列前方的報告基因質粒,熒光素酶與底物反應,如pGL3-basic等。(3)
tDEG(轉錄組差異表達基因深度分析)
?本公司采用自主研發與成熟開源軟件相結合的方式構建了專業高效的生物信息分析流程,對您獲得的海量RNA-seq序列的質量、特征等重要信息進行圖形可視化;對兩個以上生物學樣本之間的差異表達基因進行可信分析;對差異表達所揭示出的重要科學問題進行中肯分析;讓您快速“發現”所關注生物學問題,醫學問題和農業問題
胚胎干細胞轉錄因子NANOG的新發現
在胚胎干細胞的自我更新中,轉錄因子Nanog 具有關鍵性的作用,這一因子也一直是近年來研究的熱點。最近,西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)的科學家們發現,NANOG也調控成體生物分層上皮細胞的細胞分裂,分層上皮細胞是皮膚表皮的組成部分,或者覆蓋在食管和陰道表面。相關研究結果發表在最近的《自然通訊