微生物組研究：關乎人類的未來
當人類第一次認識到微生物的存在時，并不知道這種個頭微小的生命體是地球生態系統的基石、關系人類健康的重要因素——它不僅將極大地幫助人類克服當今所面臨的生存挑戰，還能提供人類未來生存之道。如今，人類基因組的神秘面紗已漸漸揭開，微生物組又成為各國生命科學競爭的焦點，紛紛啟動微生物組研究計劃。科學家們呼吁，在人類基因組計劃中作為后來者和參與者的中國，應在新一輪國際大科學計劃的競爭中加快步伐，這樣才能在未來的競爭中占有一席之地。微生物組與人體健康1928年7月，科學家亞歷山大·弗萊明揭開了發現微生物合成抗生素的偉大時代。青霉素就是一種微生物的代謝產物。它的發現，挽救了無數人的生命，并顯著提高了人類普遍的壽命。一種微生物拯救了成千上萬的個體生命，一群微生物能夠拯救未來人類的生存。自微生物組概念提出以來，人們對微生物組的關注熱度不斷增加，分析梳理在各個領域取得的顯著成果發現，人們對人體健康微生物組關注最大，特別是在消化道微生物組方面，已經發現......閱讀全文
微生物做代謝組學分析的樣品怎么處理
微生物代謝組學主要研究細胞生長或生長周期百某一時刻細胞內外所有低分子量代度謝物。分析技術的不斷發展促進了微生物代謝組學研究的進展。本文結合微生物樣品前處理方法,綜述了目前研究中所采用內的各種分析技術的特點與應用,并展望微生物代謝組學研究中容分析技術的發展趨勢。
揭秘機體微生物組與人類健康之間的關聯
人類機體中充滿了能夠幫助消化食物和對抗疾病的細菌，但由于飲食、居住地、愛好甚至病史的不同，兩個人的體內可能會存在不同種類的細菌。長期以來科學家們一直在研究尋找哪種細菌與人類疾病有關，以及哪些細菌能幫助機體抵御疾病發生，研究人員對人類機體微生物組進行比較研究后得出的結論往往并不一致，因為他們分析的
全球微生物模式基因組測序計劃獲進展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在線發表了國家微生物科學數據中心（中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心）關于全球模式微生物基因組數據庫gcType的論文。gcType是由我國牽頭的全球模式微生物基因組測序計劃的重要成果。 模式菌株（t
Science新子刊：前所未知的別樣微生物組
科學家們收集了來自亞馬遜部落Yanomami族人的口腔、皮膚和糞便細菌樣品，發現這些微生物群與我們所知的微生物大不同，這些原始部落的人從未與西方人群接觸過，而他們體內存在的這些藥物抗性基因也許未來能用于臨床醫療。 這一研究成果公布在4月17日的Science Advances雜志上。 Sci
改變機體腸道微生物組真能逆轉乳糖不耐受？
童年以后，全球大約三分之二的人群都會失去消化牛奶的能力，正如我們所知，斷奶后100%的非人類哺乳動物也會失去這種能力，進入成年期，持續消化乳糖（牛奶中的主要糖類）的能力是一種生物學異常表現。 乳糖并不會被腸道直接吸收，相反，其必須被乳糖酶破碎成兩種較小的糖類分子，正常情況下， 產生乳糖酶的基因
微生物組測序分析的一大問題
BMC Biology雜志上的一項研究指出，許多已發表的微生物組研究其實受到了污染，錯誤的報告了來自于環境的雜菌。研究人員認為，在臨床樣本中檢測到出人意料的細菌時，不應過早將其于疾病聯系在一起。 我們機體內生活著不計其數的微生物，它們組成的生態系統就是微生物組。微生物組參與了許多重要的機體功能
研究發現腫瘤內微生物組可預測肝癌預后
近日，Clinical and Translational Medicine以論著形式發表了北京協和醫院肝臟外科主任醫師毛一雷、副研究員楊華瑜團隊關于肝細胞癌腫瘤內微生物組相關研究。研究顯示，肝細胞癌腫瘤內微生物組顯著不同于癌旁組織，不同患者之間、同一患者的不同病灶之間均存在明顯異質性。這表明肝
微生物組影響的不僅是腸道，還有頭發
為了讓自己看上去美美噠，每個人每年都在頭發上花了不少時間和金錢。不過，也許你還不知道，細菌和頭發之間也存在著一種奇怪的共生關系。近日，加州大學舊金山分校的研究人員在《Cell Host & Microbe》上闡明了這種關系。 調節性T細胞（Treg）是一類讓人體能夠耐受共生微生物的免疫細胞，
呼吸道微生物組決定機制研究獲進展
近日，中山大學中山醫學院教授丁濤團隊與教授田國寶團隊合作，研究揭示了口腔細菌對于肺部菌群和肺部健康的差異化塑造作用。相關研究在線發表于《先進科學》（Advanced Science）。 該研究團隊發現，肺部菌群由口腔和鼻腔菌的輸入共同塑造，而口腔菌輸入占比越高所塑造的肺部菌群與肺部炎癥因子的上
斷奶、抗生素都會影響孩子的微生物組
我們腸道中的共生菌能夠與正常細胞過程相互作用，生產人體所必需的物質（比如氨基酸）。理解腸道菌對代謝、免疫和行為的影響，一直是科學家們的研究熱點。 本期《Cell Host & Microbe》推出了“The Host-Microbiota Balance”特刊，通過一系列文章探討了宿主與共生菌
兩篇Science發表微生物組研究重要成果
人類消化道中居住著大量的微生物，它們被統稱為腸道微生物組。腸道微生物組在人類代謝食物、抵御感染和應答藥物等過程中起到了重要的作用。許多人類疾病都與微生物組失衡有關。 Science雜志周五發表的兩項大規模研究首次揭示了生活方式與腸道微生物組的關聯。研究顯示，生活中許多因素都能改變腸道微生物組的
王云強組對延安“治溝造地”工程生態環境效應評價研究
人口增長和城鎮化發展增強了對可利用土地的需求。一方面，人口增長需要更多的農業用地來維持糧食生產；另一方面，城鎮化的發展加劇了土地的碎塊化，使人-地關系更加緊張。黃土高原是我國典型的生態環境脆弱區之一，為緩解該區耕地面積減少和人-地關系緊張問題，2011年延安市率先實施了“治溝造地”工程。然而，由
微生物所等發表植物基因組編輯研究綜述
序列特異性核酸酶使得基因組編輯成為可能，快速推動了基礎和應用生物學的發展。CRISPR-Cas9系統自出現以來，作為可轉化植物的基因組編輯工具已得到廣泛應用。CRISPR-Cas9對基因組靶位點進行定向切割，造成DNA雙鏈斷裂。DNA雙鏈斷裂主要通過兩種高度保守的機制進行修復，即非同源末端連接
微生物組科學研究新發現帶來治療革命
組成人體的細胞大約有 10 萬億個。這是一個巨大的數字，但與生活在人體內及體表的 40 萬億個細菌細胞相比，10 萬億顯然少了一大截。研究人員試圖用細菌來治病。 細菌可被用來治病 據全國廣播公司新聞網（NBC News）報道，近些年來，科學家們了解到，人們身上及體內的細菌（統稱為微生物組）與
華大基因參與全球最大微生物基因組研究項目
華大基因3月22日宣布將參與全球最大微生物基因組研究項目EarthMicrobiomeProject(簡稱“EMP”)，將負責EMP亞洲地區所有樣本的收集和鑒定，并對整個項目提供DNA提取、擴增、建庫、宏基因組測序，以及研發生物信息學分析流程所需的計算資源。 EMP將對來自全球的20萬個樣本進
Cell：震驚！腫瘤微生物組竟能決定癌癥患者的生死
在一項新的研究中，來自美國德克薩斯大學MD安德森癌癥研究中心的研究人員發現少數長期存活的胰腺癌患者與許多對所有治療方案都無效的胰腺癌患者之間的一個關鍵區別在于他們的腫瘤中的細菌群落刺激或抑制免疫反應。相關研究結果發表在2019年8月8日的Cell期刊上，論文標題為“Tumor Microbiom
“萬種微生物基因組計劃”在深圳啟動
由深圳華大基因研究院聯合中國微生物領域頂尖研究機構、院校和企業組成的“萬種微生物基因計劃”，八月一日在深圳啟動。 據悉，該計劃是深圳華大基因研究院在“國際千人基因組計劃”后啟動的又一重大基因組計劃，目前該計劃的地位為亞洲第一、世界第三。 該計劃預計在三年內完成一萬種微生物物種全基因組
Cell：震驚！腫瘤微生物組竟能決定癌癥患者的生死
在一項新的研究中，來自美國德克薩斯大學MD安德森癌癥研究中心的研究人員發現少數長期存活的胰腺癌患者與許多對所有治療方案都無效的胰腺癌患者之間的一個關鍵區別在于他們的腫瘤中的細菌群落刺激或抑制免疫反應。相關研究結果發表在2019年8月8日的Cell期刊上，論文標題為“Tumor Microbiom
權威期刊：微生物組學對于精準醫療不可或缺
來自美國芝加哥大學的科學家們，在11月1日的《Trends in Pharmacological Sciences》發表的一篇評論文章認為，微生物組學研究，對于未來的精準醫療項目是不可或缺的。《Trends in Pharmacological Sciences》 是美國著名出版集團Cell Pre
Nat－Commun：研究發現數學指數能預測健康微生物組
是什么導致某些人更容易患類風濕性關節炎，癌癥和代謝綜合癥等慢性疾病？在腸道微生物組中或許可以幫助揭示其中的主要線索。 近日，梅奧診所的研究人員開發了腸道微生物組健康指數。該指數將健康的微生物組與患病的微生物組區分開來。（圖片來源：Www.pixabay.com） 在9月15日出版的《natu
分子植物卓越中心等提出“農業精準微生物組”概念
10月7日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心王二濤研究組和深圳華大生命科學院合作，在《自然-通訊》（Nature Communications）上，發表了題為GWAS, MWAS and mGWAS provide insights into precision agriculture bas
中美德科學家呼吁啟動《國際微生物組計劃》
《自然》刊物28日在線發表了一篇來自中國、美國和德國科學家的評論文章，呼吁建立國際微生物組計劃。“想搞清楚微生物如何影響人和地球的健康，需要啟動一個《國際微生物組計劃》。”中國上海交通大學生命學院教授趙立平、美國威斯康星大學麥迪遜分校動物學教授瑪格麗特和德國馬普海洋微生物學研究所教授妮科爾認為，
解讀人類機體如何與腸道微生物組共生共榮
長期以來，我們一直認為“良好”的免疫細胞能夠幫助識別并且抵御外來入侵者，這就是為何很大一部分藥物能夠直接靶向殺滅致病微生物并且抵御這些微生物引發的感染。對機體免疫力的理解往往能夠反映20世紀的文化，同時，適者生存也是促進進化和競爭發生的驅動子，但理解人類和微生物之間的根本改變往往始于體內50%的
基于微生物組大數據的疾病檢測方法來了
微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創的解決方案。該工作于3月17日在線發表于mSystems（美國微生物學會會刊）
益生菌與微生物組研發、應用或成大健康產業焦點
近年來，在微生物學領域，關于益生菌等微生態制劑的研究進入了新的層次，隨著第二代益生菌制劑的應用，國內對益生菌及微生物組學的研究掀起了新一輪高潮。9 月 16 日至 9 月 17 日，由全國衛生產業企業管理協會、中華醫學會指導，上海真合生物和真合園——醫療資源整合及慢性病管理平臺聯合承辦的第二屆真
人類微生物組整合計劃（iHMP）研究成果發布
英國《自然》《自然·醫學》雜志5月29日同時發表了人類微生物組整合計劃（iHMP）的三篇論文及兩篇相關評論，向人們深刻揭示了宿主和微生物組之間的互作是如何影響人類身體健康的。此次獲得的發現，不但代表了某些疾病中宿主和微生物關系的迄今最全面描述，還有助于科學家表征多種疾病，預測病人轉歸，進而在未來
Nature子刊：低谷蛋白飲食改變人類微生物組
一項新研究發現，采用低谷蛋白飲食可適度改變人體腸道中細菌種類的成分。這一結果表明，低谷蛋白飲食帶來的一些積極效果，例如飯后腹脹減少，可能是飲食引起的腸道微生物組變化的結果。 這一研究成果公布在Nature Communications雜志上，這一項隨機對照試驗指出腸道細菌豐度的變化，可能并不是
微生物組學助力癌癥免疫療法，阿斯利康達成合作
近日，Seres Therapeutics宣布將與阿斯利康（AstraZeneca）開展一項為期3年的研究合作。兩家公司將從機理方面去試圖理解微生物組學如何增益癌癥免疫療法，包括和阿斯利康產品的潛在協同作用。在兩年時間內，阿斯利康將向Seres支付2000萬美元的分期付款，并為Seres提供與合
宏基因組學：查明微生物身份新手段
背景 《美國醫學會雜志》(JAMA)近期刊發了一篇題為《利用不需培養的宏基因組學測序技術研究產志賀毒素大腸桿菌O104∶H4暴發株》的研究論文，引起了學界和社會的廣泛關注。這篇論文中應用了一種稱為“宏基因組學”的技術方法，不通過培養，直接從病人樣品中檢測分析其攜帶的病原微生物，甚至可以
口腔、腸道微生物菌群元基因組關聯分析
2015年7月28日，北京協和醫院和華大基因等機構的研究人員共同合作完成了類風濕關節炎（RA）口腔和腸道微生物元基因組研究。本項研究揭示口腔和腸道微生物菌群異常是RA病理生理和疾控的重要環節，并且為元基因組學輔助的RA個性化診療方案提供基礎。研究成果于今日發表在《自然醫學》雜志。 RA是一種致