北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas、犬類數據庫iDog、RNA編輯與疾病相關知識庫EDK、植物RNA編輯數據庫PED、人類長非編碼RNA數據庫LncBook、多物種全基因組核小體定位圖譜數據庫NucMap以及一篇介紹大數據中心整體資源建設進展的文章。 自成立以來，BIGD面向我國人口健康和社會可持續發展的重大戰略需求，圍繞國家精準醫學和重要戰略生物資源的組學數據，建立了針對原始數據遞交、存儲與共享的數據庫GSA，基因組變異數據庫GVM，基因組歸檔數據庫GWH，基因表達數據庫GEN，DNA甲基化數據庫Methbank，基于維基的生物學知識庫Science Wikis，......閱讀全文
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志，標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術，其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境，從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日，中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作，證實界面極化
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
科學家呼吁關注全球基因組數據庫污染
樣品處理有可能是導致DNA數據庫廣泛污染的最主要原因 2月16日發表在《公共科學圖書館·綜合》（PLoS ONE）期刊上的一份研究報告稱康涅狄格大學的遺傳學家Mark Longo及同事發現由頂級公共測序機構提供的測序結果構建的基因組數據庫中的大約1/5的細菌、植物和非靈長類動物基因
武漢科研團隊破譯并公布蓮基因組數據庫
近日，武漢市園林科學研究院和中科院武漢植物園攜手研發出破譯荷花遺傳密碼的蓮基因組數據庫。日前，該數據庫在國際知名學術期刊公布，供各國荷花研究人員免費共享。 據介紹，水生植物蓮是地球上最早出現的開花植物之一。研究發現，早在約1.4億年前蕨類植物和恐龍稱霸地球的時代，在北半球許多水域已有蓮的分布。
橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試
本報訊 日前，中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺（hevea.catas.cn）上線運行，并在國際橡膠研究與發展委員會（IRRDB）各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試，數據庫平臺各項指標保持穩定，運行可靠，達到
橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試
日前，中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺（hevea。catas。cn）上線運行，并在國際橡膠研究與發展委員會（IRRDB）各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試，數據庫平臺各項指標保持穩定，運行可靠，達到預期效果。
世界最大的自閉癥基因組數據庫公布
自閉癥，或稱為自閉癥譜系障礙，是指包括了社會技能、重復行為、語言和非語言交流、以及與眾不同的優勢或差異等多表征型障礙。我們現在得知，自閉癥分好多亞型，大多數由遺傳和環境共同作用造成。據估計，每68名兒童中就有一人患有自閉癥。雖然，目前自閉癥的干預方法很多。但是大多數缺乏循證醫學的證據。尚無最優治
基因組多樣性和祖源信息數據庫
?? 11月3日，中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）計算生物學研究所徐書華課題組的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
北京基因組所開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
我國發布首個柑桔全基因組變異數據庫
近日，《園藝研究》（Horticulture Research）在線發表了中國農業科學院柑桔研究所構建完成的柑桔全基因組變異數據庫CitGVD（http://citgvd.cric.cn/home），這是第一個園藝類作物全基因組變異數據庫。 柑桔是全世界最重要的商業水果作物之一。當前，柑桔類物
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
貝瑞和康建成全球最大婦科腫瘤基因組數據庫
基因組大數據的重大意義開始凸顯，貝瑞和康與阿里云合作開展的“神州基因組數據云”項目取得的階段性成果，便已經收效顯著。 9月23日，在第十九屆全國臨床腫瘤學大會暨CSCO學術年會上，北京貝瑞和康生物技術股份有限公司（以下簡稱“貝瑞和康”）公布了在生物信息分析領域和大數據建設方面做出的重要成果。
北京基因組所構建出多物種轉錄圖譜綜合數據庫
隨著高通量測序技術的發展，轉錄組測序（RNA-seq）已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法，并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生，以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息，服務生物醫學基礎研究領域需求，構
首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布
近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展，首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋，搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular Plant）上。 黃瓜是葫蘆科的重要經濟蔬菜作物。黃瓜基因組中有近3
首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布
近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展，首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋，搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular Plant）上。黃瓜參考基因組“9930”和核心種質資源。中國農科院蔬菜所
Nature子刊公布世界最大的自閉癥基因組數據庫
自閉癥，或稱為自閉癥譜系障礙，是指包括了社會技能、重復行為、語言和非語言交流、以及與眾不同的優勢或差異等多表征型障礙。我們現在得知，自閉癥分好多亞型，大多數由遺傳和環境共同作用造成。據估計，每68名兒童中就有一人患有自閉癥。雖然，目前自閉癥的干預方法很多。但是大多數缺乏循證醫學的證據。尚無最優治
科學家得到詳細的惡性膠質細胞瘤細胞基因組數據庫
科學家啟動了腫瘤基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas，TCGA)，打算分析所有組織的腫瘤細胞的基因組。腦組織腫瘤是科學家的第一個目標，因為其挑戰性大回報也最大。 TCGA收集了多形性成膠質細胞瘤(glioblastoma multiforme，GBM)的組
北京基因組所合作開發完成長非編碼RNA數據庫
長非編碼RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年來國際研究的新熱點,與人類癌癥、神經系統等疾病發生密切相關，在疾病診療方面表現出了潛在的重大應用價值。雖然長非編碼RNA表達量相對較低，但由于其在轉錄、基因組印記、翻譯、可變剪切、轉錄后表達調控、蛋白運輸與定位等過程的
北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫
DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
上海生科院發布基因組多樣性和祖源信息數據庫
?? 該研究分析了涵蓋全球范圍107個國家的356個人類族群的基因組多樣性和祖源信息，并發布了開放獲取的專門數據庫——PGG.Population（群體基因組學·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因組水平專門解析人類族群遺傳關系和祖源信息的公開數據庫，也是目前收集族群數量最大的群體基
基于同源基因簇的水稻泛基因組綜合數據庫建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室教授張建偉課題組聯合國內外高校與科研機構在《自然—通訊》與《分子植物》連續發表兩篇研究論文。這兩項工作以代表亞洲稻群體結構的
天津大學：新冠病毒基因組注釋數據庫向全球開放
疫情就是命令！30日從天津大學獲悉，該校生物信息中心新型冠狀病毒基因組注釋數據庫上線，并納入中國國家基因組科學數據中心向全球開放服務。新型冠狀病毒基因組注釋數據庫 ZCURVE_CoV Database 網站截圖 面對疫情加快蔓延的嚴重形勢，科技界正在爭分奪秒與病毒抗爭，開展病毒防治相關藥物的
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul