半定量RTPCR(SemiQuantitativeRTPCR)
RT-PCR AnalysisSolutions10X RT Buffer10X PCR Buffer100 mM Tris pH 9.0500 mM KCl1% Triton X-10025 mM MgCl2use at a concentration of 1.5 mMLysis Solution4M GuSCN 250 g guanidine thiocyanate25mM Na citrate 7.0 17.6 ml 0.75M Na citrate pH 7.00.5% Sarkosyl 26.4 ml 10% Sarkosyladd 293 ml Qbefore use, add 72ml bMEbME added just prior to use. If collecting several samples hold tubes on ice. These can be s......閱讀全文
半定量RTPCR-(SemiQuantitative-RTPCR-)
RT-PCR?AnalysisSolutions10X RT Buffer10X?PCR?Buffer100 mM Tris pH 9.0500 mM KCl1% Triton X-10025 mM MgCl2use at a concentration of 1.5 mMLysis Solutio
定量RTPCR-(Quantitative-RTPCR)
Application:?Quantitative RT-PCR?is used to quantify mRNA in both relative and absolute terms. It can be applied for the quantification of mRNA expres
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 雙蒸水 RT-PCR 緩沖液 MMLV 逆轉錄酶 SUPERaseINRNA 酶抑制劑 Taq DNA 聚合酶 總 RNA
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
已知線性范圍的循環參數和 18SrRNA 引物與競爭子的比例,就可以用自己的樣品去做相對定量 RT-PCR。下面配制的 PCR 反應混合物包含 9 個反應(4 個樣品、4 個非反轉錄對照、1 個不加模板的對照)及 10% 的額外份額。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
試劑、試劑盒 雙蒸水RT-PCR 緩沖液MMLV 逆轉錄酶SUPERaseINRNA 酶抑制劑 Taq DNA 聚合酶總 RNA 隨機引物dNTP 混合物 基因特異的正向引物基因特異的反向引物[a-32P]dCTP儀器、耗材 Quantu mRNA Universal 18S standards P
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術
microRNA的實時定量莖環RT-PCR技術 摘要: 已開發出一種新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用莖環反轉錄,Taqman PCR分析。莖環RT引物在RT 效率和特異性方面比傳統的更好。TaqMan miRNA的檢測是很具體的,可以檢測成熟miRNA和區分
RTPCR-PROTOCOL
RT-PCR PROTOCOL材料與方法…………………………………………………………????1.材料?………………………………………………………1.1?供試用組織(細胞)…………………………………1.2?主要儀器設備………………………………………1.3?主要試劑……………………………………………1.
Standard-RTPCR
RT-PCR or reverse transcription PCR refers to PCR that uses product of an RT reaction as template. In effect, the PCR amplifies cDNA fragments. In?one
RTPCR之我見
本文討論的范圍包括RNA酶保護分析,northernblot,原位雜交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不談具體protocol,是因為各種書籍和kit說明書上都有,主要說一些原則,而且大部分是失敗和成功的經驗,還有小組討論結果以及各種書里七零八落看的內容,希望對大家有用。?基因表達的定義
RTPCR步驟
總RNA提取1. 取200mg組織,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。2. 震蕩30s。3. 加0.2ml氯仿,劇烈搖動30s,室溫3min。4. 12000×g,4℃ 離心,15min。5. 吸上層無色水相,移入另一EP管中(約0.5ml)。6. 加等體積異丙醇,-20℃,3
RTPCR技術簡介和RTPCR引物的選擇
RT-PCR簡介RT-PCR是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用從RNA合成 cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cD
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術(四)
?圖5。對熱處理細胞,細胞裂解液和10 miRNA實時定量總RNA進行比較。用閾值循環(CT)來衡量miRNA的表達水平。每PCR擴增約400 HepG2細胞進行了分析。??圖6。的TaqMan miRNAmiR-16的分析比較來解決以印跡雜交為基礎的分析。總RNA來自小鼠腎,肝,肺,脾和睪丸組織。
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術(二)
圖1。上圖描述的是TaqMan miRNA的檢測原理,基于TaqMan實時定量miRNA的包括兩個步驟,莖環RT和實時PCR。莖環RT引物結合在miRNA分子的3'端和用反轉錄酶逆轉錄。然后,RT產品使用傳統的TaqMan PCR定量,其中包括特定miRNA的正向引物,反向引物和
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術(五)
TaqMan miRNA的檢測能力不同,是依據采用let-7a, let-7b, let-7c, let-7d 和let-7e 5個合成miRNA來檢測低至一個核苷酸(圖7)。每個miRNA的檢測對應每個miRNA。相對探測效率是通過計完全匹配和不匹配的目標CT之間的差異,假設完美匹配的效率為1
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術(三)
評估RNA分離的需要,我們直接在miRNA的檢測中增加了細胞裂解物。相當于直接在7.5毫升逆轉錄反應中添加2.5-2500細胞。當檢測到,在一些細胞中CT值相關R2>0.998)的RT反應至少有三個數量級(圖4)。?圖3。總RNA輸入的閾值循環(CT)值檢測8個miRNA的相關性。每RT反應中,小鼠
microRNA的實時定量莖環RTPCR技術(一)
摘要:已開發出一種新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用莖環反轉錄,Taqman PCR分析。莖環RT引物在RT 效率和特異性方面比傳統的更好。TaqMan miRNA的檢測是很具體的,可以檢測成熟miRNA和區分相關的甚至低至一個核苷酸的miRNAs。此外,他們不會受到基因組DNA
實時熒光定量RTPCR的Fold-change怎么計算
3. Real-time qPCR定量方法可以分為絕對定量和相對定量。絕對定量是用一系列已知濃度的標準品制作標準曲線,在相同的條件下目的基因測得的熒光信號量同標準曲線進行比較,從而得到目的基因的量。該標準品可以是純化的質粒DNA,體外轉錄的RNA,或者是體外合成的ssDNA。相對定量可以分為比較Ct
什么是RTPCR,RTPCR的定義與檢測方法?
1.定義:是以RNA為模板,聯合逆轉錄反應(reverse transcription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數細胞中少于10個拷貝的RNA模板。?RNA擴增包括兩個步驟: 在單引物的介導下和逆轉錄酶的催化下,合成RNA的互補cDNA;加熱后cDNA與RNA鏈解離,然后與另一引物退火
Protocol-for-competitive-RTPCR
For quantifying mRNA, we use a competitive RT-PCR protocol with internal standard RNAs. These are added in a defined quantity to the RNA sample prior
RTPCR的原理
原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。該技術主要用于:分析基因的轉錄產物、獲取目的基因、合成cDNA探針、構建RNA高效轉錄系統。RT- PCR(Re
RTPCR實驗流程
1、技術原理實時熒光定量PCR是在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號累積實時檢測整個PCR進程,zui后通過Ct值與標準曲線的處理對未知樣本進行定量分析,是zui常用的基因表達分析技術。有絕對定量與相對定量兩種定量分析方法。??圖 各種熒光定量曲線示意圖2、服務流程及質控2.1?實驗流程樣本
實時-RTPCR-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 RNA 模板 DNA 酶緩沖液 DNA 酶 I DEPC 處理的水 oligo(dT) MgCl2 dNT
實時-RTPCR-實驗
試劑、試劑盒 RNA 模板DNA 酶緩沖液 DNA 酶 IDEPC 處理的水oligo(dT)MgCl2 dNTPEDTA實驗步驟 —、材料1. 緩沖液、溶液和試劑①10ul 消化體系的組分。RNA 模板(最多 1ug/10ul) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? xul10X
RTPCR經驗淺談
RT-PCR成敗的關鍵首先在于RNA模板的制備以問者的口氣應該是做RNA病毒基因的RT-PCR本人三年前做過一個正鏈RNA病毒全基因組分段擴增設計方案是將全基因組分成7個片段,0.6kb-3.3kb不等分別進行RT-PCR擴增剛開始的三個月我們課題組三個人辛辛苦苦什么招都想過了結果連一個片段都沒有拿
實時-RTPCR-實驗
本方法使用Superscription反轉錄系統合成cDNA。進行實時PCR時,FAM或JOE熒光基團既可以標記正向引物,也可以標記反向引物。可以用Trizol試劑提取RNA或按第10章描述的方法提取RNA。樣品中的基因組DNA用DNaseI消化掉(參照第10章)。本實驗來源于PCR實驗指南(第二版
RTPCR技術1
目前已有多種方法用來研究有關細胞和組織中,基因表達產物方面的內容,這些方法主要有Northern印跡、RNase保護分析法、原位雜交、點印跡、S1核酸酶分析法及反轉錄與PCR擴增串聯的RT-PCR技術等。在這些方法中RT-PCR技術具敏感度高和應用范圍廣的特點,該技術提供給研究人員有效的進行測定轉錄
RTPCR實驗步驟
實驗材料:水稻葉片的 RNA 。實驗原理:目前?PCR?技術只能擴增?DNA?模板,對 RNA 模板不能直接擴增。mRNA反轉錄生成的?cDNA?可作為 PCR 的模板進行擴增,這種在 mRNA 反轉錄后進行的 PCR 擴增稱為?RT-PCR?。 RT-PCR 比 Northern 雜交更靈敏,對
RTPCR經驗淺談
做RNA病毒基因的RT-PCR成敗的關鍵首先在于RNA模板的制備。本人三年前做過一個正鏈RNA病毒全基因組分段擴增,設計方案是將全基因組分成7個片段,0.6kb-3.3kb不等,分別進行RT-PCR擴增,剛開始的三個月,我們課題組三個人辛辛苦苦,什么招都想過了,結果連一個片段都沒有拿到。后來有一個周
RTPCR技術2
三:操作1:反轉錄反應按下表準備反應液樣品 體積 終濃度5×反應緩沖液 10μl 1×dNTP混合液 1μl 0.2mM下游引物 50pmol* 1μm上游引物 50pmol* 1μm25mM MgSO4 2μL 1mMAMV反轉錄酶 1μl 0.1μ/μlTflDNA聚合酶 1μl 0.1μ/μl
RTPCR實驗步驟
一、組織抽提:1.???????取組織塊50-100㎎用液氮在研缽中研磨成粉末2.???????移入玻璃勻漿器加入1ml Trizol?抽打勻漿3.???????移入1.5ml新離心管用5 ml針頭抽打4.???????冰上孵育5分鐘5.???????離心12,000g??4℃??5分鐘?取上清液移