植物DNA去甲基化的機理和功能
10月19日，Journal of Integrative Plant Biology（JIPB）在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心上海植物逆境生物學研究中心郎曌博研究組題為The mechanism and function of active DNA demethylation in plants 的綜述論文。這篇文章概述了最新的植物中DNA去甲基化的調控機理，以及其在模式植物和作物中的生物學功能。 DNA甲基化修飾主要指5-甲基胞嘧啶（5mC），它是一種可逆的表觀遺傳修飾。在植物中，基因組上的5mC 可以由ROS1 家族蛋白介導切掉，之后再由堿基修復機制合成非甲基化胞嘧啶，從而造成基因組的DNA去甲基化。因此，ROS1家族蛋白也被稱為DNA去甲基化酶（擬南芥中有四個DNA去甲基化酶編碼基因，包括AtROS1，AtDME，AtDML2和AtDML3)。該綜述總結了最新的DNA去甲基化的分子機理，著重概述了調控......閱讀全文
DNA去甲基化酶催化作用介紹
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脫掉甲基化堿基的反應，等同于被損傷的DNA在糖苷酶及無堿基核酸酶酶切偶聯催化下的修復反應。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是體內侯選去甲基化酶。此外，甲基化CpG結合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
廣州生物院發現DNA被動去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表觀遺傳學修飾之一，多項生物學過程均涉及DNA甲基化水平的調控。近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院鄭輝課題組通過研究細胞增殖過程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的調控，發現DNA被動去甲基化的新作用。相關研究成果在線發表在Journal of Biol
廣州生物院發現DNA被動去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表觀遺傳學修飾之一，多項生物學過程均涉及DNA甲基化水平的調控。近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院鄭輝課題組通過研究細胞增殖過程中DNA甲基化（胞嘧啶的甲基化）的調控，發現DNA被動去甲基化的新作用。相關研究成果在線發表在Journal of Biol
植物組織制備基因組DNA實驗
氯化銫法 CTAB法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中， 可用玻棒將其取出，而小分子DNA則
植物組織制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中， 可用玻棒將其取出，而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部， 從而達到提取的目的。實驗材料?植物組織試劑、試劑盒?抽提緩沖液十二烷基肌氨酸鈉TE異丙醇溴化乙錠氯化銫儀器、耗材?離心機實驗步驟 ? 收取1
SDS法提取植物基因組DNA
本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的組織細胞用熱的SDS裂解后，加入高濃度的KAc，0℃放置以除去蛋白和多糖類雜質，最后用乙醇或異丙醇沉淀。一 材料、試劑和儀器1 材料 新鮮的組織材料或-80℃凍存的材料2 試劑(1)提取緩沖液Tris-H
植物組織中DNA的提取與測定
一、原理 脫氧核糖核酸（deoxyribonucleicacid，DNA）是一切生物細胞的重要組成成分，主要存在于細胞核中，鹽溶法是提取DNA的常規技術之一。從細胞中分離得到的DNA是與蛋白質結合的DNA，其中還含有大量RNA，即核糖核蛋白。如何有效地將這兩種核蛋白分開是技術的關鍵。D
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測，并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有：GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
DNA純化去雜質實驗
這周我們來討論一項常用的技術，即使常用但仍引起部分人核酸分離焦慮癥。那就是基因組DNA的純化去雜質。場景是這樣的：你有一份采自南太平洋中部一個偏僻小島上首次發現的古老蘭花品種根際土壤樣品。你使用了非PowerSoil Kit法提取其中的微生物DNA。最終DNA含有太多雜質，無法PCR擴增。因此需要去
研究首次揭示DNA主動去甲基化可靶向病毒基因
βC1在體外和體內增強DME活性。中國農科院植保所供圖 近日，中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊聯合清華大學生命科學學院，首次發現植物病毒可以利用植物的DNA主動去甲基化機制來逃逸植物的防御反應，相關研究結果在線發表于《自然—通訊》（Nature Communicati
裴端卿組綜述DNA去甲基化的級聯調控模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院裴端卿課題組綜合近期體細胞重編程過程中TET相關DNA去甲基化的研究進展【1】和之前的相關研究，對細胞命運變化過程中的DNA甲基化模式重排過程和級聯調控模型進行了調研，提出偶聯TET進行DNA去甲基化可能是轉錄因子打開染色質的一種基本模式，該綜述以The Bat
上海生科院發現植物去甲基化調控的新機制
2月12日，國際權威學術期刊《分子細胞》（Molecular Cell）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組的研究論文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
植物總DNA的快速少量抽提實驗
CTAB法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 CTAB法：該方法簡便、快速，DNA產量高(純度稍次，適用于一般分子生物學操作)。?CTAB是一種非離子去污劑，植物材料在CTAB的
利用CTAB法提取植物基因組DNA
一、實驗原理 CTAB（十六烷基三甲基溴化銨）是一種去污劑，可溶解細胞膜并能與核酸形成復合物，該復合物在高離子強度（0.7mol/L）的溶液里是可溶的，通過離心可將復合物同蛋白質、多糖類物質分開。在酚仿變性的條件下，去除殘留的CTAB和蛋白質等雜質，然后利用異戊醇或無水乙醇將DNA分
植物總DNA的快速少量抽提實驗
實驗方法原理 CTAB法：該方法簡便、快速，DNA產量高(純度稍次，適用于一般分子生物學操作)。 CTAB是一種非離子去污劑，植物材料在CTAB的處理下，結合65 °C水浴使細胞裂解、蛋白質變性、DNA被釋放出來。CTAB與核酸形成復合物，此復合物在高鹽（>0.7 mM）濃度下可溶，并穩
植物和動物DNA提取方法有何不同
后面的步驟都一樣，就是前處理所用的方法和試劑不太一樣，植物需用機械或酶去壁，動物需用胰蛋白酶去膜。當然這里的動物DNA提取指的是動物組織DNA的提取，如果用動物血就要簡單的多了。所謂前處理，指的就是裂解的過程，讓細胞破碎，使DNA跑出來，然后對DNA進行收集。
粗提取植物DNA的實驗步驟和原理
提取植物DNA常用的方法是CTAB法。原理：CTAB是一種陽離子去污劑,具有從低離子強度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特性。在高離子強度的溶液中(>0.7mol/L NaCl)，CTAB與蛋白質和多聚糖形成復合物，只是不能沉淀核酸。通過有機溶劑抽提，去除蛋白，多糖，酚類等雜質后加入乙醇沉淀即可使核酸分
植物總DNA抽提方法和優缺點
1、植物DNA的CTAB提取法：經典方法。效果較好，污染少。多用于核基因組提取。2、SDS提取法：較為簡易，提取的為全基因組，但有蛋白污染可能。3、簡易“一管法”提取方法：4、PCR研究的快速提取法：以上兩者方法簡單，快速，但污染多，不適合做酶切等操作。5、酚類、多糖類物質較多的植物DNA提取法：多
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用，是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DN
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作為甲基供體，通過共價鍵結合的
華南植物園鼎湖山植物DNA條形碼研究獲進展
日前，中科院華南植物園研究人員在鼎湖山木本植物DNA條形碼研究方面取得重要進展。相關結果在線發表于《多樣性及其分布》上。 DNA條形碼技術是一種利用標準的簡短基因片段來實現物種快速識別的工具。動物界，線粒體COI基因應用非常成功。但是在植物界，由于進化歷史復雜，標準條形碼還沒有達成共識。 針
上海生科院揭示擬南芥DNA主動去甲基化調控新機制
12月9日，《細胞研究》（Cell Research）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
9月11日，國際學術期刊《細胞—干細胞》（Cell Stem Cell）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所徐國良研究組、李勁松研究組和北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組的最新研究成果Active and Passive Demethylation
上海生科院發現Gadd45a參與DNA去甲基化的機制
4月6日，國際學術期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所徐國良研究組題為Gadd45a promotes DNA demethylation through TDG 的最新研究成果。該研究發現Gadd45a
生化與細胞所DNA去甲基化機制研究有新發現
高等生物的基因組DNA中除含有腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四種常見的堿基形式外，還含有胞嘧啶的修飾形式：5-甲基胞嘧啶(5mC)，被稱為第5種堿基。而且它可以進一步被氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)，也被稱為第6堿基。這些修飾形式在表觀調控中都具有重要的作用，但它們
一種簡單實用的提取植物DNA實驗
實驗方法原理的提取是植物分子生物學和基因工程研究的一種基本的技術，至今已有了數種方法。此方法最大的特點是：將SDS同時用作細胞膜的去污劑和蛋白質的變性劑，變性的蛋白質通過離心而不是酚抽提除去，使得整個操作過程變得簡單快捷，比較溫和，1小時左右就可以獲得純化的植物DNA。用這種方法得到的DNA能直接被
使用離心機提取植物基因組DNA
植物基因組DNA提取使用什么樣的離心機做?具體步驟怎么樣？植物組織提取基因組DNA 一、材料 幼嫩葉子。 二、設備 移液器，冷凍高速離心機，臺式高速離心機，水浴鍋，陶瓷研缽，50ml離心管（有蓋）及5ml和1.5ml離心管，彎成鉤狀的小玻棒。（這時選擇設備的時候注意選擇那種通用性強的，可以一機配多種