最新進展:RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學(LMU)研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然,只有當細胞處于應激狀態時,這種修飾才會附著在分子上,并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸(RNA)在化學形式上與DNA密切相關,而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上,RNA本身在將遺傳信息轉換成蛋白質的過程中起著核心作用。 (圖片來源:Www.pixabay.com) 像DNA一樣,RNA分子由稱為核堿基的四種不同類型亞基的序列組成,它們通過糖-磷酸酯鍵相互連接。在所有生物中,可以對這些亞基進行選擇性修飾,以調節其相互作用和功能。 現在,化學系Stefanie Kellner博士與Kirsten Jung(LMU微生物學教授)合作發現了細菌RNA的一種新穎的-生物化學上非常不尋常的修飾。當微生物受到壓力時會附著修飾物,當條件恢復正常時可立即將其去除。新發現發表在在線雜志《Nature Communicati......閱讀全文
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白質和核酸的一種重要的修飾,調節基因的表達和關閉,與癌癥、衰老、老年癡呆等許多疾病密切相關,是表觀遺傳學的重要研究內容之一。 最常見的甲基化修飾有DNA甲基化和組蛋白甲基化。DNA甲基化能關閉某些基因的活性,去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、D
dna甲基化與rna甲基化的區別
DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點:都有包含甲基化修飾;不同點:修飾對象不同,一個是對DNA修飾,一個是對蛋白:組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解,與前兩者差異較大。
羅氏甲基化捕獲試劑創新甲基化研究方法
自2004年美國批準Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治療以來,通過改變致病基因的表觀遺傳學特征進行疾病治療的方法,為人們帶來了疾病的新治療策略。然而,由于表觀遺傳檢測方法的局限,要確定基因的堿基在何處以何種程度被甲基化一直以來困擾著研究者,從而難以確定基
什么是甲基化?
甲基化是指從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上將甲基催化轉移到其他化合物的過程。可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸(RNA)加工。
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
什么是甲基化?
甲基化,是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉移到其他化合物的過程,可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸加工。
什么是甲基化
甲基化是指從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上將甲基催化轉移到其他化合物的過程。可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸(RNA)加工
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》(影響因子:
甲基化的概念
甲基化,是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉移到其他化合物的過程,可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸加工。
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶,能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2(NSUN2-/-HEK293細胞)后進行
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測,并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有:GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
什么叫甲基化
甲基化(Methylation)指向底物引入甲基的過程,一般是以甲基取代氫原子.在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸(RNA)加工.重金屬修飾可以在生物系統外發生.組織樣本的化學甲基化也是組織染色的方法之一.甲基化是蛋白質和核酸的一
甲基化特異性-PCR-確定-DNA-甲基化的模式
用 PCR 來分析 DNA 甲基化的方法可以運用于:(1)對基因組中任何位置的 CpG 甲基化的分析;(2)檢測腫瘤患者的基因改變以及介人被印的基因的固定遺傳障礙的研究。實驗方法原理DNA甲基化(DNA methylation)是最早發現的修飾途徑之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、D
lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析
技術優勢:●?? 專注非編碼RNA領域,完善的lncRNA啟動子分析流程●???可與lncRNA表達譜芯片聯合應用,實現平臺間無縫對接●???可視化數據展示,提供paper級結果圖表●???優化的IP實驗方法,可信賴的檢測平臺及數據結果?介紹:????? 人類基因組中僅有約2%的DNA序列最
lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析綜述
技術優勢: ● 專注非編碼RNA領域,完善的lncRNA啟動子分析流程 ● 可與lncRNA表達譜芯片聯合應用,實現平臺間無縫對接 ● 可視化數據展示,提供paper級結果圖表 ● 優化的IP實驗方法,可信賴的檢測平臺及數據結果 介紹: 人類基因組中僅有
甲基化的檢測方法
(1) 甲基化特異性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變;隨后設計針對甲基化和非甲基化序列的引物進行PCR。通過電泳檢測MSP擴增產物,如果用針對處理后甲基化DNA鏈的引物能得到
甲基化干擾實驗用途
應用這種技術可以檢測靶DNA中G殘基的優先甲基化,對爾后的蛋白質結合作用究竟會有什么效應,從而更加詳細的揭示出DNA與蛋白質相互作用的模式。
關于甲基化的釋義
甲基化是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉移到其他化合物的過程。可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內,甲基化是經酶催化的,這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸加工。
什么是DNA甲基化?
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
甲基化檢測方法介紹
(1) 甲基化特異性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變;隨后設計針對甲基化和非甲基化序列的引物進行PCR。通過電泳檢測MSP擴增產物,如果用針對處理后甲基化DNA鏈的引物能得到
甲基化的主要類型
(1)DNA甲基化:脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點(胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點,即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點)。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化,但是在某些特定區域,如富含胞嘧啶和鳥嘌呤的CpG島則未被甲基化。這與
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能,這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能輕松的變廢為寶,竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章,你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作為最新的國自然熱點受到
甲基化的類型介紹
甲基化包括DNA甲基化和蛋白質甲基化。(1)DNA甲基化:脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點(胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點,即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點)。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化,但是在某些特定區域,如富含胞嘧
甲基化研究新思路
????????組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作為甲基供體,通過共價鍵結合的
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DN
什么是DNA甲基化?
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
甲基化熒光PCR檢測
?甲基化熒光檢測(methylight)是利用熒光定量性PCR檢測亞硫酸氫鈉處理后的序列改變。在TaqManR技術中,可以使用3種不同的單核苷酸(正義引物、反義引物和熒光雜交探針),進行不同序列的檢測。與已存在的技術相比,甲基化熒光檢測最明顯的優點就是能同時對幾百甚至幾千例樣品迅速檢測。???? 高
LightCycler應用:甲基化分析
主要應用:應用實時熒光PCR技術進行快速準確的DNA甲基化分析DNA甲基化是表觀遺傳學的重要研究內容之一,它可以在轉錄水平抑制基因的表達。具體的過程是在胞嘧啶-鳥嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一個額外的甲基團,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度較高的區域在人體基因組中呈非隨機分布于,