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表1 有效梯度內的采集數據分析 表2 HeLa和酵母樣本全蛋白鑒定結果 2.2 HeLa和酵母蛋白質組快速鑒定結果 數據經SEQUEST HT搜庫和Percolator卡值, 從1 μg和50 ng HeLa樣本中分別鑒定到20860和14100條肽段(q值0.01), 分別對應3865和2877個非冗余蛋白(表2), 而同樣的鑒定數量, 目前的報道至少需要2~3h[9]. 另外, 酵母樣本共鑒定到15083條肽段(q值0.01), 對應2697個非冗余蛋白(表2). HeLa數據進一步使用Preview軟件分析譜圖質量精度(圖2). 結果顯示, 母離子(m/z)質量精度平均為0 ppm, 子離子質量精度(m/z)平均為0.075 Da. 軌道肼質量偏差基本保持在5 ppm以內, 具有高質量精度和長期穩定的質量軸; 離子阱質量偏差基本保持在±0.2 Da以內, 質量精度良好,......閱讀全文
摘要 隨著“一小時酵母蛋白質組”的實現, 短梯度下實現蛋白質組深度覆蓋成為可能。本文利用全新Q-OT-qIT三合一質譜系統進行“一小時蛋白質組”分析與優化。50 min有效梯度, 單次實驗分別從1 μg和50 ng HeLa全蛋白中鑒定到20860和14100條肽段, 對應到3865和287
摘 要 Orbitrap Fusion Lumos 是基于Q-OT-qIT 平臺的第二代“三合一”質譜，通過離子入口、離子透鏡、四極桿、ETD和真空技術等方面的深度改進，將儀器整體性能優化至極致。配合“三合一”質譜魔法般的功能，Orbitrap Fusion Lumos 能夠有效應對蛋白