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A: 1 μg HeLa結果比較; B: 50 ng HeLa結果比較. 以每項最高值為100% 3 討論 隨著“一小時酵母蛋白質組”全覆蓋的實現, 蛋白質組深度覆蓋研究迎來新的時代[6]. 在復雜樣本蛋白質組研究中, 傳統方法需要進行二維分離、分級的方式簡化樣本、充分分離, 這樣不僅操作費力, 也需消耗大量的時間. 而Q-OT-qIT質譜技術使得在60 min左右一維短梯度下實現復雜樣本的深度鑒定成為現實. Q-OT-qIT的三合一結構實現了傳統質譜難以實現的并列運行, 即一級、二級掃描同時進行, 離子注入、選擇、碎裂、檢測同時進行(圖7). 動態掃描管理技術自動控制和實時優化儀器運行, 使3種質量分析器相互配合、同時工作, 盡可能減少掃描過程和循環間隙的等待時間. “減一邏輯”將二級掃描與上一次一級掃描相關聯, 無需等待本次一級掃描確定母離子及電荷, 提高儀器運行速度和分析效率. 以t......閱讀全文
A: 1 μg HeLa結果比較; B: 50 ng HeLa結果比較. 以每項最高值為100%?3 討論 隨著“一小時酵母蛋白質組”全覆蓋的實現, 蛋白質組深度覆蓋研究迎來新的時代[6]. 在復雜樣本蛋白質組研究中, 傳統方法需要進行二維分離、分級的方式簡化樣本、充分分離, 這樣不僅操作費力,
表3 不同的最大注入時間與AGC下HeLa樣本的鑒定結果?圖3 HeLa樣本ATAGDTHLGGEDFDNR肽段二級譜圖和匹配信息 A: 1 μg樣本量, CID碎裂; B: 1 μg樣本量, HCD碎裂; C: 50 ng樣本量, HCD碎裂?圖4 HeLa樣本肽段鑒定結果比較 A: HCD和CI
表1 有效梯度內的采集數據分析??表2 HeLa和酵母樣本全蛋白鑒定結果??2.2 HeLa和酵母蛋白質組快速鑒定結果 數據經SEQUEST HT搜庫和Percolator卡值, 從1 μg和50 ng HeLa樣本中分別鑒定到20860和14100條肽段(q值0.01), 分別對應3865和287
摘要 隨著“一小時酵母蛋白質組”的實現, 短梯度下實現蛋白質組深度覆蓋成為可能。本文利用全新Q-OT-qIT三合一質譜系統進行“一小時蛋白質組”分析與優化。50 min有效梯度, 單次實驗分別從1 μg和50 ng HeLa全蛋白中鑒定到20860和14100條肽段, 對應到3865和287
糖是組成生命體的四大類重要分子之一，糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內，在很多生命過程中起著重要作用，如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時，糖基化修飾在疾病中，特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用，許多疾
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
蛋白質亞細胞定位及其動態變化過程對于蛋白質功能至關重要。隨著鳥槍法蛋白質組學的發展，通過亞細胞分離及質譜技術同時測定數千個蛋白質穩態定位的“蛋白質組學顯微鏡(proteomic microscope)”出現了。然而，表征因擾動導致的亞細胞定位變化的工具卻一直局限在光學顯微鏡，每次僅能成像一個或幾
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者：Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來，質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度，使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面，更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會（ASMS）
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。??島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan speed≤3
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。 島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan s