利用λ噬菌體文庫篩選DNA結合蛋白實驗
試劑、試劑盒 ATP結合緩沖液變性溶液二硫蘇糖醇EDTA乙醇激酶 連接酶緩沖液酚氯仿篩選緩沖液SDS醋酸鈉TET4 噬菌體 DNA 連接酶T4 噬菌體多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非變性聚丙烯酰胺凝膠儀器、耗材 烤盤結晶皿平頭鑷子裝有防水黑墨水注射器硝酸纖維素濾膜Sephadex G-75 離心柱水浴Whatman 3 MM 濾紙實驗步驟 材料緩沖液和溶液貯存液, 緩沖液和試劑的組分請見附錄 1。將貯存液稀釋到適當的濃度。ATP(100 mmol/L)用 25 mmol/L Tris-Cl(pH8.0) 稀釋 100 mml/L 貯存液分別配制 10 mmol/L 和 50 mmol/L 兩種濃度的 ATP 溶液。10X 結合緩沖液250 mmol/LHEPES(pH7.9)30 mmol/LMgCl240 mmol/LKCl含 1 mmol/L 二硫蘇糖醇的 lx 結合緩沖液該溶液用于稀釋完全變性溶液以配制本節......閱讀全文
利用λ噬菌體文庫篩選-DNA-結合蛋白實驗
試劑、試劑盒 ATP結合緩沖液變性溶液二硫蘇糖醇EDTA乙醇激酶 連接酶緩沖液酚氯仿篩選緩沖液SDS醋酸鈉TET4 噬菌體 DNA 連接酶T4 噬菌體多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非變性聚丙烯酰胺凝膠儀器、耗材 烤盤結晶皿平頭鑷子裝有防水黑墨水注射器硝酸纖維素濾膜Sephadex G
利用λ噬菌體文庫篩選-DNA-結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 ATP 結合緩沖液 變性溶液 二硫蘇糖醇 EDTA 乙醇激酶 連接酶緩沖液 酚 氯
利用λ噬菌體文庫篩選-DNA-結合蛋白實驗
可利用合成雙鏈寡核苷酸篩選構建于λ噬菌體的 cDNA 表達文庫,以鑒定與特異 DNA 結合蛋白質相對應的克隆(Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W. 拉塞爾。試劑、試劑盒ATP結合緩沖液變性溶
利用血清篩選噬菌體文庫PCR擴增的模板
[器材和試劑] ●MicroAmp反應管(PerkinElmer) ●洗脫緩沖液(20mmol/LTris—ClpH8.5,2mmol/LEDTA,1%TritonX—100) ●GeneAmp9600PCR儀(PerkinElmer) ●正向引物:5’—AGAGATTA
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。實驗材料 TY試劑、試劑盒 儲存液溶菌酶干粉細菌裂解緩沖液甘油水溶液實驗步驟 一、材料與設備1. 2X TY:16 g 蛋白胨,10 g 酵母提
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。 實驗材料
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料3
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料 3' 引物鏈親和素磁珠儀器、耗材 電泳儀PCR 儀離心機凝膠成像儀
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾膜上,以標記的 RNA 探針進行篩選,最終獲取能與靶 RNA 分子特異性結合
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
實驗方法原理 Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾膜上,以標記的 RNA 探針進行篩選,最終獲取能與靶
篩選構建于λ噬菌體載體的表達文庫實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 封閉緩沖液 氯仿 IPTG 抗原-抗體復合物檢測試劑 SM TNT 緩沖液 洗滌緩沖液 放射
篩選構建于λ噬菌體載體的表達文庫實驗
在典型的免疫篩選實驗中,λ噬菌體表達載體構建的文庫應鋪在不含異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG) 的大腸桿菌菌株的平板上。誘導物的缺少保證了噬菌斑順利形成前不產生對宿主有毒性的融合蛋白,2~4 h 后,將平板從 42°C 移到 37°C 以穩定溫度敏感型的所有融合蛋白。本實驗來源于分子克隆實驗指
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 m
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。實驗材料 mRNA寡核苷酸試劑、
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
試劑、試劑盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 雜交寡核苷酸PCR 正對照PCR 主要混合物蒸餾水儀器、耗材 瓊脂糖凝膠電泳設備實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑蒸餾水2. 酶和酶緩沖液PCR 混合物(可以放在一起冰凍),對于 lml 反應,包括:200nmol 的各種 dNTP;1XVe
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 雜交寡核苷酸 PCR 正對照 PCR 主要混合物 蒸餾水
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
試劑、試劑盒PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸雜交寡核苷酸PCR 正對照PCR 主要混合物蒸餾水儀器、耗材瓊脂糖凝膠電泳設備實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑蒸餾水2. 酶和酶緩沖液PCR 混合物(可以放在一起冰凍),對于 lml 反應,包括:200nmol 的各種 dNTP;1XVent 溶
篩選構建于λ噬菌體載體的表達文庫實驗(一)
試劑、試劑盒 封閉緩沖液氯仿IPTG抗原-抗體復合物檢測試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩沖液放射性碘標記第二抗體第一抗體LB 瓊脂板LB 頂層瓊脂板硝酸纖維素濾膜λ噬菌體表達文庫E.coli儀器、耗材 預設 42°C 的空氣培養箱培養管平頭鑷子裝有防水黑墨水(印度墨水)并帶有 18 號針頭的注射器實驗步
篩選構建于λ噬菌體載體的表達文庫實驗(二)
方法λ噬菌體的平板培養1. 取適當大腸桿菌菌株的單克隆進行接種,按第 2 章方案 1 介紹的方法制備用于鋪平板的培養細菌。2. 假定每個 90 mm 平皿和 150 mm 平皿分別可長出 2X104 個和 5X104 個噬菌斑,計算篩選文庫所需平皿數。對應每個平皿準備一個無菌試管(13 mm
DNA文庫的構建及其篩選
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 高等植物基因組的一個顯著特征是其內含有大量的 DNA 重復序列, 重復序列常位于異染色質區, 因此可能與染色體的結構有關 . 季靜等根據國際上 對基因組、染色體、結構蛋白的研究前沿, 提出染色體 DNA 平均每隔 30 kb
DNA文庫的構建及其篩選
DNA文庫的構建和篩選可以用于:(1)將某生物的全部基因組DNA用限制性內切酶或機械力量切割成一定長度的DNA片段,再與適合的載體在體外重組并轉化相應的宿主細胞獲得的所有陽性菌落。 (2)采用“化整為零”策略,將龐大的基因分解成一段段,每段包含一個或幾個基因。實驗方法原理高等植物基因組的一個顯著特征
DNA文庫的構建及其篩選
實驗材料?DNA試劑、試劑盒?升汞MS培養基瓊脂糖EcoR IHind IIIBamH IBg lII Pst I儀器、耗材?電泳儀尼龍膜實驗步驟 1.水稻 DNA 的提取水稻 DNA 的提取參照 Dellaporta, Wood 和 Hicks (1983) 法分離總基因組DNA并略有修改。 通過
DNA結合蛋白測定實驗
本實驗主要用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白。實驗方法原理本分析方法是一種簡單、快速和極為靈敏的用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白的方法。在電泳時,與末端標記的DNA片段特異結合的蛋白質阻滯了片段的遷移,因而產生對應于蛋白-DNA復合物的清晰電泳條帶。實驗材料質粒DNA試劑、
DNA結合蛋白測定實驗
實驗材料 質粒DNA試劑、試劑盒 dNTPDNA聚合酶Klenow酶TETAE溴化乙錠TEMED過硫酸銨BSA儀器、耗材 培養箱離心管實驗步驟 1. ?用一種或多種限制性內切酶在100 μl 體積中消化10 μg 質粒人,產生25~100 bp ?的含有結合位點的DNA片段,并至少有一端是5’突出的
DNA結合蛋白測定實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本分析方法是一種簡單、快速和極為靈敏的用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白的方法。在電泳時,與末端標記的DNA片段特異結合的蛋白質阻滯了片段的遷移,因而產生對應于蛋白-DNA復合物的清晰電泳條帶。
YAC實驗——YAC文庫篩選
實驗步驟1. ?YAC中心實驗室用于篩選文庫的方法進展很快。2. ?將一塊或多塊微量滴定板微孔中的YAC克隆轉印到尼龍膜上,用單拷貝探針進行雜交,就可以篩選YAC文庫了。3. ?然而,由 于雜交實驗的信噪比較低以及制備所有的轉印尼龍膜所需的花費巨大,絕大多數實驗室已采用PCR方法來篩選文庫。4. ?