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    解析腫瘤HiC多組學研究策略,IF≥10+文章不是夢!

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等數據進行聯合分析,從基因調控網絡和表觀遺傳網絡來闡述生物體性狀形成的相關機制。 今天,小編以一篇經典文獻帶您了解Hi-C技術在疾病發生機制中的應用。 題目:Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells 期刊:Genome Biology 影響因子:......閱讀全文

    解析腫瘤Hi-C多組學研究策略,IF≥10+文章不是夢!

       Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Se

    解析腫瘤Hi-C多組學研究策略

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S

    三維基因組(Hi-C)技術解析

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S

    三維基因組(Hi-C)技術解析

      Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq

    三維基因組(Hi-C)技術解析

      Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq

    僅需10萬個細胞!“升級版”Hi-C技術,大大降低建庫門檻

      作為遺傳物質的載體,染色體在細胞中并不是隨機分布的。近年來,越來越多的研究開始關注染色體的空間結構。大量證據表明,染色體構象與基因表達、DNA復制、DNA損傷修復以及基因組的穩定性密切相關。  Hi-C是近年發展起來的三維基因組學研究利器,由高通量測序技術(High-throughput seq

    Nature Genetics:GWAS和Hi-C技術解密全新癌癥相關基因

      睪丸癌是最常見的年輕男性癌癥。鉑類化療是較為成功的治療手段,但仍有少部分男性對其缺乏反應。一般患者的初次確診年齡在二三十歲,這意味著他們今后的人生不得不忍受長期化療帶來的副作用。  倫敦癌癥研究所(ICR)的科學家們調查了3萬名男性DNA,發現了19種與睪丸癌有關的新基因變異。結合先前鑒定的遺傳

    三次飛躍!半年攻克千個細胞Hi-C建庫大關!

      降低建庫起始量一直都是安諾Hi-C產品的研發重點之一,2019年以來,安諾三維基因組學研發團隊披荊斬棘、堅持不懈,用半年的時間攻克了千個細胞Hi-C建庫大關,實現了降低Hi-C建庫起始量的三次飛躍,成功將Hi-C建庫起始量由500萬個細胞逐漸降低至1千個細胞,率先實現了微量細胞樣本Hi-C建庫的

    北京基因組所--單細胞中識別染色質類染色質拓撲的算法

      基因組DNA和組蛋白以特定的形式高度折疊在細胞核中,這一高級結構即三維基因組學,對細胞核內的諸多生命活動至關重要。基于染色質構象捕獲(3C),尤其是高通量技術(Hi-C,ChIA-PET)的發展推動了三維基因組的研究,發現了包括染色質拓撲相關結構域(TAD),染色質環等一系列層次化的結構特征。近

    兩篇Nature技術文章介紹基因組組織

      【摘要】近期兩項最新的研究報道了染色體構象捕獲領域的技術進展,第一篇文章描述了一種高分辨率4C-seq 新型工作流程和計算通道,第二篇則報告一種新策略,能同時消除Hi-C數據中多個背景來源。   染色體構象捕獲(3C)技術正在改變我們對于基因組空間組織構架的理解。然而目前推測染色質相互作用,卻

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