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  • 解析腫瘤HiC多組學研究策略,IF≥10+文章不是夢!

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等數據進行聯合分析,從基因調控網絡和表觀遺傳網絡來闡述生物體性狀形成的相關機制。 今天,小編以一篇經典文獻帶您了解Hi-C技術在疾病發生機制中的應用。 題目:Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells 期刊:Genome Biology 影響因子:......閱讀全文

    解析腫瘤HiC多組學研究策略,IF≥10+文章不是夢!

       Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Se

    解析腫瘤HiC多組學研究策略

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S

    研究提出單細胞多組學新方法實現胰腺癌循環腫瘤細胞多維度解析

    近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員林達等報道了新開發的單細胞多組學技術——Uni-C。該方法可在一個細胞中同時解析基因組大尺度結構變異(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突變(SNP/INDEL)及染色質三維構象,實現高分辨率、多維度的聯合分析。胰腺癌異質性強、進展迅速,臨床面臨早篩困

    “交換身體”不是夢

    ? 圖片顯示了身體交換實驗的設置 ? 圖片來源:Mattias Karlen “當我還是個孩子的時候,我喜歡想象有一天在別人的身體里醒來會是什么樣子。”瑞典卡羅林斯卡學院博士后研究員Pawel Tacikowski說,“很多孩子可能都有這樣的幻想,我猜自己一直都沒有擺脫它——我只是把它變成了

    驗血測癌不是夢

      一個研究團隊朝癌癥研究領域最熱門的目標之一 ——通過驗血及早發現腫瘤——邁出了重要一步。他們的最新測試分析了血液中同癌癥相關的DNA和蛋白質,并且在檢測腫瘤尚未擴散的1000多位病人所患的8種常見癌癥時獲得陽性結果的概率在70%左右。對于通用的癌癥血液測試來說,這是最好的表現之一。新的血液測試尋

    驗血測癌不是夢

      新的血液測試尋找腫瘤細胞脫落的DNA。圖片來源:Anne Weston/Cancer Research UK/Visuals Unlimited, Inc  一個研究團隊朝癌癥研究領域最熱門的目標之一 ——通過驗血及早發現腫瘤——邁出了重要一步。他們的最新測試分析了血液中同癌癥相關的DNA和蛋白

    中藥多組學研究取得重大突破

      中藥材基因資源是國家戰略資源,其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景,相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上,引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研

    中藥多組學研究取得重大突破

      中藥材基因資源是國家戰略資源,其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景,相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上,引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研

    也許長生不老不是夢!

      加州大學圣地亞哥分校的分子生物學家和生物工程師揭示了衰老之謎背后的關鍵機制:他們分離了細胞在衰老過程中的兩種不同途徑,并設計了一種新的方式對這些過程進行基因編程以延長壽命。圖片來源于網絡  這一研究成果7月17日公布在Science雜志上。  我們人類的壽命取決于單個細胞的衰老。為了了解不同的細

    未來-心臟再生或不是夢!

      【1】eLife:心肌細胞為何不能再生?  DOI: 10.7554/eLife.05563  人類和其他所有哺乳動物在出生后不久,大部分心肌細胞復制能力就消失。這個過程是如何發生以及是否能夠恢復這種能力甚至再生心肌細胞,這些問題的解答都仍然未知。最近發表在eLife上的一篇研究中,德國的一群科

    Science新文章:解析腫瘤的復雜異質性

      來自Broad研究所和麻省總醫院(MGH)的科學家們完成了一項開創先河的研究,描繪出了來自患者的膠質母細胞瘤內部的細胞多樣性特征。這項研究檢測了來自患者腫瘤的單個細胞中成千上萬基因的表達,揭示出每個腫瘤的細胞組成比以往預測的更具有異質性。這些在線發表在《科學》(Science)雜志上的研究結果,

    -NIBS董夢秋研究組-解析衰老機制

      北京生命科學研究所董夢秋研究組致力于衰老過程及其調控機制等方面的研究(專訪董夢秋:學科交融,思想交融的結晶),近期其研究組與其他研究組合作接連發表文章,分別解析了秀麗線蟲衰老有關的兩個蛋白:PUD-1 和 PUD-2的生物學功能,以及鈣離子/鈣調素依賴性蛋白激酶II(CAMKII)和蛋白磷酸

    植物多組學比較和進化研究平臺發布

    近日,西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺,相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎,而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用,在

    三維基因組(HiC)技術解析

      Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq

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    三維基因組(HiC)技術解析

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    穿上外骨骼,擺脫輪椅不是夢

      過去,很多人一癱瘓就要一輩子依靠輪椅。外骨骼的出現,改變了重癥肢體殘障人士幾乎無法行走的困境。當人體骨骼、肌肉的功能缺失時,外骨骼提供了如骨骼一樣的支撐、像肌肉一樣的驅動源。  近日,借助自研的人體外骨骼,身患脆骨癥的“扭扭車男孩”張亮第一次站起來了!他走了16米,花了大約5分鐘。“視角變高帶來

    Nature:擺脫過敏,或不是夢

      來自美國斯坦福大學醫學院和瑞士伯爾尼大學的研究人員在新研究中證實一種人造分子可破壞引起過敏性反應的復合物,并揭示了相關機制,這一研究發現有可能導致開發出針對許多急性過敏性反應高效、快速的干預治療。這一研究在線發表在10月28日的《自然》(Nature)雜志上。   新的抑制劑通過分離急性過敏的

    華裔研究組最新文章解析哮喘

      來自馬里蘭大學馬里蘭病原體研究所等處的研究人員發表了題為“Inhibition of CD23-mediated IgE transcytosis suppresses the initiation and development of allergic airway inflammation”

    多組學研究助力玉米種質資源創新利用

    近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯

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      近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。   農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯分析(GWAS)是通過推斷

    我國科學家利用多組學解析小麥穗器官發育調控網絡

    近日,中國科學院植物研究所研究員郭自峰團隊與合作者,通過多組學整合系統揭示了小麥穗器官發育的關鍵遺傳與代謝調控網絡。相關研究成果發表于《植物細胞》(Plant Cell)。小麥穗部的發育是決定籽粒大小和數目等產量性狀,其發育調控機制涉及復雜的遺傳與代謝過程。長期以來,穗發育過程中基因表達動態、代謝變

    復旦大學等處發表Nature文章-解析肝癌蛋白質組學研究

      肝癌是全世界造成癌癥死亡的第三大殺手,更是有中國特色的一種癌癥。誘發肝癌的因素很多,包括病毒、環境和遺傳因素的共同作用。在我國,肝癌發生的最大危險因素之一是乙肝病毒感染。  來自復旦大學附屬中山醫院,軍事醫學科學院的研究人員發表了題為“Proteomics identifies new ther

    北大教授最新文章解析癌癥表觀遺傳學

      來自北京市腫瘤防治研究所,北京大學腫瘤醫院病因研究室的研究人員在之前研究的基礎上,展開了胃癌發生發展相關DNA甲基化組掃描,進行了所獲90余個基因的DHPLC大規模研究,在中日韓三國驗證隊列中證明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等惡性腫瘤的轉移標志物。就此

    8周“年輕”3歲的不是夢!

      近期,一項發表在抗衰老研究領域知名期刊Aging的隨機對照研究表明,通過平衡DNA甲基化,特定的飲食和生活方式干預可能逆轉健康成年男性的表觀遺傳衰老,8周內受試者的生物學年齡年輕了3歲以上。  圖片來源:Aging官網  該研究由美國功能醫學研究所(The Institute for Funct

    Google高管:活到500歲不是夢

      風投機構Google Ventures一直投資諸如Ube和Nest之類的高科技公司,但占其投資比例最大的是科學,尤其是腫瘤學。Google Ventures的合伙人兼總裁Bill   Maris在接受彭博社的采訪時說到:“如果你今天問我,人類是否有可能活到500歲?我的答案是Yes。”  

    地質氫:未來的綠能不是夢

    提取地下氫氣用作清潔燃料,這一嘗試得到了美國能源部的大力推動,能源部下屬高級能源研究計劃署(ARPA-E)9月初宣布,將提供2000萬美元資金用于推進地下礦物生產氫(所謂“地質氫”)的技術。  英國《新科學家》雜志網站在近日的報道中指出,短短一年時間,地質氫從科學邊緣走到清潔能源的舞臺中央,引發了不

    王如松院士:“馴服”垃圾不是夢

      “垃圾不是洪水猛獸,‘馴服’好了,它能乖乖地為人類服務!”   日前,在接受《中國科學報》記者采訪時,中國工程院院士、中國科學院生態環境研究中心研究員王如松如是表示。   那么該如何“馴服”垃圾呢?王如松提出了生活垃圾處理的“五化”生態工程,即減量化、無害化、資源化、產業化和社

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