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  • 解析腫瘤HiC多組學研究策略

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等數據進行聯合分析,從基因調控網絡和表觀遺傳網絡來闡述生物體性狀形成的相關機制。今天,小編以一篇經典文獻帶您了解Hi-C技術在疾病發生機制中的應用。 題目:Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells期刊:Genome Biology影響因子:11.908研究目的......閱讀全文

    解析腫瘤HiC多組學研究策略

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S

    解析腫瘤HiC多組學研究策略,IF≥10+文章不是夢!

       Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Se

    中藥多組學研究取得重大突破

      中藥材基因資源是國家戰略資源,其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景,相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上,引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研

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    植物多組學比較和進化研究平臺發布

    近日,西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺,相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎,而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用,在

    多組學研究助力玉米種質資源創新利用

    近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯

    多組學研究助力玉米種質資源創新利用

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      近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。   農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯分析(GWAS)是通過推斷

    三維基因組(HiC)技術解析

      Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq

    三維基因組(HiC)技術解析

      Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq

    三維基因組(HiC)技術解析

    Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S

    研究人員建立衰老生物學多組學數據庫

      隨著人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是亟待解決的社會問題和科學問題。近年來,隨著衰老相關研究成果的不斷增多和高通量測序技術的日益發展,衰老相關多組學數據層出疊見。然而,目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。  中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,與北京基因組研究所(

    布魯克質譜:拓展多組學研究邊界-推動臨床轉化

      --布魯克中國區經理何磊先生專訪  分析測試百科網訊,自2017年推出timsTOF以來,布魯克每年都在為科學家們帶來創新的產品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和單細胞蛋白質組研究平臺timsTOF SCP。布魯克質譜中國區業務快速增長,不僅來源于創新的產品,也同中國團隊的努力

    帶你解析腫瘤預后模型研究套路

        研究背景  頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC)是全球人類第六大最常見的惡性腫瘤,超過50%的HNSCC確診患者處于晚期。免疫系統的失衡在以免疫抑制性疾病為特征的HNSCC的發展中起著至關重要的作用。因此,應進一步探索腫瘤免疫微環境(TIME)的調節機制,以確定可精確預測預后及優化免疫療法的有效生

    研究團隊部合作建立衰老生物學多組學數據庫

      隨全球人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題.近年來,隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發展,衰老相關多組學數據逐漸增多.然而目前,尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫.  中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員鮑一明研

    如何選擇技術方法來進行單細胞多組學研究

    現階段,科學家們已經開始以單細胞分辨率組合多層信息。這些“多組學”技術可以更仔細地觀察細胞之間的可變性,更清楚地識別特定細胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細胞基因組,甲基化組織或染色質,而分析RNA和蛋白質則能分別產生轉錄組和蛋白質組數據。如何做出選擇有了這么多種的檢測方法可供選擇,研究人員還需

    帕金森病食蟹猴多組學研究獲重要進展

    廣東省科學院動物研究所研究員饒軍華團隊與江南大學教授陳建歡團隊及其合作者,在國家自然科學基金、廣東省非人靈長類研究重點實驗室等項目的資助下,開展的帕金森病食蟹猴多組學研究取得重要進展。相關成果近日在線發表于《npj 生物膜和微生物組》(npj Biofilms and Microbiomes)。帕金

    蛋白質組組學研究的基本策略

    蛋白質組 蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組(genOME),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(PROTein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,并且,同一

    著名癌研究學者PNAS解析腫瘤轉移

      來自美國哈佛大學醫學院和麻省總醫院的研究人員發現聯合使用3種靶向抗癌藥物,能推遲HER2陽性乳腺癌腦轉移,這不僅有助于臨床上開發針對HER2陽性乳腺癌的新型治療方法,也對于進一步解析乳腺癌腦轉移作用機制具有重要意義。相關研究成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。   領導這一研究

    代謝組學——腫瘤研究的利器

      細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,代謝物更多地反映了細胞所處的環境,比如細胞現在是不是健康?藥物是否起效?環境污染物是不是正在傷害細胞?等等。由此,20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什么?  1、腫瘤與代謝組學  腫瘤

    蛋白質組學研究的策略和范圍

    蛋白質組學一經出現,就有兩種研究策略。一種可稱為“竭澤法”,即采用高通量的蛋白質組研究技術分析生物體內盡可能多乃至接近所有的蛋白質,這種觀點從大規模、系統性的角度來看待蛋白質組學,也更符合蛋白質組學的本質。但是,由于蛋白質表達隨空間和時間不斷變化,要分析生物體內所有的蛋白質是一個難以實現的目標。另一

    骨組織學研究解密水龍獸生存策略

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454791.shtm 新疆水龍獸的骨組織顯微結構 近日,中國地質大學(武漢)副教授韓鳳祿與中國科學院古脊椎動物與古人類研究所研究員劉俊、副研究員趙祺合作完成了對新疆地區水龍獸骨組織學的初步研

    ACS-Central-Sci:研究開發腫瘤靶向治療新策略

      在殺死腫瘤細胞的同時保留正常細胞是癌癥化療的核心挑戰。現在,研究人員已經制造出一種水凝膠,當注射到小鼠腫瘤附近時,可以招募藥物來縮小腫瘤,副作用也更少。他們將研究結果發表在ACS Central Science。圖片來源:ACS Central Science  科學家們試圖通過將抗體附著在癌細

    僅需10萬個細胞!“升級版”HiC技術,大大降低建庫門檻

      作為遺傳物質的載體,染色體在細胞中并不是隨機分布的。近年來,越來越多的研究開始關注染色體的空間結構。大量證據表明,染色體構象與基因表達、DNA復制、DNA損傷修復以及基因組的穩定性密切相關。  Hi-C是近年發展起來的三維基因組學研究利器,由高通量測序技術(High-throughput seq

    精準醫療大會—聚焦大隊列、大數據、多組學技術研究突破

      導讀:2018年12月1-2日,北京朗麗茲西山花園酒店,P4 China 第三屆國際精準醫療大會將隆重召開!有美中院士領銜的主旨論壇+隊列與多組學轉化研究論壇+腫瘤精準診斷與用藥研究論壇+精準醫療產業技術開發論壇四大細分論壇分別圍繞科研轉化、應用探索及技術開發進行深入分享與探討。  屆時Illu

    全球最大規模結直腸癌多組學研究成果發布

    腸癌多組學研究成果發布?結直腸癌被稱為“沉默殺手”,全球每年結直腸癌新增病例約190萬例,發病率居所有癌癥第三位。更可怕的是,約20%的患者在確診時已發生轉移,其死亡率更是高居各類癌癥第二位。面對這一嚴重威脅人類生命健康的重大疾病,科學界近期傳來好消息——8月7日,中國科學院杭州醫學研究所組學與智慧

    全球最大規模結直腸癌多組學研究成果發布

      結直腸癌被稱為“沉默殺手”,全球每年結直腸癌新增病例約190萬例,發病率居所有癌癥第三位。更可怕的是,約20%的患者在確診時已發生轉移,其死亡率更是高居各類癌癥第二位。  面對這一嚴重威脅人類生命健康的重大疾病,科學界近期傳來好消息——8月7日,中國科學院杭州醫學研究所組學與智慧醫療中心聯合瑞典

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      結直腸癌被稱為“沉默殺手”,全球每年結直腸癌新增病例約190萬例,發病率居所有癌癥第三位。更可怕的是,約20%的患者在確診時已發生轉移,其死亡率更是高居各類癌癥第二位。  面對這一嚴重威脅人類生命健康的重大疾病,科學界近期傳來好消息——8月7日,中國科學院杭州醫學研究所組學與智慧醫療中心聯合瑞典

    新策略助力烯烴不對稱多組分偶聯反應

    華東理工大學化學與分子工程學院、費林加諾貝爾獎科學家聯合研究中心教授陳宜峰課題組在烯烴的不對稱多組分偶聯反應方面取得新進展。相關研究在線發表于《美國化學會志》。近年來,過渡金屬催化的不對稱偶聯反應已經成為了構建各類Csp3立體中心最為直接有效的策略之一,并被廣泛用于天然產物和藥物分子的合成中。然而,

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