增加RTPCR特異性的辦法(提高逆轉錄保溫溫度和減少基...
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位點的RNA模板獲得cDNA。為了獲得最長的cDNA,需要按經驗確定每個RNA樣品中引物與RNA的比例。隨機引物的起始濃度范圍為50到250ng每20μl反應體系。因為使用隨機引物從總RNA合成的cDNA主要是核糖體RNA,所以模板一般選用 poly(A)+RNA。Oligo(dT)起始比隨機引物特異性高。它同大多數真核細胞mRNA 3'端所發現的poly(A)尾雜交。因為poly(A)+RNA大概占總RNA的1%到2%,所以與使用隨機引物相比,cDNA的數量和復雜度要少得多。因為其較高的特異性,oligo(dT)一般不需要對RNA......閱讀全文
增加RTPCR特異性的辦法(提高逆轉錄保溫溫度和減少基...
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位點的RNA模
增加RTPCR特異性
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位點的RNA模
如何增加RTPCR特異性?
?起始cDNA合成? ? 第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。? ? 隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆
RNA提取與RTPCR(4)
2.8 小量RNA檢測方法的提高 當僅有小量RNA時,RT-PCR尤其具有挑戰性。在RNA分離過程中加入的作為載體的糖元有助于增加小量樣品的產量。可以在加入Trizol的同時加入無RNase的糖元。糖元是水溶性的,可以同RNA保持在水相中以輔助隨后的沉淀。對于小于50mg的組織或106個培養細胞
RNA提取與RTPCR(3)
2.3 RT-PCR的引物設計 RT-PCR引物設計和一般PCR引物設計可以遵循同樣的原則。細心地進行引物設計是PCR中最重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。設計理想的引物都有以下共同的特點,而設計失敗的引物則各有各的缺
增加RTPCR靈敏度
分離高質量RNA成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到cDNA上的序列信息量的最大值。一般的RNA純化方法是使用異硫氰酸胍/酸性酚的一步法。Trizol試劑法(見下圖)將一步法加以提高,可以從多種
提高RTPCR特異性的方法總結
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法,各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。????? 隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火,產生短的,部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位
RTPCR實驗操作的注意事項
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是
RNA提取和RTPCR
真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA?PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟的mRNA
RNA提取與RTPCR
1.RNA的提取 RNA的提取其實原理很簡單:通過變性劑破碎細胞或者組織,然后經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉淀,洗滌,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。 1.1分離高質量RNA 成功的cDNA合成來
RTPCR常見問題分析及其解決方案
常見問題可能原因建議解決方案少量或沒有RT-PCR產物RNA被降解分離無污染,高質量的RNA;提取RNA的材料要盡量新鮮,防止RNA降解;RT反應前,在變性膠上分析RNA的完整性;RNA提取后,應儲存在100%甲酰胺中, 如果使用RNase抑制劑,加熱時小于45℃;pH小于8.0,否則抑制劑會釋放所
逆轉錄RTPCR常見問題分析
RT-PCR常見問題(一)RT-PCR靈敏度:在瓊脂糖凝膠分析中看到少量或沒有RT-PCR產物。可能原因解決方案RNA被降解在用來驗證完整性之前先在變性膠上分析RNA。使用良好的無污染技術分離RNA。在將組織從動物體取出后立刻處理。RNA中包含逆轉錄抑制劑通過乙醇沉淀RNA除去抑制劑。用70%(體積
逆轉錄PCR(RTPCR)
實驗四 逆轉錄PCR?(RT-PCR?)【實驗目的】1.了解用逆轉錄PCR?法獲取目的基因的原理。2.學習和掌握逆轉錄PCR?的技術和方法。【實驗原理】聚合酶鏈式反應(PCR)過程利用模板變性,引物退火和引物延伸的多個循環來擴增DNA序列。因為上一輪的擴增產物又作為下一輪擴增的模板,是一個指數增長的
如何提高RTPCR反應體系的靈敏度
如何提高RT-PCR反應體系的靈敏度:1、分離高質量RNA成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑如EDTA或SDS等,以及盡可能減少基因組DNA污染。RNA的質量決定了你能夠轉錄到cDNA上的序列信息量的大值。2、使用無RNaseH活性的逆轉錄酶在逆轉
RTPCR成功的幾個要素
1、高質量RNA成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)選擇性分離 poly(A)+RNA。不管起始模板是總RNA還是poly(A)
聚氨酯保溫管保溫常規溫度
聚氨酯保溫管保溫常規溫度聚氨酯保溫管概述:聚氨酯保溫管能在0.6-1.2米凍土層內直埋(所以人們習慣稱它為直埋式保溫管或是預制保溫管),熱損失比普通的管道可降低40%以上,工作使用壽命比其它絕熱防腐材料提高3-5倍以上,壽命可以達到30-50年;質量均符合或高于中國行業標準。其完善的保溫系統,具有工
聚氨酯保溫管保溫常規溫度
聚氨酯保溫管保溫常規溫度 聚氨酯保溫管概述:聚氨酯保溫管能在0.6-1.2米凍土層內直埋(所以人們習慣稱它為直埋式保溫管或是預制保溫管),熱損失比普通的管道可降低40%以上,工作使用壽命比其它絕熱防腐材料提高3-5倍以上,壽命可以達到30-50年;質量均符合或高于中國行業標準。其完善的保
聚氨酯保溫管保溫常規溫度
聚氨酯保溫管概述:聚氨酯保溫管能在0.6-1.2米凍土層內直埋(所以人們習慣稱它為直埋式保溫管或是預制保溫管),熱損失比普通的管道可降低40%以上,工作使用壽命比其它絕熱防腐材料提高3-5倍以上,壽命可以達到30-50年;質量均符合或高于中國行業標準。其完善的保溫系統,具有工程整體造價低、工期短、壽
RT-PCR技術及RNA提取策略3
成功的RT PCR的要素1、高質量RNA 成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)選擇性分離poly(A)+RNA。不管起始模
提高RTPCR的靈敏度和產物長度
RT-PCR 已經成為研究者確定感興趣的器官、組織或細胞中mRNA 轉錄本出現、結構和表達水平的基本方法。RT-PCR的基本步驟包括:首先對樣品中出現的所有mRNA 合成一個cDNA拷貝,接著擴增感興趣的基因。因為兩個步驟中使用的反應緩沖液不能兼容,所以這兩個步驟(RT 和PCR)通常分別進行。即使
RT-PCR反應原理
RT- PCR反應原理從細胞或特定組織中提取總RNA。逆轉錄實驗。擴增內參和目的基因并比較基因表達差異。RT-PCR反應受多個因素影響,如硫酸鎂的濃度, 引物退火的溫度,擴增的循環數等。? ◇建議選擇0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸鎂作初步實驗。? ◇對于具有較高Tm的引物,增加
增加PCR特異性
引物設計 ?細心地進行引物設計是PCR中zui重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。下面的指導描述了一個可以增加特異性的引物所具有的令人滿意的特點:??1.典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長,保證序列獨特性,并降低序
增加PCR特異性
增加PCR特異性(一)引物設計細心地進行引物設計是PCR中最重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。下面的指導描述了一個可以增加特異性的引物所具有的令人滿意的特點:1.典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長,保證序列獨特性
分子生物學相關實驗步驟及注意事項(二)——反轉錄篇
——反轉錄篇——反轉錄PCR(Reverse Transcription, RT-PCR)又稱為逆轉錄PCR,是指擴增mRNA的一種實驗技術。先將mRNA反轉錄成cDNA,然后再以cDNA為模板,用PCR方法加以擴增。(一)逆轉錄酶的種類AMV:有較強的聚合酶活性和RNA酶H活性。最適42℃。在高反
PCR儀常見問題及回答
1. cDNA產量的很低可能的原因:*RNA模板質量低*對mRNA濃度估計過高*反應體系中存在反轉錄酶抑制劑或反轉錄酶量不足*同位素磷32過期*反應體積過大,不應超過50μl2. 擴增產物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺*zui常見的原因在于您的反應體系是PCR的反應體系而不是RT-PCR的反應體系*
PCR儀常見問題及回答
PCR儀常見問題及回答1. cDNA產量的很低可能的原因:*RNA模板質量低*對mRNA濃度估計過高*反應體系中存在反轉錄酶抑制劑或反轉錄酶量不足*同位素磷32過期*反應體積過大,不應超過50μl2. 擴增產物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺*zui常見的原因在于您的反應體系是PCR的反應體系而不是R
PCR儀常見問題及回答
1. cDNA產量的很低可能的原因:*RNA模板質量低*對mRNA濃度估計過高*反應體系中存在反轉錄酶抑制劑或反轉錄酶量不足*同位素磷32過期*反應體積過大,不應超過50μl2. 擴增產物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺*最常見的原因在于您的反應體系是PCR的反應體系而不是RT-PCR的反應體系*與反
PCR實驗操作常見問題及解決方法
1. cDNA產量的很低可能的原因:*RNA模板質量低*對mRNA濃度估計過高*反應體系中存在反轉錄酶抑制劑或反轉錄酶量不足*同位素磷32過期*反應體積過大,不應超過50μl2. 擴增產物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺*最常見的原因在于您的反應體系是PCR的反應體系而不是RT-PCR的反應體系*與反
逆轉錄PCR(RTPCR)擴增基因特異片段
逆轉錄PCR(RT-PCR)擴增基因特異片段 一、實驗原理RT-PCR是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用從RNA合成?cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平,細胞中R
逆轉錄RTPCR實驗儀器及條件
實驗器具的準備:RT-PCR所用的500μl和200μl薄壁EP管、移液器吸嘴最好用進口的,因為進口EP管、移液器吸嘴已經去除了RNasin,也已經滅菌處理過,可以直接用。實驗前用干凈的鑷子夾取出EP管、移液器吸嘴插好備用,注意鑷子不要碰到EP管內壁和吸嘴的尖部。如果用國產500μl和200μlEP