基因告訴你,瘟疫來自哪里
上個月底世界衛生組織發出全球警告:一位卡塔爾人感染了新的冠狀病毒。由于感冒和SARS病原都屬于冠狀病毒的家族,這個消息讓各國感到緊張。 英國研究者從患者身上取出病毒,對比今年較早前一位沙特阿拉伯死者體內的病毒:兩者有99.5%相似。研究者由此猜測,患者是在沙特感染。的確,這位卡塔爾人幾個月前去沙特旅游過。 “現在的高通量核酸測序技術,能以非常低的價格大量測定基因組。這就給傳染病研究者提供了機會。”在10月13日召開的中國科協“新觀點、新學說”學術沙龍上,軍事醫學科學院研究員楊瑞馥說,“面臨新發、突發傳染病。只要準確溯源,就可以切斷傳染病的源頭。” 科學家溯源,靠的是比對各病原樣本的DNA:就像子女跟父母略有不同,病原在進化中會增加變異。兩個樣本的變異特征越相近,就說明親緣越近。 “2009年青海有一次肺鼠疫的暴發。我們經過全基因組序列的分析,得出結論:這次暴發是由一只牧羊犬導致的。”楊瑞馥說,“這就給......閱讀全文
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同,海馬呈現高度特殊的形態,例如頭部前方具有管狀長嘴,無腹鰭和尾鰭,尾端卷曲,全身覆蓋硬骨骼,沒有鱗片
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA,解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本,不會造成偏差,擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
NIH 2500萬資助Venter傳染病基因組研究
??????? 近日,美國國家衛生研究院(National Institutes of Health)授予美國克雷格·文特爾研究所(J.Craig Venter Institute)2500萬美元,以支持傳染性疾病(瘧疾和流感)的基因研究,旨在基因水平尋找到更好的治療方法和預防措施。 研究所的發言
多國實施全基因組分析計劃
由于基因測序可以探查與特定疾病相關的基因,該療法正在成為日益受歡迎的診斷方法。 英國計劃到2017年對10萬人進行基因組測序。 美國加州一對龍鳳胎出生后,他們的父母非常憂慮:兩個嬰兒不僅發育緩慢,而且肌肉松軟無力。大腦掃描結果顯示,男嬰或存在大腦性麻痹;然而醫生對造成女嬰震顫和癲癇
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果,全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導,對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征,但無法通過之前的篩查檢測來解
全血基因組提取操作步驟
操作步驟((200ul全血))* 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇! 1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液,放入1.5ml離心管。對如果全血起始量小于200μl,則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間,則后續操作需要按照比例增
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序(WGS)是下一代測序技術,用于快速,低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大,解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊,數據處理、檢測變異和綜合分析,具體如下圖所示:由于WGS現在已經非常成熟了,